fo-dicom,第一个基于.NET Standard 2.0 开发的DICOM开源库

news2024/9/19 7:33:11

在这里插入图片描述

1. 简介:

fo-dicom是一个基于C#开发的库,用于处理DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)格式的数据。DICOM是一种用于医学影像和相关信息的标准格式,广泛应用于医学领域。fo-dicom提供了多平台支持,可在 Windows、Linux 和 macOS 等操作系统上运行。

fo-dicom库的设计理念是提供一个方便、易用、功能强大的工具,用于处理、读取、写入和修改DICOM文件。该库提供了丰富的API,支持对DICOM文件的标签进行读取和设置,支持对DICOM文件的编码和解码,支持对DICOM文件的传输和存储。

fo-dicom库还提供了对DICOM消息流的封装,使得开发者可以方便地实现自定义的DICOM服务。该库还支持对网络底层的封装,使得开发者可以轻松地实现基于网络的DICOM通信。

开源库地址

2. 开发的背景和目的:

fo-dicom库的产生是为了解决医学图像处理和DICOM数据交换的需求。在医学领域,DICOM(Digital Imaging and Communications in Medicine)是一种用于存储、传输和共享医学影像和相关信息的标准。由于医学影像数据的特殊性和复杂性,需要一个专门的库来处理DICOM数据,并提供方便的接口和工具。

背景上来说,DICOM标准的出现是为了解决各种医学设备之间的互操作性问题。在过去,不同厂商的医学设备使用自己的私有格式来存储和传输影像数据,这导致了数据共享和集成的困难。DICOM标准的制定使得不同设备可以使用统一的格式和通信协议,从而实现医学影像的无缝交流和协作。

fo-dicom作为一个开源的DICOM库,旨在提供一个易于使用且功能强大的工具,使得开发者能够处理医学图像和相关数据。它基于DICOM标准,提供了读取、创建、修改和存储DICOM数据的功能,同时支持医学图像的加载、处理和保存。此外,fo-dicom还具备与远程PACS(Picture Archiving and Communication System)或其他DICOM节点的网络通信能力,以及查询和检索功能,方便用户根据条件查询和获取DICOM实例。

3.主要特点和安装方式

阅读官方文档,即可获得安装方法:官方文档
在这里插入图片描述

4. 主要功能:

  • DICOM 数据处理:fo-dicom 支持读取、创建、修改和存储 DICOM 数据。用户可以轻松访问和操作 DICOM 文件和数据集。
  • 图像处理:该库提供了对医学图像的加载、处理和保存功能。用户可以进行像素级别的操作、图像增强、格式转换等操作。
  • DICOM 网络通信:fo-dicom 具备与远程 PACS 或其他 DICOM 节点的网络通信能力,使用户可以发送和接收 DICOM 消息。
  • 查询和检索:fo-dicom 实现了查询和检索功能,用户可以根据条件进行 DICOM 实例的查询和获取。这有助于快速访问所需的医学图像和相关数据。

5. 使用说明:

图像渲染配置

开箱即用的 fo-dicom 默认为内部类
FellowOakDicom.Imaging.IImage 样式的图像渲染。若要切换到桌面样式或 ImageSharp 样式的图像呈现,首先必须添加所需的 nuget 包,然后调用:

new DicomSetupBuilder()
    .RegisterServices(s => s.AddFellowOakDicom().AddImageManager<WinFormsImageManager>())
.Build();new DicomSetupBuilder()
    .RegisterServices(s => s.AddFellowOakDicom().AddImageManager<ImageSharpImageManager>())
.Build();

然后,在渲染时,可以通过以下方式将 IImage 强制转换为类型

var image = new DicomImage("filename.dcm");
var bitmap = image.RenderImage().As<Bitmap>();
//或
var image = new DicomImage("filename.dcm");
var sharpimage = image.RenderImage().AsSharpImage();

日志记录配置

Fellow Oak DICOM 使用 ,因此如果您已经在使用它,则 Fellow Oak DICOM 日志记录将自动显示。
Microsoft.Extensions.Logging

