Gromacs中的g_mmpbsa计算带电底物与蛋白的结合能不准确

news2024/10/2 1:21:37

g_mmpbsa计算带电底物与蛋白的结合能总是不准确 @TOC

在做的两个项目中,利用g_mmpbsa计算带电底物与蛋白的结合能结果非常不可靠,底物带两个硫酸根离子,g_mmpbsa在计算带电的底物与酶的结合能时总是不准确,因此后续若底物带电,可能不适合用g_mmpbsa计算。

欢迎使用Markdown编辑器

你好! 这是你第一次使用 Markdown编辑器 所展示的欢迎页。如果你想学习如何使用Markdown编辑器, 可以仔细阅读这篇文章,了解一下Markdown的基本语法知识。

新的改变

我们对Markdown编辑器进行了一些功能拓展与语法支持,除了标准的Markdown编辑器功能,我们增加了如下几点新功能,帮助你用它写博客:

  1. 全新的界面设计 ,将会带来全新的写作体验;
  2. 在创作中心设置你喜爱的代码高亮样式,Markdown 将代码片显示选择的高亮样式 进行展示;
  3. 增加了 图片拖拽 功能,你可以将本地的图片直接拖拽到编辑区域直接展示;
  4. 全新的 KaTeX数学公式 语法;
  5. 增加了支持甘特图的mermaid语法1 功能;
  6. 增加了 多屏幕编辑 Markdown文章功能;
  7. 增加了 焦点写作模式、预览模式、简洁写作模式、左右区域同步滚轮设置 等功能,功能按钮位于编辑区域与预览区域中间;
  8. 增加了 检查列表 功能。

功能快捷键

撤销:Ctrl/Command + Z
重做:Ctrl/Command + Y
加粗:Ctrl/Command + B
斜体:Ctrl/Command + I
标题:Ctrl/Command + Shift + H
无序列表:Ctrl/Command + Shift + U
有序列表:Ctrl/Command + Shift + O
检查列表:Ctrl/Command + Shift + C
插入代码:Ctrl/Command + Shift + K
插入链接:Ctrl/Command + Shift + L
插入图片:Ctrl/Command + Shift + G
查找:Ctrl/Command + F
替换:Ctrl/Command + G

合理的创建标题,有助于目录的生成

直接输入1次#,并按下space后,将生成1级标题。
输入2次#,并按下space后,将生成2级标题。
以此类推,我们支持6级标题。有助于使用TOC语法后生成一个完美的目录。

如何改变文本的样式

强调文本 强调文本

加粗文本 加粗文本

标记文本

删除文本

引用文本

H2O is是液体。

210 运算结果是 1024.

插入链接与图片

链接: link.

图片: Alt

带尺寸的图片: Alt

居中的图片: Alt

居中并且带尺寸的图片: Alt

当然,我们为了让用户更加便捷,我们增加了图片拖拽功能。

如何插入一段漂亮的代码片

去博客设置页面,选择一款你喜欢的代码片高亮样式,下面展示同样高亮的 代码片.

// An highlighted block
var foo = 'bar';

生成一个适合你的列表

  • 项目
    • 项目
      • 项目
  1. 项目1
  2. 项目2
  3. 项目3
  • 计划任务
  • 完成任务

创建一个表格

一个简单的表格是这么创建的:

项目Value
电脑$1600
手机$12
导管$1

设定内容居中、居左、居右

使用:---------:居中
使用:----------居左
使用----------:居右

第一列第二列第三列
第一列文本居中第二列文本居右第三列文本居左

SmartyPants

SmartyPants将ASCII标点字符转换为“智能”印刷标点HTML实体。例如:

TYPEASCIIHTML
Single backticks'Isn't this fun?'‘Isn’t this fun?’
Quotes"Isn't this fun?"“Isn’t this fun?”
Dashes-- is en-dash, --- is em-dash– is en-dash, — is em-dash

创建一个自定义列表

Markdown
Text-to- HTML conversion tool
Authors
John
Luke

如何创建一个注脚

一个具有注脚的文本。2

注释也是必不可少的

Markdown将文本转换为 HTML

KaTeX数学公式

您可以使用渲染LaTeX数学表达式 KaTeX:

Gamma公式展示 Γ ( n ) = ( n − 1 ) ! ∀ n ∈ N \Gamma(n) = (n-1)!\quad\forall n\in\mathbb N Γ(n)=(n1)!nN 是通过欧拉积分

Γ ( z ) = ∫ 0 ∞ t z − 1 e − t d t   . \Gamma(z) = \int_0^\infty t^{z-1}e^{-t}dt\,. Γ(z)=0tz1etdt.

