因果推断2--深度模型介绍(个人笔记)

news2024/11/24 15:31:21

目录

一、方法介绍

1.1TarNet

1.1.1TarNet

1.1.2网络结构

1.1.3counterfactual loss

1.1.4代码实现

1.2Dragonet

1.3DRNet

1.4VCNet

VCNET AND FUNCTIONAL TARGETED REGULARIZATION FOR LEARNING CAUSAL EFFECTS OF CONTINUOUS TREATMENTS

二、待补充


一、方法介绍

1.1TarNet

1.1.1TarNet

        S-Learner和T-Learner都不太好,因为S-Learner是把T和W一起训练,在高维情况下很容易忽视T的影响(too much bias),而T-Learner是各自对T=0和T=1训练两个独立的模型,这样会造成过高的方差(too much variance),与因果关系不大。TARNet是对所有数据进行训练,但是在后面分成了两个branch。

本质:多任务学习。

多个treatment分别建模

1.1.2网络结构

我们关注的是这样一种情况:因果关系很简单,已知为(Y1, Y0) ⊥x | t,,没有隐藏的混杂因素。在我们假设的因果模型下,最常见的目标是因果效应推理所使用的应用科学是求得平均处理效果:

我们的结果的一个观点是,当使用协变量调整来估计ITE时,我们指出了一个以前未被解释的方差来源。我们提出了一种新型的正则化,通过学习表示,减少了被处理和对照之间的IPM距离,实现了一种新型的偏差-方差权衡。

考虑到我们的observational的训练样本可能存在针对t的imbalance(t和x不独立)的情况,举个例子:我们想要知道一个药对某个病的作用,由于这个药比较贵,我们采集到的样本用这个药的大部分人是富人,不用这个药的大部分人是穷人,如果说富和穷是X的一个特征,用不用药是t,这个时候如果拟合出来的h1和h0就不准了,特别是h1对穷人,h0对富人都不准。什么时候准呢?当样本来自于随机试验的时候才准,但是我们现在又只有observational data,没办法做试验,所以我们只能对样本的分布进行一个调整。


另一种广泛应用于因果推理的统计方法是加权法。逆向倾向评分加权(Austin, 2011)等方法重新加权观察数据中的单位,以使处理人群和对照组人群更具可比性,并已用于估计条件效应(Cole et al., 2003)。主要的挑战,特别是在高维情况下,是控制估计的方差(Swaminathan & Joachims, 2015)。双稳健方法更进一步,结合倾向评分重加权和c中的协变量调整。

我们的工作与上述所有工作的不同之处在于,我们关注的是估计个体治疗效果的泛化误差方面,而不是渐近一致性,并且我们只关注观察性研究案例,没有随机成分或工具变量。

特别是,估计ITE需要预测与观测到的分布不同的结果。我们的ITE误差上界与bdavidet al.(2007)给出的领域适应的泛化界有相似之处;Mansour et al. (2009);Ben-David等人(2010);Cortes & Mohri(2014)。这些边界采用分布距离度量,如a距离或差异度量,这与我们使用的IPM距离有关。我们的算法类似于Ganin等人(2016)最近提出的领域自适应算法,原则上也类似于其他领域自适应方法(例如Daum ' e III (2007);Pan et al. (2011);Sun et al.(2016))可以适用于这里提出的ITE估计。

在本文中,我们专注于一个相关但更实质性的任务:估计个人治疗效果,建立在反事实错误项。我们提供了关于表示的绝对质量的信息约束。我们还推导了一个更灵活的算法家族,包括非线性假设和ipm形式的更强大的分布度量,如Wasserstein和MMD距离。最后,我们进行了更彻底的实验,包括真实世界的数据集和样本外性能,并表明我们的方法优于先前提出的方法。

1.1.3counterfactual loss

第一项wi的作用:对于treatment group和control group的样本数量不平均的情况做一个修正,使得他们在损失函数中的权重平衡。

第二项是模型复杂度的一个正则惩罚

第三项就是刚刚提到的对representation imbalance的一个修正。其中α用来控制这个修正的力度。当α>0时,这个模型就叫做CFR (Conterfactual Regression),当α=0时,则叫做TARNet (Treatment-Agnostic Representation Network)。实际上效果论文里是CFR好一些。
 

