方块热图是一种特殊的热图(Heatmap)。
与传统热图相比,方块热图通过不同颜色、不同大小的正方形以表示数据/特征的大小,能够更加直观地对数据分布情况进行分析,也因此可以在一些顶级期刊中看到它的身影,比如《Nature》:
由于Matlab中未收录方块热图的绘制函数,因此需要大家自行设法解决。
本文使用自制的squareheatmap小工具进行方块热图的绘制,先来看一下成品效果:
特别提示:本期内容『数据+代码』已上传资源群中,加群的朋友请自行下载。有需要的朋友可以关注同名公号 阿昆的科研日常,后台回复关键词【绘图桶】查看加入方式。
1. 数据准备
此部分主要是读取原始数据。
% 读取数据
load data.mat
% 数据矩阵
Z = data;
2. 颜色定义
作图不配色就好比做菜不放盐,总让人感觉少些味道。
但颜色搭配比较考验个人审美,需要多加尝试。
这里直接使用TheColor配色工具中的SCI权威配色库:
%% 颜色定义
map = TheColor('sci',2064);
% map = flipud(map);
3. 方块热图绘制
调用‘squareheatmap’命令,绘制初始方块热图。
squareheatmap(Z,1000)
hTitle = title('Square Heatmap Plot');
hXLabel = xlabel('K (w)');
hYLabel = ylabel('Samples');
4. 细节优化
为了插图的美观,将初始方块热图赋上之前选择的颜色并添加颜色条:
% 赋色
colormap(map)
colorbar
然后,对坐标轴细节等进行美化,设置完毕后,以期刊所需分辨率、格式输出图片。
%% 图片输出
figW = figureWidth;
figH = figureHeight;
set(figureHandle,'PaperUnits',figureUnits);
set(figureHandle,'PaperPosition',[0 0 figW figH]);
fileout = 'test';
print(figureHandle,[fileout,'.png'],'-r300','-dpng');
也可以尝试其它配色:
以上。