如何根据蛋白质序列找到蛋白质ID

news2024/10/7 20:24:37

多数数据集中有蛋白质序列但不存储蛋白质ID,这使得PDB文件获取困难,如何找到蛋白质序列对应的ID,参考以下(还没有找到批处理方法,如果有知道的小伙伴评论区留言):

1. 进入官方网站:RCSB PDB: HomepageAs a member of the wwPDB, the RCSB PDB curates and annotates PDB data according to agreed upon standards. The RCSB PDB also provides a variety of tools and resources. Users can perform simple and advanced searches based on annotations relating to sequence, structure and function. These molecules are visualized, downloaded, and analyzed by users who range from students to specialized scientists.https://www.rcsb.org/

2. 高级搜索:

 3. 输入目标序列

 4. 筛选,左边有物种,0.98为score,取score最小的,原理不知。

 5. 可下载相关文件

 7. 验证结果:判断序列与找到的蛋白质ID序列是否一致

 输出YES

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/903984.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

java 用协程 实现 简单下订单功能

java 用协程有几种方式,本文是是基于kotlin的协程库实现。 kotlin 协程原理 Kotlin 的协程(Coroutines)是一种在 Kotlin 语言中实现异步编程的轻量级工具。它可以实现更简洁和可读性更高的异步代码,并且不需要显式地使用回调函数…

0基础入门C++之类和对象中篇

目录 1.类的6个默认成员函数2.构造函数2.1概念2.2特性 3.析构函数3.1概念3.2特性 4.拷贝构造函数4.1概念4.2 特性 5.赋值运算符重载5.1运算符重载5.2赋值重载5.3赋值运算符重载特性 6.const成员7.取地址及const取地址操作符重载 1.类的6个默认成员函数 通过类和对象上篇的学习&…

操作系统——操作系统内存管理基础

文章目录 1.内存管理介绍2.常见的几种内存管理机制3.快表和多级页表快表多级页表总结 4.分页机制和分段机制的共同点和区别5.逻辑(虚拟)地址和物理地址6.CPU 寻址了解吗?为什么需要虚拟地址空间? 1.内存管理介绍 操作系统的内存管理主要是做什么? 操作系统的内存…

solidwords(6)

从右视图开始,分上下两部分 标题 这里的薄壁要留意一下怎么算的(单向:默认向内;如果想向外记得选反向)

Vue2+Vue3笔记(尚硅谷张天禹老师)day01

只是记录,初心是为了让页面更好看,会有错误 环境准备 下载vue:Vue下载 下面两个是可选的,主要是我想让控制台干净点 vue_dev_tool安装 vue_dev_tool安装 : Vue 控制台出现You are running Vue in development mode. Make sure to turn on production mode when dep…

unity之Input.GetKeyDown与Input.GetKey区别

文章目录 Input.GetKeyDown与Input.GetKey区别 Input.GetKeyDown与Input.GetKey区别 Input.GetKey 和 Input.GetKeyDown 是 Unity 中用于检测按键状态的两个不同函数。它们之间的区别在于何时触发。 Input.GetKey(KeyCode key): 这个函数会在用户按住指定的键时触发&#xff0…

CountDownLatch和CyclicBarrie

前置提要 什么是闭锁对象 闭锁对象(Latch Object)是一种同步工具,用于控制线程的等待和执行顺序。闭锁对象可以让一个或多个线程等待,直到特定的条件满足后才能继续执行。 在Java中,CountDownLatch就是一种常见的闭锁对…

【AI大模型】训练Al大模型

大模型超越AI 前言 洁洁的个人主页 我就问你有没有发挥! 知行合一,志存高远。 目前所指的大模型,是“大规模深度学习模型”的简称,指具有大量参数和复杂结构的机器学习模型,可以处理大规模的数据和复杂的问题&#x…

C语言刷题指南(三)

📙作者简介: 清水加冰,目前大二在读,正在学习C/C、Python、操作系统、数据库等。 📘相关专栏:C语言初阶、C语言进阶、C语言刷题训练营、数据结构刷题训练营、有感兴趣的可以看一看。 欢迎点赞 &#x1f44d…