1.1.4代码实现

import tensorflow as tf

from ..layers.gather import Gather_Streams
from ..layers.split import Split_Streams
from ..layers.MLP import MLP
from pickle import load

from typing import Any


class TARNet(tf.keras.Model):
    """Return a tarnet sub KERAS API model."""

    def __init__(
        self,
        normalizer_layer: tf.keras.layers.Layer = None,
        n_treatments: int = 2,
        output_dim: int = 1,
        phi_layers: int = 2,
        units:int = 20,
        y_layers: int = 3,
        activation: str = "relu",
        reg_l2: float = 0.0,
        treatment_as_input: bool = False,
        scaler: Any = None,
        output_bias: float = None,
    ):
        """Initialize the layers used by the model.
        Args:
            normalizer_layer (tf.keras.layer, optional): _description_. Defaults to None.
            n_treatments (int, optional): _description_. Defaults to 2.
            output_dim (int, optional): _description_. Defaults to 1.
            phi_layers (int, optional): _description_. Defaults to 2.
            y_layers (int, optional): _description_. Defaults to 3.
            activation (str, optional): _description_. Defaults to "relu".
            reg_l2 (float, optional): _description_. Defaults to 0.0.
        """
        super(TARNet, self).__init__()
        # uniform quantile transform for treatment
        self.scaler = scaler if scaler else load(open("scaler.pkl", "rb"))

        # input normalization layer
        self.normalizer_layer = normalizer_layer
        self.phi = MLP(
            units=units,
            activation=activation,
            name="phi",
            num_layers=phi_layers,
        )

        self.splitter = Split_Streams()

        self.y_hiddens = [
            MLP(
                units=units,
                activation=activation,
                name=f"y_{k}",
                num_layers=y_layers,
            )
            for k in range(n_treatments)
        ]

        # add linear function to cover the normalized output
        self.y_outputs = [
            tf.keras.layers.Dense(
                output_dim,
                activation="sigmoid",
                bias_initializer=output_bias,
                name=f"top_{k}",
            )
            for k in range(n_treatments)
        ]

        self.n_treatments = n_treatments

        self.output_ = Gather_Streams()

    def call(self, x):

        cofeatures_input, treatment_input = x
        treatment_cat = tf.cast(treatment_input, tf.int32)

        if self.normalizer_layer:
            cofeatures_input = self.normalizer_layer(cofeatures_input)
        x_flux = self.phi(cofeatures_input)

        streams = [
            self.splitter([x_flux, treatment_cat, tf.cast(indice_treatment, tf.int32)])
            for indice_treatment in range(len(self.y_hiddens))
        ]
        # xstream is a list of tuple, containing the gathered and indice position, let's unpack them
        x_streams, indice_streams = zip(*streams)
        # tf.print(indice_streams, output_stream=sys.stderr)
        x_streams = [
            y_hidden(x_stream) for y_hidden, x_stream in zip(self.y_hiddens, x_streams)
        ]
        x_streams = [
            y_output(x_stream) for y_output, x_stream in zip(self.y_outputs, x_streams)
        ]

        return self.output_([x_streams, indice_streams])
import tensorflow as tf


class Split_Streams(tf.keras.layers.Layer):
    def __init__(self):
        super(Split_Streams, self).__init__()

    def call(self, inputs):
        x, y, z = inputs

        indice_position = tf.reshape(
            tf.cast(tf.where(tf.equal(tf.reshape(y, (-1,)), z)), tf.int32),
            (-1,),
        )

        return tf.gather(x, indice_position), indice_position

pd.get_dummies相当于onehot编码,常用与把离散的类别信息转化为onehot编码形式。

1.2Dragonet

多个treatment分别建模 

import tensorflow as tf
import keras.backend as K
from keras.engine.topology import Layer
from keras.metrics import binary_accuracy
from keras.layers import Input, Dense, Concatenate, BatchNormalization, Dropout
from keras.models import Model
from keras import regularizers