过去,Fellow Oak DICOM 有一个用于日志记录的自定义抽象:ILogger 和 ILogManager。 出于向后兼容性的目的,这仍然受支持,但不建议用于新应用程序。

services.AddLogManager<MyLogManager>();

其中 MyLogManager 如下所示:

using FellowOakDicom.Log;

public class MyLogManager: ILogManager {
    public ILogger GetLogger(string name) {
        ...
    }
}

6示例应用程序

这里有许多使用 fo-dicom 的简单示例应用程序,它们位于单独的存储库中。这些还包括示例 以前包含在 VS 解决方案的“示例”子文件夹中。

文件操作

var file = DicomFile.Open(@"test.dcm");             // Alt 1
var file = await DicomFile.OpenAsync(@"test.dcm");  // Alt 2

var patientid = file.Dataset.GetString(DicomTag.PatientID);

file.Dataset.AddOrUpdate(DicomTag.PatientName, "DOE^JOHN");

// creates a new instance of DicomFile
var newFile = file.Clone(DicomTransferSyntax.JPEGProcess14SV1);

file.Save(@"output.dcm");             // Alt 1
await file.SaveAsync(@"output.dcm");  // Alt 2

将图像渲染为 JPEG

var image = new DicomImage(@"test.dcm");
image.RenderImage().AsBitmap().Save(@"test.jpg");                     // Windows Forms

C-Store SCU系列

var client = DicomClientFactory.Create("127.0.0.1", 12345, false, "SCU", "ANY-SCP");
await client.AddRequestAsync(new DicomCStoreRequest(@"test.dcm"));
await client.SendAsync();

C-Echo SCU/SCP

var server = new DicomServer<DicomCEchoProvider>(12345);

var client = DicomClientFactory.Create("127.0.0.1", 12345, false, "SCU", "ANY-SCP");
client.NegotiateAsyncOps();
// Optionally negotiate user identity
client.NegotiateUserIdentity(new DicomUserIdentityNegotiation
{
    UserIdentityType = DicomUserIdentityType.Jwt,
    PositiveResponseRequested = true,
    PrimaryField = "JWT_TOKEN"
});
for (int i = 0; i < 10; i++)
    await client.AddRequestAsync(new DicomCEchoRequest());
await client.SendAsync();
C-Find SCU

var cfind = DicomCFindRequest.CreateStudyQuery(patientId: "12345");
cfind.OnResponseReceived = (DicomCFindRequest rq, DicomCFindResponse rp) => {
	Console.WriteLine("Study UID: {0}", rp.Dataset.GetString(DicomTag.StudyInstanceUID));
};

var client = DicomClientFactory.Create("127.0.0.1", 11112, false, "SCU-AE", "SCP-AE");
await client.AddRequestAsync(cfind);
await client.SendAsync();

C-Move SCU系列

var cmove = new DicomCMoveRequest("DEST-AE", studyInstanceUid);

var client = DicomClientFactory.Create("127.0.0.1", 11112, false, "SCU-AE", "SCP-AE");
await client.AddRequestAsync(cmove);
await client.SendAsync(); 

N-Action SCU

// It is better to increase 'associationLingerTimeoutInMs' default is 50 ms, which may not be
// be sufficient
var dicomClient = DicomClientFactory.Create("127.0.0.1", 12345, false, "SCU-AE", "SCP-AE",
DicomClientDefaults.DefaultAssociationRequestTimeoutInMs, DicomClientDefaults.DefaultAssociationReleaseTimeoutInMs,5000);
var txnUid = DicomUIDGenerator.GenerateDerivedFromUUID().UID;
var nActionDicomDataSet = new DicomDataset
{
    { DicomTag.TransactionUID,  txnUid }
};
var dicomRefSopSequence = new DicomSequence(DicomTag.ReferencedSOPSequence);
var seqItem = new DicomDataset()
{
    { DicomTag.ReferencedSOPClassUID, "1.2.840.10008.5.1.4.1.1.1" },
    { DicomTag.ReferencedSOPInstanceUID, "1.3.46.670589.30.2273540226.4.54" }
};
dicomRefSopSequence.Items.Add(seqItem);
nActionDicomDataSet.Add(dicomRefSopSequence);
var nActionRequest = new DicomNActionRequest(DicomUID.StorageCommitmentPushModelSOPClass,
                DicomUID.StorageCommitmentPushModelSOPInstance, 1)
{
    Dataset = nActionDicomDataSet,
    OnResponseReceived = (DicomNActionRequest request, DicomNActionResponse response) => 
    {
        Console.WriteLine("NActionResponseHandler, response status:{0}", response.Status);
    },
};
await dicomClient.AddRequestAsync(nActionRequest);
dicomClient.OnNEventReportRequest = OnNEventReportRequest;
await dicomClient.SendAsync();

