之前讲过临床模型预测的专栏,但那只是基础版本,下面我们以自噬相关基因为例子,模仿一篇五分文章,将图和代码复现出来,学会本专栏课程,可以具备发一篇五分左右文章的水平:
本专栏目录如下:
Figure 1:差异表达基因及预后基因筛选(图片仅供参考)
Figure 2. 生存分析,箱线图表达改变分析(图片仅供参考)
Figure 3. 基因富集分析(图片仅供参考)
Figure 4.构建临床预测模型(图片仅供参考)
Figure 5.训练集训练模型(图片仅供参考)
Figure 6.测试集测试模型(图片仅供参考)
Figure 7.外部数据集验证模型(图片仅供参考)
Figure 8.生存曲线鲁棒性分析(图片仅供参考)
FIgure 9.列线图构建,ROC分析,DCA分析(图片仅供参考)
Figure 10.机制及肿瘤免疫浸润(图片仅供参考)
上一节的单因素Cox回归中,riskscore,Age,stage和grade对预后有意义,gender对预后无意义,下面用四个单因素有意义的变量做多因素Cox回归,
data <- read.csv("Nomogram_data.csv",