TBTOOLS标记染色体上的gene

news2024/10/4 21:52:51

最近碰到个问题,如何在染色体上标记gene, 查了下发现了个windows工具:TBTOOLs , 有点意思,真是简洁高效。
话不多说,直接干。。

工具下载

直接在github 下载即可 https://github.com/CJ-Chen/TBtools-II, 解压
在这里插入图片描述

绘图实战

解压上面下载的压缩包,双击TBtools_JRE1.6.jar 文件,即可打开工具。
选择‘Graphics’ -> ‘show gene on chromosome’ -> ‘Gene location Visualize(Advance)’ 即可绘制自定义的染色体图

在这里插入图片描述

导入自己定义的染色体文件和gene坐标文件:
那必须给大家整一个真实案例文件(自己复制粘贴吧 注意分隔符要用tab哦,粘贴可能会变成空格,自己在处理下吧)
chr.txt:

chr01	43270920
chr03	36413619
chr04	35502594

gene.txt:

gene1	chr01	42905570	42907462
gene1	chr03	17008027	17011263
gene1	chr04	31078201	31080558

在这里插入图片描述

成品如下:(细节大家自己调吧,不是啥问题)在这里插入图片描述

over。。。。

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