代谢组学及网络药理学研究技术与实践

news2024/9/28 23:34:13

一、背景:

代谢组学是近年发展快速的一门学科,目前在医学、植物学、微生物学、毒理学、药物研发等多个领域中得到了广泛的应用。如何从复杂的代谢组学数据中提取出有价值的信息,筛选出潜在的生物标志物成为近年来代谢组学研究的热点和难点。网络药理学能够通过计算机模拟算法、运用组学、高通量筛选及网络分析等技术揭露药物-靶点-疾病之间复杂的网络信号关系,已经成为揭示生物系统复杂功能和行为的有力工具。应新老客户的培训需求,北京软研国际信息技术研究院联合互动派(北京)教育科技有限公司现推出《代谢组学及网络药理学研究技术与实践》永久录播回放课程,具体课程通知内容如下:

二、特色:

本次课程采用录播回放的形式,发送课程全部案例资料,建立永不解散的课程学员群,长期互动答疑。整体课程对知识进行由浅入深,层层递进,系统讲解,配合案例解析边讲边练,让学员能运用模拟软件针对每个技术点进行上机操作;学员微信群提供专业指导,从而更好地满足学员不同方面的论文及实际科研工作需求,巩固学习内容。

(不限时间,不限地点,随报随学,只需1899,提供用于报销的正规机打发票及盖有公章的纸质通知文件或会议邀请函

三、讲师

课程由工作在科研一线的硕士生导师担任主讲,在国内外学术期刊发表研究论文20余篇,其中SCI收录超过10篇。近几年主持/参与国家自然科学基金和省自然科学基金多项。从事代谢组学技术研究近十年,熟练相关操作流程和数理统计方法,研究方向为基于代谢组学技术的中药质量控制及药理研究。

四、联系方式:

联系人:  高老师         

电话/微信:13784334157            

报名QQ:  1670506339

五、 大纲:

代谢组学数据分析及网络药理学研究技术与实践课程

代谢组学研究

技术与实践

1代谢组学简介及样本的采集与制备关键问题探讨

代谢组学概述、操作流程、样本采集、储存及制备问题

2、代谢组学数据采集与预处理,决定数据统计结果的准确性

2.1 常用技术平台介绍(NMR和LC-MS)

2.2 常用软件和数据库介绍(代谢物鉴定、数据预处理与分析)

2.3 数据预处理(归一化、标准化、数据转化、缺失值评估)

3、基于SIMCA-P软件的代谢组学数据多元统计分析与实操

3.1 样本分类(无监督和监督模式)

3.2 差异变量筛选(S-plot、S+V-plot、VIP、biplot等)

3.3 常见图形结果解读

网络药理学研究技术与实践

4、网络药理学研究思路和流程

5、网络药理学数据分析与实操

5.1 化学成分的获取与筛选

5.2 中药化学成分靶点获取

5.3 疾病靶点富集数据库

5.4 化合物与疾病靶点映射(韦恩图)

5.5 PPI网络分析(PPI网站的构建、PPI核心网络的筛选)

5.6 富集分析(DAVID数据库、Metascape 数据库)

5.7 网络图构建—Cytoscape(数据导入、节点关系的建立、节点属性计算、调整网络样式、筛选及过滤、网络图导出)

代谢组学与网络药理学结合研究技术与实践

6、代谢组学与网络药理学结合研究思路

7、代谢组学与网络药理学结合分析技术

7.1 代谢组学与网络药理学数据的获取

7.2 代谢组学功能分析(富集分析、通路分析等)

7.3 小分子网络关联分析(Metscape软件、KEGG数据库等)

7.4 代谢组学与网络药理学功能层次关联分析

核心技术实战

8、实例操作

8.1 TCMSP数据库获取与筛选化学成分

8.2 Swiss Target Prediction数据库预测成分靶点

8.3 DisGeNET数据库获取疾病靶点

8.4 化合物与疾病靶点映射

8.5 PPI网络绘制

8.6 DAVID软件进行富集分析

8.7 Cytoscape工具绘制成分-靶点图

8.8 Metscape绘制代谢-酶网络关联图

文献解析实例

9、代谢组学与网络药理学结合的文章分析流程和套路

9.1 中药化学成分靶点与代谢小分子网络分析实例(Food Res Int. 2020, 136:109503)

