PSP - AlphaFold2 Multimer 的 Heteromer (异聚体) MSA 逻辑

news2024/11/19 2:21:27

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同源多聚体 (Homomer) 是由相同的蛋白质亚基组成的,而异源多聚体 (Heteromer) 是由不同的蛋白质亚基组成的。同源多聚体的亚基之间通常有对称的相互作用,而异源多聚体的亚基之间可能有不对称的相互作用。同源多聚体和异源多聚体都可以参与生物学功能,例如催化、信号转导、结构支持等。但是,异源多聚体可以提供更多的功能多样性,因为它们可以组合不同的亚基来实现不同的功能。

Heteromer

测试脚本:

bash run_alphafold.sh -o mydata/casp15-multimer-fasta-9-outputs/ -f mydata/casp15-multimer-fasta-9/H1106_A122_B114.fasta -m multimer -a "0,1" -c "full_dbs"

H1106_A122_B114</

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