文章目录
- 常用参数简介
- method测试部分
- type参数测试
- diag参数测试
- order参数测试
常用参数简介
corrplot包常用参数介绍：
-
corr: 必需参数，表示相关性矩阵，可以是数据框或者矩阵。
-
method: 表示绘制相关性矩阵的方法，有以下几种取值：
-
“circle”：绘制圆形相关性矩阵图。
-
“square”：绘制方形相关性矩阵图，不同相关性之间颜色深浅不同。
-
“color”：绘制方形相关性矩阵图，不同相关性之间颜色的深浅和颜色的具体种类都不相同。
-
“pie”：绘制饼图形式的相关性矩阵图。
-
“shade”：绘制灰度相关性矩阵图，颜色越深表示相关性越大。
-
“ellipse”：绘制椭圆形相关性矩阵图。
-
“number”：直接输出相关系数矩阵的数值。
-
- type: 相关系数的类型，可以是"upper"、“lower"或者"full”，分别表示只显示上三角、下三角或全部显示。
- order: 表示排序相关性矩阵图的顺序， 取值为"original"（原始顺序）, “AOE”,“FPC”, “hclust”, “alphabet”。
- 如果选hclust，还可以调整hclust.method()函数，有以下选项：ward, ward.D, ward.D2, single, complete, average, mcquitty, median，centroid
-
addrect: 逻辑值，表示是否添加矩形框高亮显示相关性系数较大的区域，默认为FALSE。
-
diag: 是否在对角线上绘制相关性系数，默认为TRUE。
-
is.corr参数使用TRUE或者FALSE控制是否是相关矩阵，默认是TRUE
-
col参数调整颜色，col.lim参数使颜色均匀分布
-
使用COL1()产生连续型颜色，使用COL2()产生离散型颜色。COL1()适用于只有正值或只有负值的矩阵，COL2()适合于既有正数又有负数的矩阵。
-
cl.pos控制颜色条(color legend)位置，提供以下选项：FALSE，r(right),b(bottom),n(不显示)。
-
cl.ratio控制颜色条的宽度，建议是0.1~0.2。
-
title: 图表的标题。
-
mar: 边缘空白大小。
-
addCoef.col: 相关系数文本颜色。
-
tl.offset: 文字行方向偏移量。
-
tl.col: 矩阵文本标签颜色。
-
tl.srt: 矩阵文本标签旋转角度。
-
tl.cex: 矩阵文本标签大小。
-
tl.pos：标签的位置，必须是以下中的一种：lt, ld, td, d，n
- lt：type = full的情况下的默认选项,表示left and top。
- ld：type = lower的情况下的默认选项，表示left and diagonal。
- td：type = upper的情况下的默认选项，表示top and diagonal。
- l：left
- d：diagonal
- n：不添加标签
method测试部分
data(mtcars)
M <- cor(mtcars)
par(mfrow=c(3,3))
corrplot::corrplot(M,method = "circle")
corrplot::corrplot(M,method = "square")
corrplot::corrplot(M,method = "ellipse")
corrplot::corrplot(M,method = "number")
corrplot::corrplot(M,method = "shade")
corrplot::corrplot(M,method = "pie")
corrplot::corrplot(M,method = "color")
corrplot::corrplot(M,method = "color",addCoef.col = T)
type参数测试
par(mfrow=c(1,2))
corrplot::corrplot(M, method = 'ellipse', type = 'upper',title = "type is upper")
corrplot::corrplot(M, method = 'ellipse', type = 'lower',title = "type is lower")
diag参数测试
par(mfrow=c(1,2))
corrplot::corrplot(M, method = 'ellipse',diag = T)
corrplot::corrplot(M, method = 'ellipse',diag = F)
order参数测试
par(mfrow=c(2,2))
corrplot::corrplot(M, order = 'AOE')
corrplot::corrplot(M, order = 'FPC')
corrplot::corrplot(M, order = 'hclust')
corrplot::corrplot(M, order = 'hclust', addrect = 2 )