目标:采用Metscape软件对代谢组学发现的差异代谢物和中药成分的药物靶点关联,聚焦关键蛋白。

9.2代谢组学与网络药理学功能层次关联分析实例(J Ethnopharmacol. 2021,264:113281. )

目标:采用功能富集工具分别对网络药理学和代谢组学数据进行关联,聚焦关键通路。

9.3代谢组学和网络药理关联分析实例(Comput Struct Biotechnol J. 2021, 19:1002-1013)

目标:整合代谢组学和网络药理学揭示羟基红花黄色素A抗急性脑外伤的作用机制损伤。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/688011.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

supervisor-eventlistener

了解supervisor-eventlistener 本文主要介绍 supervisor Event 的功能。 supervisor 作为一个进程管理工具,在 3.0 版本之后,新增了 Event 的高级特性, 主要用于做(进程启动、退出、失败等)事件告警服务。 Event 特性是将监听的服务(listener)注册到su…

Axure教程—中继器筛查与排序

当工作中需要进行数据筛查排序操作时,我们可以如何使用Axure来进行相关操作呢?本篇文章里,作者利用中继器为我们展示了数据筛查与排序,让我们一起来看一下。 预览效果 预览地址:https://6q6ajh.axshare.com 功能介绍…

【AI模型部署】基于gradio和python的网页交互界面(web-ui)——简易使用方法

使用gradio,只需在原有的代码中增加几行,快速部署机器学习模型,就能自动化生成交互式web页面,并支持多种输入输出格式,比如图像分类中的图>>标签,超分辨率中的图>>图等。 同时还支持生成能外部网络访问的链…

最小二乘法的原理及实现

1.最小二乘法的原理及实现 笔记来源于《白话机器学习的数学》 1.1 最小二乘法的原理 预测一个变量 x x x与一个变量 y y y的关系 例如:广告费 x x x与点击量 y y y 用直线拟合数据 1.2 最小二乘法的实现 广告费x和点击量y,找到一条直线表达式&#x…

基于matlab多运动目标跟踪监测算法实现(附源码)

一、前言 此示例演示如何对来自固定摄像机的视频中的移动对象执行自动检测和基于运动的跟踪。 二、介绍 移动物体检测和基于运动的跟踪是许多计算机视觉应用的重要组成部分,包括活动识别、交通监控和汽车安全。基于运动的对象跟踪问题可以分为两部分: 检…

【KitBash3D Cargo插件】向UE中直接导入免费模型

步骤 1. 进入KitBash3D官网,点击右上角按钮来下载Cargo 2. 下载好后是个压缩包,需要进行解压 3. 解压后运行安装程序 4. 我就安装到默认的安装路径 5. 安装好后打开软件,注册账号(如果点击创建账户按钮没反应就去KitBash3D官网注…

VS依赖注入(DI)构造函数自动生成局部私有变量

前言 依赖注入(DI)在开发中既是常见的也是必需的技术。它帮助我们优化了代码结构,使得应用更加灵活、易于扩展,同时也降低了各个模块之间的耦合度,更容易进行单元测试,提高了编码效率和质量。我们经常会先定义局部变量&#xff0…

OpenCL编程指南-6.2程序对象

创建和构建程序 要创建程序对象,可以传入OpenCL C源代码文本,或者利用程序二进制码来创建。由OpenCL C源代码创建程序对象是开发人员创建程序对象的一般做法。OpenCL C程序的源代码放在一个外部文件中(例如,就像我们的示例代码中…

【网络知识面试】初识协议栈和套接字及连接阶段的三次握手

接上一篇:【网络面试必问】浏览器如何委托协议栈完成消息的收发 1. 协议栈 一直对操作系统系统的内核协议栈理解的模模糊糊,借着这一篇博客做一下简单梳理。 我觉得最直白的理解,内核协议栈就是操作系统中的一个网络控制软件,就是…

【git】git常用指令(项目一般使用流程示例)

文章目录 创建开发环境clone到本地查看分支创建自己的开发分支切换到开发分支 开发完成上传到仓库判断目前本地仓库的状态新内容提交到暂存区新内容更新到本地仓库新内容推到远端仓库dev1.0并入主分支1.切换到主分支2.合并3.推主分支上远端仓库 回退版本主分支更新了&#xff0…

软件产品登记测试为何如此重要?