JS-Array数组方法reduce()

reduce方法 // 可以与箭头函数一起使用 array.reduce((total,curVal) > total curVal, initVal) array.reduce(function(total, currentValue, currentIndex, arr), initialValue) 例子: // a:总和/累加项 // c:每一项的值 const allCount compu…

实验三 nfs 服务器环境搭建

nfs 服务器环境搭建 nfs(Network File System)即网络文件系统,其基于UDP/IP 使用nfs能够在不同计算机之间通过网络进行文件共享,能使使用 者访问网络上其它计算机中的文件就像在访问自己的计算机一样。 【实验目的】 掌握 nfs 环…

RT1052的XBAR

文章目录 XBAR2函数2.1 XBARA_Init2.2XBARA1_Signal_Set XBAR XBAR 是 RT1052 芯片自带的内部外设交错开关矩阵 它可以将 RT1052 内部外设的输出(或 IO 口的输入)映射到另外一部分内部外设的输入(或 IO 口的输出)上,…

WordPress用于您的企业网站的优点和缺点

如今,WordPress 被广泛认为是一个可靠、可扩展且安全的平台,能够为商业网站提供支持。然而,许多人质疑 WordPress 是否是适合企业的平台。 这就是我们创建本指南的原因。通过探索 WordPress 的优点和缺点,您可以确定世界上最受欢…

低代码自动化解析:企业所需了解的全面指南

根据2020年以来与低代码技术相关的积极趋势,Gartner预测到2023年低代码开发技术市场将增长20%。此外,他们还预计,到2026年,非正式IT部门的开发人员将占低代码开发工具用户群至少80%的比例,而这一比例在2021年为60%。基…

服务器感染了.360勒索病毒,如何确保数据文件完整恢复?

引言: 随着科技的不断进步,互联网的普及以及数字化生活的发展,网络安全问题也逐渐成为一个全球性的难题。其中,勒索病毒作为一种危害性极高的恶意软件,在近年来频频袭扰用户。本文91数据恢复将重点介绍 360 勒索病毒&a…

C++快速回顾(二)

前言 在Android音视频开发中,网上知识点过于零碎,自学起来难度非常大,不过音视频大牛Jhuster提出了《Android 音视频从入门到提高 - 任务列表》,结合我自己的工作学习经历,我准备写一个音视频系列blog。C/C是音视频必…

HDU-7314 2023“钉耙编程”杭电多校赛(4)Data Generation

HDU-7314 2023“钉耙编程”杭电多校赛(4)Data Generation 题目大意 给定 n n n和 m m m,求下面的算法中 a n s ans ans的期望值模 998244353 998244353 998244353后的结果。 有 T T T组数据。 1 ≤ T ≤ 1 0 5 , 1 ≤ n ≤ 1 0 18 , 0 ≤ m…

一种新型的4H-SiC超结共模场效应晶体管(UMOSFET),具有异质结二极管,以提高反向恢复特性

标题:A novel 4H-SiC super junction UMOSFET with heterojunction diode for enhanced reverse recovery characteristics 摘要 摘要—本文提出并通过数值模拟研究了一种新型的碳化硅(SiC)超结共模场效应晶体管(UMOSFET&#xf…

Python批量爬虫下载文件——把Excel中的超链接快速变成网址

本文的背景是:大学关系很好的老师问我能不能把Excel中1000个超链接网址对应的pdf文档下载下来。虽然可以手动一个一个点击下载,但是这样太费人力和时间了。我想起了之前的爬虫经验,给老师分析了一下可行性,就动手实践了。    没…

企业展示小程序搭建指南

如今,移动互联网的快速发展,为企业展示提供了更多元化的方式。除了传统的宣传手段,企业还可以借助小程序来展示自己的实力和产品。本文将为大家介绍一种简单的DIY小程序的方法,让企业能够快速打造自己的展示平台。 首先&#xff0…