生物通路数据库为科学家提供了关于生物通路的大量信息和资源，特别是在数据整合、信息检索、数据可视化分析、数据交互、生物学研究等方面，积极推动了生物学研究和科学的发展。

世界各地正在创建各种类型的通路数据库，每个数据库都反映了其创建者的意图和目标。有些数据库专注于详细描述代谢通路，而其他数据库则更专注于信号通路。这些数据库大多由管理员通过阅读论文和提取通路信息的方式创建，然后将这些信息与通路图一起组织在数据库中。此外，还有一些数据库利用自然语言处理和文本挖掘技术，从论文中提取各种生物关系，例如基因调节关系，并将它们组织到数据库中。

而作为我国第一个也是国内唯一一个生物信息数据库系统-BioXFinder也创建了自己的通路数据库，其中收录1千多张整合的经典通路，覆盖人、大鼠、小鼠三个物种，包含基因、化合物、酶、多聚糖、药物和疾病之间的相互作用关系等信息。下面简单介绍一下该通路数据的检索功能及应用方法：

可通过物种、通路类型、基因、化合物等信息进行多条件筛选，其中物种包含了全局通路、人类、小鼠、大鼠；通路类型包含了代谢、遗传信息处理、环境信息处理、细胞过程、有机系统、人类疾病；基因包含了地图1、地图3、PIK3CA、PIK3CB、小时、克拉斯、拉夫1、NRAS、NFKB1、丽拉、普尔卡......;化合物包含了钙阳离子、D-肌醇1，4，5-三磷酸、二酰基甘油、3，5'-循环放大器......

勾选上图左侧目标条件点击‘搜索’，在右侧显示查询结果，通过点击通路图和通路编号（绿色字体），即可查看大图及详细通路构成信息。

如上图，BioXFinder通路数据库中的通路构成由基因、化合物、药物、功能模块、关联通路等小模块组成，在基因模块中能看到该通路的基因编号、基因符号、基因名称、酶编号等信息，在关联通路中，可通过点击绿色字体的通路名称查看其它通路信息，再最后给出了目标通路的出处包括了作者及期刊的信息，方便大家对其信息追溯来源。

当然除了通路数据库，该系统还集成了核酸、蛋白质、蛋白质结构、代谢通路、BLAST、生存分析、基因ID转换等生物信息，主要为生物科研工作者解决海外数据访问困难和访问速度慢的问题，也可高效地搜索所需的信息（支持中英文），并在无需编写代码的情况下完成生物信息分析。