要将Base64编码的字符串存储为文件，您可以按照以下步骤进行操作：

1. 将Base64编码的字符串解码为字节数组。您可以使用Java的Base64类进行解码，例如：

import java.util.Base64;

String base64String = "your_base64_encoded_string";
byte[] decodedBytes = Base64.getDecoder().decode(base64String);

2. 指定文件路径和文件名，创建一个File对象：

String filePath = "path_to_directory/file_name.ext";
File file = new File(filePath);

3. 使用FileOutputStream将解码后的字节数组写入文件：

try (FileOutputStream fos = new FileOutputStream(file)) {
    fos.write(decodedBytes); // 写入解码后的字节数组到文件
    fos.flush(); // 刷新缓冲区
}

现在，Base64编码的字符串已经被解码并存储为文件。

请确保提供的文件路径（filePath）是有效的，并且对于您的应用程序有写入权限。