def binary_classification_loss(concat_true, concat_pred):
    t_true = concat_true[:, 1]
    t_pred = concat_pred[:, 2]
    t_pred = (t_pred + 0.001) / 1.002
    losst = tf.reduce_sum(K.binary_crossentropy(t_true, t_pred))

    return losst


def regression_loss(concat_true, concat_pred):
    y_true = concat_true[:, 0]
    t_true = concat_true[:, 1]

    y0_pred = concat_pred[:, 0]
    y1_pred = concat_pred[:, 1]

    loss0 = tf.reduce_sum((1. - t_true) * tf.square(y_true - y0_pred))
    loss1 = tf.reduce_sum(t_true * tf.square(y_true - y1_pred))

    return loss0 + loss1


def ned_loss(concat_true, concat_pred):
    t_true = concat_true[:, 1]

    t_pred = concat_pred[:, 1]
    return tf.reduce_sum(K.binary_crossentropy(t_true, t_pred))


def dead_loss(concat_true, concat_pred):
    return regression_loss(concat_true, concat_pred)


def dragonnet_loss_binarycross(concat_true, concat_pred):
    return regression_loss(concat_true, concat_pred) + binary_classification_loss(concat_true, concat_pred)


def treatment_accuracy(concat_true, concat_pred):
    t_true = concat_true[:, 1]
    t_pred = concat_pred[:, 2]
    return binary_accuracy(t_true, t_pred)



def track_epsilon(concat_true, concat_pred):
    epsilons = concat_pred[:, 3]
    return tf.abs(tf.reduce_mean(epsilons))


class EpsilonLayer(Layer):

    def __init__(self):
        super(EpsilonLayer, self).__init__()

    def build(self, input_shape):
        # Create a trainable weight variable for this layer.
        self.epsilon = self.add_weight(name='epsilon',
                                       shape=[1, 1],
                                       initializer='RandomNormal',
                                       #  initializer='ones',
                                       trainable=True)
        super(EpsilonLayer, self).build(input_shape)  # Be sure to call this at the end

    def call(self, inputs, **kwargs):
        # import ipdb; ipdb.set_trace()
        return self.epsilon * tf.ones_like(inputs)[:, 0:1]


def make_tarreg_loss(ratio=1., dragonnet_loss=dragonnet_loss_binarycross):
    def tarreg_ATE_unbounded_domain_loss(concat_true, concat_pred):
        vanilla_loss = dragonnet_loss(concat_true, concat_pred)

        y_true = concat_true[:, 0]
        t_true = concat_true[:, 1]

        y0_pred = concat_pred[:, 0]
        y1_pred = concat_pred[:, 1]
        t_pred = concat_pred[:, 2]

        epsilons = concat_pred[:, 3]
        t_pred = (t_pred + 0.01) / 1.02
        # t_pred = tf.clip_by_value(t_pred,0.01, 0.99,name='t_pred')

        y_pred = t_true * y1_pred + (1 - t_true) * y0_pred

        h = t_true / t_pred - (1 - t_true) / (1 - t_pred)

        y_pert = y_pred + epsilons * h
        targeted_regularization = tf.reduce_sum(tf.square(y_true - y_pert))

        # final
        loss = vanilla_loss + ratio * targeted_regularization
        return loss

    return tarreg_ATE_unbounded_domain_loss


def make_dragonnet(input_dim, reg_l2):
    """
    Neural net predictive model. The dragon has three heads.
    :param input_dim:
    :param reg:
    :return:
    """
    t_l1 = 0.
    t_l2 = reg_l2
    inputs = Input(shape=(input_dim,), name='input')

    # representation
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(inputs)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(x)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(x)


    t_predictions = Dense(units=1, activation='sigmoid')(x)

    # HYPOTHESIS
    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(x)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(x)

    # second layer
    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(y0_hidden)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(y1_hidden)

