一致性分析
分析数据一致性时常用的方法如下:
方法 | 数据类型 |
---|---|
ICC组内相关系数 | 定量或者定类 |
Kappda一致性系数 | 定类(分级) |
Bland-Altman图(BA图) | 定量数据 |
Bland-Altman
常用于生物医学研究论文中评价 两种连续变量测量方法的一致性。BA图直观反映两者的一致性。如图所示,横轴表示 两种测量方法的均值,纵轴表示两种测量方法的差值。图中蓝色线条表示两种测量方法的差值均值。两条红线分别表示
±
1.96
S
D
\pm 1.96 SD
±1.96SD的范围。
若大部分样本点落在
m
e
a
n
±
1.96
s
t
d
mean \pm 1.96 std
mean±1.96std,则说明两种方法的测量一致性较好。
Bland-Altman python 绘图
- 准备数据,score1和score2分别代表两次测量的结果
score1=np.asarray(score1)
score2=np.asarray(score2)
mean=np.mean([score1,score2],axis=0)
diff=score1-score2
md=np.mean(diff)
sd=np.std(diff,axis=0)
通过matplotlib 绘制
import matplotlib.pyplot as plt
plt.figure(figsize=(10,10))
plt.rc('axes', unicode_minus=False) # 处理 负号
plt.scatter(mean, diff)
plt.axhline(md, color='black', linestyle='-')
plt.axhline(md + 1.96*sd, color='gray', linestyle='--')
plt.axhline(md - 1.96*sd, color='gray', linestyle='--')
plt.show()