目录
①关于胃癌TME分型介绍
②TMEscore计算-TMEscore包
③关于TMEscore的前瞻性研究
①关于胃癌TME分型介绍
Tumor Microenvironment Characterization in Gastric Cancer Identifies Prognostic and Immunotherapeutically Relevant Gene Signatures - PubMed (nih.gov)
综合评估了1524例胃癌患者的TME浸润模式，并使用两种提出的计算算法系统地将TME表型与胃癌的基因组特征和临床病理特征相关联。定义了三种TME表型，并使用主成分分析算法构建TMEscore。高TMEscore亚型的特征在于对病毒和IFNγ的免疫激活和应答。在低TMEscore亚型中观察到转化生长因子β、上皮-间质转化和血管生成途径的激活，这被认为是T细胞抑制性的，可能是胃癌预后显著恶化的原因[危险比(HR)，0.42；95%可信区间(CI)，0.33-0.54；P < 0.001]。多变量分析显示TMEscore是一个独立的预后生物标志物，其预测免疫治疗结果的价值也得到了证实(IMvigor210队列:HR，0.63；95% CI，0.46-0.89；P = 0.008GSE78220队列:HR，0.25；95% CI，0.07-0.89；P = 0.021)。因此，描绘胃癌的TME特征的全面图景可能有助于解释胃癌对免疫疗法的反应，并为癌症的治疗提供新的策略。
②TMEscore计算-TMEscore包
DongqiangZeng0808/TMEscore: Calculating Tumor microenvironment score (github.com)
确定TME浸润模式的TMEscore包（胃癌）-CSDN博客
Tumor microenvironment evaluation promotes precise checkpoint immunotherapy of advanced gastric cancer - PubMed (nih.gov)
作者使用先前研究得出的 244 肿瘤免疫相关基因（244里有AB两个细分亚集），对特征基因进行缩减。从多个免疫治疗队列中获取这些基因的重要性特征。（TCGA-SKCM、GSE78220、GSE115821、GSE35640、IMvigor210、Snyder et al.）
③关于TMEscore的前瞻性研究
Tumor microenvironment RNA test to predict immunotherapy outcomes in advanced gastric cancer: The TIMES001 trial - PubMed (nih.gov)
背景:临床试验支持免疫检查点封闭(ICBs)加化疗对部分转移性胃癌(mGC)患者的疗效。为了确定反应的决定因素，我们开发了一个TMEscore模型来评估肿瘤微环境(TME)，这是以前被证明是ICBs的生物标志物。
方法:使用包含30个TME基因的PCR检测试剂盒建立TMEscore检测的参考数据库。这项多中心前瞻性临床试验(NCT#04850716)包括接受ICB联合化疗作为一线方案的mGC患者。治疗前从五个医学中心提取的86个肿瘤样本用于评估TMEscore、PD-L1 (CPS)和错配修复缺陷。
结果:该队列的客观缓解率(ORR)和中位PFS为31.4%和6个月。在tme评分高的mGC患者中观察到ORR增加(ORR = 59%)。生存分析表明，高TM评分与更有利的PFS和OS显著相关。此外，发现TMEscore是超过MSI和CPS的预测性生物标志物(AUC分别为0.873、0.511和0.524)。通过整合TMEscore和临床变量，融合模型进一步增强了临床设置中的预测效率和转化应用。
结论:这项前瞻性临床研究表明，TMEscore分析是一种强有力的生物标志物，用于筛选可能从ICB联合化疗中获益的mGC患者。
文献：
1：Tumor Microenvironment Characterization in Gastric Cancer Identifies Prognostic and Immunotherapeutically Relevant Gene Signatures
2：Tumor microenvironment evaluation promotes precise checkpoint immunotherapy of advanced gastric cancer
3：Tumor microenvironment RNA test to predict immunotherapy outcomes in advanced gastric cancer: The TIMES001 trial