软件产品登记测试为何如此重要? 软件产品登记测试报告,是对客户的软件产品进行功能性的检测和验证,确保这些功能都得以实现并能正常运行,可作为国家高新、增值税退税、双软评估、首套台软件的检测证明材料。 软件登记测试是“双软…

three.js中聚光灯及其属性介绍

一、聚光灯及其属性介绍 Three.js中的聚光灯(SpotLight)是一种用于在场景中创建聚焦光照的光源类型。它有以下属性: color:聚光灯的颜色。 intensity:聚光灯的强度。 distance:聚光灯的有效距离。 angl…

知识管理工具:在信息时代下的组织智慧管理

随着信息时代的到来,企业面临着前所未有的信息爆炸和快速变化的挑战。如何高效地管理和利用这些信息已经成为了企业生存和发展的关键。在这种背景下,知识管理工具应运而生,为企业提供了优秀的解决方案。 知识管理工具的定义与特点 知识管理的…

DAMA数据治理CDGA/CDGP认证考试备考经验分享

一,关于DAMA中国和CDGA/CDGP考试 国际数据管理协会(DAMA国际)是一个全球性的专业组织,由数据管理和相关的专业人士组成,非营利性机构,厂商中立。协会自1980年成立以来,一直致力于数据管理和数字…

gralylog介绍与安装

介绍 Graylog是一个开源的日志管理和分析平台,用于收集、存储、分析和可视化大量日志数据。它提供了一个集中化的解决方案,可以帮助组织有效地处理分散在各种系统和应用程序中的日志信息。 以下是Graylog的主要特点和功能: 日志收集&#x…

【AI工具】-MockingBird-语音合成语音克隆

简介 MockingBird: 英文翻译:反舌鸟,也可能来自《杀死一只知更鸟》(英语:To Kill a Mockingbird),台译“梅冈城故事”,中国大陆译“杀死一只知更鸟”,直译应为“杀死一…

【Python】python进阶篇之数据库操作

数据库操作 pip3安装mysql依赖 pip3 list|grep mysqlpip3 install mysql-connector-python #指定版本 pip3 install mysql-connector-python版本号 #升降版本 pip3 install --upgrade mysql-connector-python版本号原生SQL操作 操作mysql可以使用pymsql或mysql-connector-py…

基于html+css的图展示138

准备项目 项目开发工具 Visual Studio Code 1.44.2 版本: 1.44.2 提交: ff915844119ce9485abfe8aa9076ec76b5300ddd 日期: 2020-04-16T16:36:23.138Z Electron: 7.1.11 Chrome: 78.0.3904.130 Node.js: 12.8.1 V8: 7.8.279.23-electron.0 OS: Windows_NT x64 10.0.19044 项目…

第三章 决策树

文章目录 第三章 决策树3.1基本流程3.2划分选择3.2.1信息增益3.2.2增益率3.2.3基尼指数 3.3剪枝处理3.3.1预剪枝3.3.2后剪枝 3.4连续与缺失值3.4.1连续值处理3.4.2缺失值处理 3.5多变量决策树3.7实验 第三章 决策树 3.1基本流程 决策过程: 基本算法: …

灵雀云获Gartner® 首份《DevOps平台魔力象限报告》“荣誉提及”

随着平台工程理念的崛起,企业使用的独立的DevOps工具链逐渐向更先进、更便捷的DevOps平台演进。Gartner发布了首份DevOps平台魔力象限报告(Gartner Magic Quadrant for DevOps Platforms)。在这个备受关注的报告中,中国云原生厂商…