private static Task<DicomNEventReportResponse> OnNEventReportRequest(DicomNEventReportRequest request)
{
    var refSopSequence = request.Dataset.GetSequence(DicomTag.ReferencedSOPSequence);
    foreach(var item in refSopSequence.Items)
    {
        Console.WriteLine("SOP Class UID: {0}", item.GetString(DicomTag.ReferencedSOPClassUID));
        Console.WriteLine("SOP Instance UID: {0}", item.GetString(DicomTag.ReferencedSOPInstanceUID));
    }
    return Task.FromResult(new DicomNEventReportResponse(request, DicomStatus.Success));
}

C-ECHO

具有高级 DICOM 客户端连接的 C-ECHO:手动控制 TCP 连接和 DICOM 关联

var cancellationToken = CancellationToken.None;
// Alternatively, inject IDicomServerFactory via dependency injection instead of using this static method
using var server = DicomServerFactory.Create<DicomCEchoProvider>(12345); 

var connectionRequest = new AdvancedDicomClientConnectionRequest
{
    NetworkStreamCreationOptions = new NetworkStreamCreationOptions
    {
        Host = "127.0.0.1",
        Port = server.Port,
    }
};

// Alternatively, inject IAdvancedDicomClientConnectionFactory via dependency injection instead of using this static method
using var connection = await AdvancedDicomClientConnectionFactory.OpenConnectionAsync(connectionRequest, cancellationToken);

var associationRequest = new AdvancedDicomClientAssociationRequest
{
    CallingAE = "EchoSCU",
    CalledAE = "EchoSCP",
    // Optionally negotiate user identity
    UserIdentityNegotiation = new DicomUserIdentityNegotiation
    {
        UserIdentityType = DicomUserIdentityType.UsernameAndPasscode,
        PositiveResponseRequested = true,
        PrimaryField = "USERNAME",
        SecondaryField = "PASSCODE",
    }
};

var cEchoRequest = new DicomCEchoRequest();

using var association = await connection.OpenAssociationAsync(associationRequest, cancellationToken);
try
{
    DicomCEchoResponse cEchoResponse = await association.SendCEchoRequestAsync(cEchoRequest, cancellationToken).ConfigureAwait(false);
    
    Console.WriteLine(cEchoResponse.Status);
}
finally
{
    await association.ReleaseAsync(cancellationToken);
}

7. 社区和生态:

fo-dicom 有一个活跃的社区,包括众多贡献者和维护者。它在 GitHub 上有一个开放的仓库,用户可以在其中提交问题、提出建议和贡献代码。fo-dicom 的更新频率较高,并得到了广泛的应用和认可。

为了方便新手学习官方构建了样例库:
在这里插入图片描述
同时支持多个平台的案例开发开发。
在这里插入图片描述

8. 优势和劣势:

  • 优势:fo-dicom 是一个强大且易于使用的 DICOM 库,具备处理医学图像和相关数据的核心功能。它提供了多平台支持、良好的文档和示例代码,并拥有一个活跃的社区。
  • 劣势:由于 DICOM 标准的复杂性,初学者可能需要一些时间来适应 fo-dicom 的使用方式。另外,某些高级功能可能需要额外的配置或第三方组件的支持。

9. 未来计划和发展方向:

fo-dicom 的未来计划包括进一步增强图像处理功能、优化性能、改进网络通信和增加对新版 DICOM 标准的支持。通过不断改进和扩展功能,fo-dicom 将继续满足用户对医学图像处理和数据交互的需求。

今天先介绍到这里,后续我将持续分享关于fo-dicom库的使用经验技巧,欢迎有需要的朋友持续关注。

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/2145794.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

