最近碰到个问题,如何在染色体上标记gene, 查了下发现了个windows工具:TBTOOLs , 有点意思,真是简洁高效。
话不多说,直接干。。
工具下载
直接在github 下载即可 https://github.com/CJ-Chen/TBtools-II, 解压
绘图实战
解压上面下载的压缩包,双击TBtools_JRE1.6.jar 文件,即可打开工具。
选择‘Graphics’ -> ‘show gene on chromosome’ -> ‘Gene location Visualize(Advance)’ 即可绘制自定义的染色体图
导入自己定义的染色体文件和gene坐标文件:
那必须给大家整一个真实案例文件(自己复制粘贴吧 注意分隔符要用tab哦,粘贴可能会变成空格,自己在处理下吧)
chr.txt:
chr01 43270920
chr03 36413619
chr04 35502594
gene.txt:
gene1 chr01 42905570 42907462
gene1 chr03 17008027 17011263
gene1 chr04 31078201 31080558
成品如下:(细节大家自己调吧,不是啥问题)
over。。。。