使用ggplot2绘制带星号的热图

news2024/11/16 19:49:19

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  1. 导入相关的R包
###'@导入相关的R包
library(readxl)
library(tidyverse)
library(readxl)
library(ggsci)
library(viridis)
library(RColorBrewer)
  1. 导入数据
corr_data <- read_excel("20240325_input.xlsx",sheet = "Sheet1")
corr_data[1:5,1:10]
> corr_data[1:5,1:10]
# A tibble: 5 × 10
  Conjugation Taxa            visit estimate statistic p.value method                         alternative    fdr p_label
  <chr>       <chr>           <chr>    <dbl>     <dbl>   <dbl> <chr>                          <chr>        <dbl> <chr>  
1 Ala         Bacteroides     0-4D    0.151    168508.  0.122  Spearman's rank correlation r… two.sided   0.285  NA     
2 Ala         Bacteroides     1M     -0.223    278640.  0.0189 Spearman's rank correlation r… two.sided   0.0882 NA     
3 Ala         Bacteroides     12M    -0.134    231518.  0.169  Spearman's rank correlation r… two.sided   0.311  NA     
4 Ala         Bifidobacterium 0-4D   -0.0359   205606.  0.715  Spearman's rank correlation r… two.sided   0.834  NA  

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