代谢组学及网络药理学研究技术与实践

news2024/11/16 21:47:20

一、背景:

代谢组学是近年发展快速的一门学科,目前在医学、植物学、微生物学、毒理学、药物研发等多个领域中得到了广泛的应用。如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标志物成为近年来代谢组学研究的热点和难点。网络药理学能够通过计算机模拟算法、运用组学、高通量筛选及网络分析等技术揭露药物-靶点-疾病之间复杂的网络信号关系,已经成为揭示生物系统复杂功能和行为的有力工具。应新老客户的培训需求,北京软研国际信息技术研究院联合互动派(北京)教育科技有限公司现推出《代谢组学及网络药理学研究技术与实践》永久录播回放课程,具体课程通知内容如下:

二、特色:

本次课程采用录播回放的形式,发送课程全部案例资料,建立永不解散的课程学员群,长期互动答疑。整体课程对知识进行由浅入深,层层递进,系统讲解,配合案例解析边讲边练,让学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作;学员微信群提供专业指导,从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求,巩固学习内容。

(不限时间,不限地点,随报随学,只需1899,提供用于报销的正规机打发票及盖有公章的纸质通知文件或会议邀请函

三、讲师

课程由工作在科研一线的硕士生导师担任主讲,在国内外学术期刊发表研究论文20余篇,其中SCI收录超过10篇。近几年主持/参与国家自然科学基金和省自然科学基金多项。从事代谢组学技术研究近十年,熟练相关操作流程和数理统计方法,研究方向为基于代谢组学技术的中药质量控制及药理研究。

四、联系方式:

联系人:  高老师         

电话/微信:13784334157            

报名QQ:  1670506339

五、 大纲:

代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践课程

代谢组学研究

技术与实践

1代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨

代谢组学概述、操作流程、样本采集、储存及制备问题

2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性

2.1 常用技术平台介绍(NMR和LC-MS)

2.2 常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定、数据预处理与分析)

2.3 数据预处理(归一化、标准化、数据转化、缺失值评估)

3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操

3.1 样本分类(无监督和监督模式)

3.2 差异变量筛选(S-plot、S+V-plot、VIP、biplot等)

3.3 常见图形结果解读

网络药理学研究技术与实践

4、网络药理学研究思路和流程

5、网络药理学数据分析与实操

5.1 化学成分的获取与筛选

5.2 中药化学成分靶点获取

5.3 疾病靶点富集数据库

5.4 化合物与疾病靶点映射(韦恩图)

5.5 PPI网络分析(PPI网站的构建、PPI核心网络的筛选)

5.6 富集分析(DAVID数据库、Metascape 数据库)

5.7 网络图构建—Cytoscape(数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出)

代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践

6、代谢组学与网络药理学结合研究思路

7、代谢组学与网络药理学结合分析技术

7.1 代谢组学与网络药理学数据的获取

7.2 代谢组学功能分析(富集分析、通路分析等)

7.3 小分子网络关联分析(Metscape软件、KEGG数据库等)

7.4 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析

核心技术实战

8、实例操作

8.1 TCMSP数据库获取与筛选化学成分

8.2 Swiss Target Prediction数据库预测成分靶点

8.3 DisGeNET数据库获取疾病靶点

8.4 化合物与疾病靶点映射

8.5 PPI网络绘制

8.6 DAVID软件进行富集分析

8.7 Cytoscape工具绘制成分-靶点图

8.8 Metscape绘制代谢-酶网络关联图

文献解析实例

9、代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路

9.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例(Food Res Int. 2020, 136:109503)

目标:采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联,聚焦关键蛋白。

9.2代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例(J Ethnopharmacol. 2021,264:113281. )

目标:采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联,聚焦关键通路。

9.3代谢组学和网络药理关联分析实例(Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19:1002-1013)

目标:整合代谢组学和网络药理学揭示羟基红花黄色素A抗急性脑外伤的作用机制损伤。

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