直方图及数据95%置信区间及特征筛选

news2024/9/23 9:32:46
rm(list = ls())
library(Rmisc)
library(ggplot2)
library(dplyr)

data <- iris
x<-iris$Sepal.Length
#求置信区间方法1##
confidence_interval <- t.test(x)$conf.int
print(confidence_interval)
#[1] 5.709732 5.976934
#attr(,"conf.level")
#[1] 0.95

#求置信区间方法2##
CI(x,ci=0.95)##基于library(Rmisc)

##密度图##
hist(x,##重要性特征
     col='black',
     border='yellow',
     main='重要性',#
     xlab='',
     freq = F)#纵坐标为组距x频率
lines(density(x))##添加曲线


根据P值进行特征筛选

#结果相当于P值越小,所计算的特征越大#

#结果相当于P值越小,所计算的特征越大#
df$feature1 <- -log10(df$adj.P.Val)#这两个是对等的
df$feature2 <- log10(1/df$adj.P.Val)#这两个是对等的

随后可以根据正态分布频率区间筛选95%区间外的重要特征数据


参考:

R语言计算一组数据的置信区间的简单小例子 - 知乎 (zhihu.com)

Tumor microenvironment evaluation promotes precise checkpoint immunotherapy of advanced gastric cancer 

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