你可以找到更多关于的信息 LaTeX 数学表达式here.

新的甘特图功能,丰富你的文章

Mon 06 Mon 13 Mon 20 已完成 进行中 计划一 计划二 现有任务 Adding GANTT diagram functionality to mermaid
  • 关于 甘特图 语法,参考 这儿,

UML 图表

可以使用UML图表进行渲染。 Mermaid. 例如下面产生的一个序列图:

张三 李四 王五 你好!李四, 最近怎么样? 你最近怎么样,王五? 我很好,谢谢! 我很好,谢谢! 李四想了很长时间, 文字太长了 不适合放在一行. 打量着王五... 很好... 王五, 你怎么样? 张三 李四 王五

这将产生一个流程图。:

链接
长方形
圆角长方形
菱形
  • 关于 Mermaid 语法,参考 这儿,

FLowchart流程图

我们依旧会支持flowchart的流程图:

Created with Raphaël 2.3.0 开始 我的操作 确认? 结束 yes no
  • 关于 Flowchart流程图 语法,参考 这儿.

导出与导入

导出

如果你想尝试使用此编辑器, 你可以在此篇文章任意编辑。当你完成了一篇文章的写作, 在上方工具栏找到 文章导出 ,生成一个.md文件或者.html文件进行本地保存。

导入

如果你想加载一篇你写过的.md文件,在上方工具栏可以选择导入功能进行对应扩展名的文件导入,
继续你的创作。


  1. mermaid语法说明 ↩︎

  2. 注脚的解释 ↩︎

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/348176.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

三层交换机DHCP中继

关于中继,我们需要有一个对比。正常情况下我们是不是需要配置单臂路由然后开启DHCP地址池,然就设置网段网关以及DNS。这样的话考验 的其实是命令功底。但是为了方便,我们 可以添加服务器,将这个服务给到服务器去配置,这…

为什么sleeping的会话会造成阻塞(2)

背景客户反馈系统突然从11:10开始运行非常缓慢,在SQL专家云中看到大量的产生阻塞的活动会话,KILL掉阻塞的源头马上又出现新的源头,实在没有办法只能重启应用程序断开所有数据库连接才解决,请我们协助分析根本的原因。现象登录SQL专…

Web前端CSS清除浮动的5种方法

在移动端清除浮动布局,常用的5种方法: 使用清除浮动的类;使用overflow属性;使用 flex 布局;使用grid 布局;使用 table 布局。 根据实际情况选择适合的方法,需要注意兼容性和语义性问题。在移动…

Yolo v5 pytorch模型转onnx用c++进行推理

本文介绍如何使用u版的yolov5 模型转成 onnx模型,使用python代码推理onnx模型,然后再使用c代码推理onnx模型,本文使用yolov5 s版本,在m,l,x都试过可行环境配置 :1 u版的yolov5 4.0 版本,其他版本没有试过 https://github.com/ultr…

console调试,chrome调试工具之Console

背景 console作为web调试的一项重要技能大多数开发人员都是console.log()一把梭到底,其实console对象上还有很多可用于调试的方法 控制台打印类别,conso调试面板 第一个是全部消息,第二个是自己在控制台里使用console指令打印的&#xff0…

【Java 面试合集】HashMap中为什么引入红黑树,而不是AVL树呢

HashMap中为什么引入红黑树,而不是AVL树呢1. 概述 开始学习这个知识点之前我们需要知道,在JDK1.8 以及之前,针对HashMap有什么不同。 JDK 1.7的时候,HashMap的底层实现是数组 链表JDK1.8的时候,HashMap的底层实现是数…

Web3中文|Web3再起恐慌:全球第三大稳定币BUSD发行商面临诉讼

俗话说,老大的位置不好当。作为全球最大加密资产交易所BA的CEO,赵长鹏的生活可谓一刻都不能平静。 刚刚结束与SBF的口舌之争,从FTX倒台的熊市中挺过来,赵长鹏又遇到了新的麻烦。 Nansen数据显示,用户在过去24小时内从…

LabVIEW开发的上位机界面在其它电脑分辨率下-界面窗口偏移显示问题解决

目录 问题: 分析: 解决方式 1)编辑前面板边界适配对应的分辨率 2)编辑前面板窗口-窗口边界 3)编辑前面板窗口-保持窗口比例 4)设置VI属性--窗口运行时位置居中显示 参考 问题: 在基于La…