    # third
    y0_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y0_predictions')(
        y0_hidden)
    y1_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y1_predictions')(
        y1_hidden)

    dl = EpsilonLayer()
    epsilons = dl(t_predictions, name='epsilon')
    # logging.info(epsilons)
    concat_pred = Concatenate(1)([y0_predictions, y1_predictions, t_predictions, epsilons])
    model = Model(inputs=inputs, outputs=concat_pred)

    return model


def make_tarnet(input_dim, reg_l2):
    """
    Neural net predictive model. The dragon has three heads.
    :param input_dim:
    :param reg:
    :return:
    """

    inputs = Input(shape=(input_dim,), name='input')

    # representation
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(inputs)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(x)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal')(x)

    t_predictions = Dense(units=1, activation='sigmoid')(inputs)

    # HYPOTHESIS
    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(x)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(x)

    # second layer
    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(y0_hidden)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2))(y1_hidden)

    # third
    y0_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y0_predictions')(
        y0_hidden)
    y1_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y1_predictions')(
        y1_hidden)

    dl = EpsilonLayer()
    epsilons = dl(t_predictions, name='epsilon')
    # logging.info(epsilons)
    concat_pred = Concatenate(1)([y0_predictions, y1_predictions, t_predictions, epsilons])
    model = Model(inputs=inputs, outputs=concat_pred)

    return model


def make_ned(input_dim, reg_l2=0.01):
    """
    Neural net predictive model. The dragon has three heads.
    :param input_dim:
    :param reg:
    :return:
    """

    inputs = Input(shape=(input_dim,), name='input')

    # representation
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal', name='ned_hidden1')(inputs)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal', name='ned_hidden2')(x)
    x = Dense(units=200, activation='elu', kernel_initializer='RandomNormal', name='ned_hidden3')(x)

    t_predictions = Dense(units=1, activation='sigmoid', name='ned_t_activation')(x)
    y_predictions = Dense(units=1, activation=None, name='ned_y_prediction')(x)

    concat_pred = Concatenate(1)([y_predictions, t_predictions])

    model = Model(inputs=inputs, outputs=concat_pred)
    return model


def post_cut(nednet, input_dim, reg_l2=0.01):
    for layer in nednet.layers:
        layer.trainable = False
    nednet.layers.pop()
    nednet.layers.pop()
    nednet.layers.pop()

    frozen = nednet

    x = frozen.layers[-1].output
    frozen.layers[-1].outbound_nodes = []
    input = frozen.input

    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='post_cut_y0_1')(x)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='post_cut_y1_1')(x)

    # second layer
    y0_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='post_cut_y0_2')(
        y0_hidden)
    y1_hidden = Dense(units=100, activation='elu', kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='post_cut_y1_2')(
        y1_hidden)

    # third
    y0_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y0_predictions')(
        y0_hidden)
    y1_predictions = Dense(units=1, activation=None, kernel_regularizer=regularizers.l2(reg_l2), name='y1_predictions')(
        y1_hidden)

    concat_pred = Concatenate(1)([y0_predictions, y1_predictions])

    model = Model(inputs=input, outputs=concat_pred)
    return model

1.3DRNet

Learning Counterfactual Representations for Estimating Individual Dose-Response Curves

1.4VCNet

VCNET AND FUNCTIONAL TARGETED REGULARIZATION FOR LEARNING CAUSAL EFFECTS OF CONTINUOUS TREATMENTS

处理连续的treatment

本文基于varying coefficient model,让treatment对应的branch成为treatment的函数,而不需要单独设计branch,达到真正的连续性。除此之外,本文也沿用了《Adapting Neural Networks for the Estimation of Treatment Effects》一文中的思路,训练一个分类器来抽取协变量中与T最相关的部分变量。
 

参考:

  1. [Dragonet] Adapting Neural Network for the Estimation of Treatment Effects - 知乎
  2. BradyNeal因果推断课程笔记8-经典模型框架DML、S-learner、T-learner、X-learner、TARNet
  3. 《因果推理导论》课程(2020) by Brady Neal_哔哩哔哩_bilibili
  4. Shi, Claudia, David Blei, and Victor Veitch. "Adapting neural networks for the estimation of treatment effects." Advances in neural information processing systems 32 (2019).