华为OD机试 - 报数问题 - 约瑟夫环(Python/JS/C/C++ 2024 E卷 100分)

华为OD机试 2024E卷题库疯狂收录中&#xff0c;刷题点这里 专栏导读 本专栏收录于《华为OD机试真题&#xff08;Python/JS/C/C&#xff09;》。 刷的越多&#xff0c;抽中的概率越大&#xff0c;私信哪吒&#xff0c;备注华为OD&#xff0c;加入华为OD刷题交流群&#xff0c;…

浸没边界法精度相关的论文的阅读笔记

Convergence proof of the velocity field for a stokes flow immersed boundary method https://doi.org/10.1002/cpa.20233 研究对象的选取 他这里为什么能够选取一个周期性边界的流场啊&#xff1f;为什么不是狄利克雷边界或者诺伊曼边界&#xff1f; 方形流场的边界值 …

keil里sprintf的用法

代码&#xff1a; #include<stdio.h> int main(void) {float i-123.45;char zifu[10];sprintf(zifu,"%f",i);while(1);return 0; } 仿真结果 代码&#xff1a; #include<stdio.h> int main(void) {float i123.45;char zifu[10];sprintf(zifu,"%f…

ReKep——李飞飞团队提出的新一代机器人操作方法:基于视觉语言模型和关键点约束

前言 由于工厂、车厂的任务需求场景非常明确&#xff0c;加之自今年年初以来&#xff0c;我司在机器人这个方向的持续大力度投入(包括南京、长沙两地机器人开发团队的先后组建)&#xff0c;使得近期我司七月接到了不少来自车厂/工厂的订单&#xff0c;比如柔性上料、物料分拣、…

Linux嵌入式相机 — 项目总结

main函数执行流程 1、初始化触摸屏 Touch_screen_Init();struct tsdev *ts NULL; ts ts_setup(NULL, 0); //以阻塞打开2、初始化 LCD LCD_Init(void); 通过 ioctl 函数获取 LCD 的固定参数、可变参数&#xff0c;得到分辨率、bpp、一行的长度&#xff08;以字节为单位&a…

如何创建和编辑抖音百科词条,不会的找我们代创建!

如何创建和编辑抖音百科词条&#xff0c;不会的找我们代创建&#xff01; 如何创建抖音百科个人词条&#xff0c;个人抖音百科的创建 #抖音百科 #百科 #推广 做过百度百科的老板们注意了&#xff0c;等一下别划走。 2024 年品宣新风口出现了&#xff0c;抖音百科正在替代百度…

Unity Behavior Designe 可视化有限状态机(Composites篇)

对有限状态机这一个概念你可以看看这两篇文章&#xff1a; Unity 一个比较适合学习的FSM状态机(汉化和功能简述)-CSDN博客 C# x Unity面向对象补全计划 设计模式 之 实现一个简单的有限状态机-CSDN博客 当时我对代码下的有限状态机只有一个想法&#xff0c;设计巧妙&#…

数据结构与算法学习day21-回溯法

一、组合 1.题目 . - 力扣&#xff08;LeetCode&#xff09; 2思路 把组合问题抽象成树形结构&#xff08;N叉树&#xff09; 每次从集合中选取元素&#xff0c;可选择的范围随着选择的进行而收缩&#xff0c;调整可选择的范围。 图中可以发现n相当于树的宽度&#xff0c…

Linux(6)--CentOS目录

文章目录 1. 根目录2. cd目录切换命令3. CentOS目录介绍4. pwd命令介绍5. ls命令介绍5.1 ls5.2 ls -a5.3 ls -l 1. 根目录 Windows电脑的根目录是计算机(我的电脑)&#xff0c;然后C盘、D盘。 Linux系统的根目录是/&#xff0c;我们可以使用cd /进入根目录&#xff0c;然后使…

客户端/服务器的简易实现

目录 一,网络编程套接字 二,UDP/TCP的区别(​编辑) 三,UDP API使用 四,TCP API使用 一,网络编程套接字 socket socket(操作系统给应用程序的API,起了一个名字,就成为socket API) socket API提供了两套API分别为UDP和TCP: 二,UDP/TCP的区别() TCP有链接,可靠传输,面向字…