图的基本概念

1、图的概念 G(V,E) 图G由节点集合VV(G)和边集合EE(G)组成,其中V为非空有限集合。 集合V中的节点(node)用红色标出,通过集合E中黑色的边(edge)连接。 G的边:E中的每个顶点对&#x…

SAP 如何在调式中查找标准程序的权限对象

当我们尝试分析授权问题(SU53、SU24……)时,有许多不同的交易很有用。 但是,在某些情况下,在调试中检查授权对象很有用。 这很有用,例如,如果我们想确切地知道在事务执行的哪个点调用了给定的授…

关键路径法和最小生成树

1、关键路径法概述关键路径的服务对象是“AOE网”(Activity on edge netword)。不同的是AOV网只考虑顶点事件,而AOE网除了顶点事件(如v[0])外,重点还有就是有向边还表示了活动(如e[0][1] a0)。其中顶点事件…

重生之我是赏金猎人-SRC漏洞挖掘(二)-逆向app破解数据包sign值实现任意数据重放添加

0x00前言 本期登场的目标虽不是SRC,但是整个漏洞的利用手法很有学习意义。目前在很多大厂的http数据包中都会添加sign值对数据包是否被篡改进行校验,而sign算法的破解往往是我们漏洞测试的关键所在~ 本人在一些漏洞挖掘实战中经常发现在破解sign值后&a…

【电商】订单拆单的流程中,系统需要做哪些工作?

什么是拆单? 在网上购买商品下单成功后,过一段时间再次浏览时,有时会发现你的订单会变成两个或多个,这就是系统做了拆单而导致的。 拆单,就是将一个大的订单依据某些规则的集合,将其分解成两个或多个子订…

内核模块(编译方法)

目录 一、向内核添加新功能 1.1 静态加载法: 1.2 动态加载法: a、新功能源码与Linux内核源码在同一目录结构下时 b、新功能源码与Linux内核源码不在同一目录结构下时 c、主机ubuntu下使用ko文件 d、开发板Linux下使用ko文件 二、内核模块基础代码…

链表题目总结 -- 回文链表

目录一. 从中心开始找最大的回文字符串1. 思路简述2. 代码3. 总结二. 判断是否为回文字符串1. 思路简述2. 代码3.总结三. 判断是否是回文链表1. 思路简述2. 代码3. 总结4. 优化解法一. 从中心开始找最大的回文字符串 题目链接:没有。给定一个字符串s,从…

平面电路和非平面电路

主要区别 参考:https://www.eda365.com/article-192836-1.html 平面电路:在平面上的每个元件的两端都可以不用交叉而连接到电路; 非平面电路:在平面上存在元件两端无法不交叉线路连接到电路。 例子(上面参考连接中&a…

继企业级信息系统开发学习1.1 —— Spring配置文件管理Bean

骑士救美计划采用构造方法注入属性值1、创建救美任务类2、创建救美骑士类2、创建救美骑士类3、创建旧救美骑士测试类3、配置救美骑士Bean5、创建新救美骑士测试类采用构造方法注入属性值 1、创建救美任务类 在net.huawei.spring.day01包里创建RescueDamselQuest类 Rescue Da…

【重点】Selenium + Nightwatch 自动化测试环境搭建

开始搭建 1. 创建项目 我们来找个地方新建一个目录,起名为 "my-test-toolkit",然后在目录内使用终端运行 npm init -y 生成项目配置文件package.json。 2. 安装工具 然后我们将安装 Selenium 与 Nightwatch。 安装 selenium-standalone&…

在哔站黑马程序员学习Spring—Spring Framework—(五)spring的第二特征AOP面向切面编程

一、AOP概念、作用AOP和OOP一样都是一种编程思想,用来指导我们做程序的。OOP面向对象编程指导我们做类、对象、继承、封装、多态等。AOP面向切面编程作用:在不惊动原始设计(不改变源代码)的基础上为其进行功能增强。核心&#xff…

2022年全国职业院校技能大赛网络空间安全A模块(1)

目录 模块A 基础设施设置与安全加固 一、项目和任务描述: 二、服务器环境说明 三、具体任务(每个任务得分以电子答题卡为准) A-1任务一 登录安全加固 1.密码策略(Windows,Linux) a.设置最短密码长度为…