文章目录
- Modality-Adaptive Feature Interaction for Brain Tumor Segmentation with Missing Modalities
- 摘要
- 本文方法
- Modality-Adaptive Feature Interaction
- Graph Representation
- Graph Edge Computation
- Modality Feature Updating
- 实验结果
Modality-Adaptive Feature Interaction for Brain Tumor Segmentation with Missing Modalities
摘要
多模态磁共振成像(MRI)在脑肿瘤分割中起着至关重要的作用。然而,缺失模态是临床实践中常见的现象,导致肿瘤分割性能下降。考虑到模态之间存在互补信息,模态之间的特征交互对肿瘤分割很重要。
方法
本文提出了具有多模态代码的模态自适应特征交互(MFI),以在不同模态缺失情况下自适应地交互模态之间的特征。MFI是一个简单而有效的单元,基于图结构和注意力机制,用于学习和交互图节点(模态)之间的互补特征。同时,所提出的多模态代码指示每个模态是否缺失,引导MFI学习不同缺失情况下节点之间的自适应互补信息
将MFI与多模态代码应用于U型架构的不同阶段,我们设计了一种新的网络U-Net-MFI,以分层和自适应地交互多模态特征,用于具有缺失模态的脑肿瘤分割。
本文方法
Modality-Adaptive Feature Interaction
在U-Net-MFI的某一阶段的特征空间中,MFI的输入是N个模态的多模态特征{f1,…,fN},其中fi∈RC×H×W×L,其中C是通道数,W,H,L表示当前阶段3D体积特征的宽度、高度和切片尺寸。以这些模态特征和多模态代码h作为输入,我们首先为一个模态的每个节点建立一个图,然后设计消息传递,以学习合并其他模态的特征。所提出的多模态代码h指示是否观察到不同的模态,将指导MFI学习过程。
Graph Representation
给定多模态特征和多模态代码,我们构建了一个图G=(V,E),其中V表示通过其特征表示模态的图节点,E表示表示节点(模态)之间关系的邻接边矩阵
Graph Edge Computation
该过程用于计算成对图节点(即模态)之间的边权重。对于图的每个第i个节点,我们首先在多模态代码的指导下计算其压缩节点特征,用于边权计算,压缩节点特征定义为
sp:空间池化
h:多模态结点(0,1代表是否缺失)
计算用于特征交互的模态之间的边缘权重:
φi是线性层
Modality Feature Updating
基于边缘权重,该过程是交互节点的模态特征fi(i=1···N),以导出每个节点(即模态)的更新特征。以第i个节点为例,我们将Ri={ri1,…,riN}馈送到softmax层以获得归一化的注意力得分,然后输出特征{ξfi}计算为:
注意,更新后的特征fi是输入特征fi与基于残差跳跃连接的其他模态的“借用”特征的相加。这实现了我们关于模态之间的特征交互的想法。总之,MFI旨在从多模态代码引导的多模态图像特征中学习互补特征。将MFI模块插入U-Net-MFI的分层多模态特征空间有助于深入捕捉这些互补特征进行分割。
实验结果