  5. Shalit, Uri, Fredrik D. Johansson, and David Sontag. "Estimating individual treatment effect: generalization bounds and algorithms." International Conference on Machine Learning. PMLR, 2017.

  6. 详解“因果效应估计”_AI_盲的博客-CSDN博客_连续型干预因果效应估计

  7. Search :: Anaconda.org

  8. dragonnet/models.py at master · claudiashi57/dragonnet · GitHub

  9. PackagesNotFoundError: The following packages are not available from current channels的解决办法_正在学习的黄老师的博客-CSDN博客_packagesnotfounderror

  10. DRNet:Learning Counterfactual Representations for Estimating Individual Dose-Response Curves

二、待补充

  1. 论文精读:DRNet、VCNet
  2. 相关代码细节
  3. 工业应用实例

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一、实验题目 实验一 Apriori算法设计与应用 二、背景介绍 Apriori算法是一种挖掘关联规则的频繁项集算法,其核心思想是通过候选集生成和向下封闭检测两个阶段来挖掘频繁项集。 三、实验内容 1.3.1 运用的理论知识 关联规则挖掘是数据挖掘中最活跃的研究方法之…

数控恒流源电路简单讲解

(1)最近课设是做一个可步进的恒流源,所以查查找了很多资料之后。说一下自己对于恒流源电路的简单理解。 (2)我只是会将怎么使用和调整数据进行讲解,至于为什么这样只会讲我懂的部分。本人知道的也不是很多&…

【RPA前置知识】 整理并总结ForEach Activity类

🐋作者简介:博主是一位.Net开发者,同时也是RPA和低代码平台的践行者。 🐬个人主页:会敲键盘的肘子 🐰系列专栏:.Net实用方法总结 🦀专栏简介:本专栏介绍如何编写 Windows…

Biopython教程

Biopython教程 参考: https://biopython-cn.readthedocs.io/zh_CN/latest/index.html 蛋白质文件获取 Entrez方法 from Bio import Entrez Entrez.email邮箱名 #如123456789qq.com handleEntrez.esearch(dbprotein,term2rbg) recordEntrez.read(handle) idrecor…

C++PrimerPlus 第八章 函数探幽-8.2 引用变量

目录 8.2 引用变量 8.2.1 创建引用变量 8.2.2 将引用用作函数参数 8.2.3 引用的属性和特别之处 8.2.3.1 临时变量、引用参数和const 8.2.4 将引用用于结构 8.2.4.1 程序说明 8.2.4.2 为何要返回引用 8.2.4.3 返回引用时需要注意的问题 8.2.4.4 为何将const用于引用返…

纳米柱阵列超颖表面构建模块的严格分析

摘要 利用先进的制造技术,人们成功实现了具有高数值孔径的可见波长的超透镜。通常使用空间变化的纳米结构作为模块来构建超透镜。在这个例子中分析了用于组成偏振不敏感超透镜的纳米柱状结构。利用傅立叶模态方法(FMM,也称为RCWA)…

Windows配置开机自启jar包,不显示黑窗口,并输出日志

背景 如果是在 Linux 下开机自启一个服务相对比较简单,这次遇到一个需求是关于 Windows 开机自启的: 在 Windows 环境下开机自动运行一个 SpringBoot 服务;而且由于是一个后台服务,要求对终端用户无感知;为后期维护方…

AC自动机的实现思想与原理

1. 基本介绍 本文最先发布于博客园,原地址:AC自动机的实现与思想原理 - yelanyanyu - 博客园 (cnblogs.com) 1.1案例引入 有一个字典有若干的敏感词 String[] str;,有一个大文章 string,我们要找到大文章中出现的所有的敏感词&…

物联网ARM开发- 6协议 FSMC模拟8080时序驱动LCD(上)

目录 一、常见显示器介绍 1、显示器分类 2、显示器的基本参数 二、TFT-LCD控制原理 1、TFT-LCD结构 2、TFT-LCD控制框图 3、控制原理 LCD数据传输时序 LCD数据传输时序参数 三、SSD1963液晶控制器 1、SSD1963液晶控制器 2、SSD1963内部框图分析 3、8080写时序…