图解view_transformation(可视化BEV视角转换的过程)

BEV视图生成的流程总结&#xff1a; &#xff08;1&#xff09;生成视锥 &#xff08;2&#xff09;将视锥由uv坐标系转到EGO坐标系 &#xff08;3&#xff09;视锥体素化 &#xff08;4&#xff09;bev_pool &#xff08;1&#xff09;生成视锥 长宽数量: 模型输入图片尺寸//…

Winform登录实现及工具栏切换

1、登录实现 using System; using System.Collections.Generic; using System.ComponentModel; using System.Data; using System.Drawing; using System.Linq; using System.Text; using System.Threading.Tasks; using System.Windows.Forms;namespace LoginApp {public par…

峟思传感器在水库坝体渗漏防治措施中的应用

在水库工程管理中&#xff0c;坝体渗漏是一个不容忽视的问题&#xff0c;它不仅影响水库的正常运行&#xff0c;还可能对下游地区造成严重的安全隐患。因此&#xff0c;采取有效的渗漏防治措施至关重要。在这一过程中&#xff0c;传感器作为关键的技术手段&#xff0c;发挥着不…

react + antDesignPro 企业微信扫码登录

效果 实现步骤 1、项目中document.ejs文件引入企微js链接 注意&#xff1a;技术栈是使用的react antDesignPro&#xff0c;不同的技术栈有不同的入口文件&#xff08;如vue在html文件引入&#xff09; <script src"https://wwcdn.weixin.qq.com/node/wework/wwopen/j…

02 ETH

以太坊与比特币有什么不同&#xff1f; 以太坊立足比特币创新之上&#xff0c;于 2015 年启动&#xff0c;两者之间有一些显著不同。 比特币就仅仅是比特币&#xff1b;以太坊包括以太币&#xff0c;以太币才是和比特币对等的存在。以太坊是可编程的&#xff0c;所以你可以在…

Mybatis+Druid+MybatisPlus多数据源配置

MybatisDruidMybatisPlus多数据源配置 平常我们使用的是 properties 或者 yaml 来配置数据库的地址、用户名、密码等 但是这样只能配置一个数据源 现在我们想在一个项目里面配置多个数据源&#xff0c;那么我们就需要配置自己的配置类 配置类和配置文件 Mybatismysqldruid配置…

[数据集][目标检测]棉花叶子病害检测数据集VOC+YOLO格式977张22类别

数据集格式&#xff1a;Pascal VOC格式YOLO格式(不包含分割路径的txt文件&#xff0c;仅仅包含jpg图片以及对应的VOC格式xml文件和yolo格式txt文件) 图片数量(jpg文件个数)&#xff1a;977 标注数量(xml文件个数)&#xff1a;977 标注数量(txt文件个数)&#xff1a;977 标注类别…

Linux标准IO-系统调用详解

1.1 系统调用 系统调用&#xff08;system call&#xff09;其实是 Linux 内核提供给应用层的应用编程接口&#xff08;API&#xff09;&#xff0c;是 Linux 应用层进入内核的入口。不止 Linux 系统&#xff0c;所有的操作系统都会向应用层提供系统调用&#xff0c;应用程序通…

软件测试技术之 GPU 单元测试是什么!

1 背景 测试是开发的一个非常重要的方面&#xff0c;可以在很大程度上决定一个应用程序的命运。良好的测试可以在早期捕获导致应用程序崩溃的问题&#xff0c;但较差的测试往往总是导致故障和停机。 单元测试用于测试各个代码组件&#xff0c;并确保代码按照预期的方式工作。单…

《MmAP : Multi-Modal Alignment Prompt for Cross-Domain Multi-Task Learning》中文校对版

系列论文研读目录 文章目录 系列论文研读目录摘要1 引言2 相关工作3 方法3.1对比图像预训练3.2 多模式对齐提示3.3 多任务提示学习框架 4 实验4.1基准设置4.2实验结果4.3消融研究 5、结论 摘要 多任务学习&#xff08;Multi-Task Learning&#xff0c;MTL&#xff09;是为了同…