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前言
随着基于过程的作物生长模型(Process-based Crop Growth Simulation Model)的发展,R语言在作物生长模型和数据分析、挖掘和可视化中发挥着越来越重要的作用。
一:DSSAT模型
1.作物模型的概念
2.DSSAT模型发展现状
3.DSSAT与R语言的安装
4.DSSAT模型的高级应用
5.R语言在作物模型参数优化中的应用
6.R语言在作物模型全球栅格模拟中的应用
7.R语言在作物模型结果分析和数据可视化中的应用
二:R语言与数据科学
1 R语言与数据科学
1)R语言发展脉络
2)R语言数据操作技巧
3)R语言在作物模型中的应用
2 R语言编程技巧数据
1)R与工作目录
2)R的数据类型及结构
3)R中各数据类型的赋值
4)各种数据格式的读写及操作
三:DSSAT模型高级应用技巧
1 DSSAT模型
1)DSSAT的安装
2)DSSAT模型操作界面
2 DSSAT模型源码与编译
1)DSSAT模型源码安装
2)DSSAT源码与修改
3)DSSAT源码的编译
四:R语言准备DSSAT气象文件
1 DSSAT自带的气象数据的准备
2 R语言操作和准备气象文件
1)DSSAT气象文件的介绍
2)日照转辐射算法的编写
3)DSSAT气象文件的编写
五:R语言准备DSSAT土壤文件
1 DSSAT模型的土壤模块及土壤输入参数
2 DSSAT模型土壤水分-氮素-有机碳模块的主要算法
3 DSSAT模型土壤参数在数据缺失情况下的近似估算
4 使用R语言操作和准备土壤输入文件
5 DSSAT模型全球土壤数据库的使用
六:R语言准备DSSAT管理文件
1 DSSAT模型的农田管理措施(播期、密度、施肥、灌溉、有机肥、秸秆还田等)
2 使用R语言进行管理文件批量准备(只需要填写excel,就能批量模拟)
七:R语言准备DSSAT参数文件及批量模拟文件
1 DSSAT模型的主要遗传参数,包括物种参数、生态型参数、品种参数
2 主要的参数优化方法
3 使用R语言进行参数文件准备
4 使用R语言对批量模拟文件的编写
八:R语言对模拟结果进行数据清洗和整理
1 使用R语言读取DSSAT文件的模拟结果
2 对模拟结果进行数据清洗、分类和整理
九:R语言对模拟结果进行数据分析及绘图
1 使用R语言对模拟结果进行分析
2 使用R语言计算模拟结果的MSE、RMSE、MAE、d-value、EF值
3 使用R语言对模拟结果进行可视化(模拟结果的动态图和1:1图等)