实现一个简单的Database10(译文)

news2024/11/24 6:45:29
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  • 作者: 花家舍
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前文回顾

  • 实现一个简单的Database系列

译注:cstack在github维护了一个简单的、类似sqlite的数据库实现,通过这个简单的项目,可以很好的理解数据库是如何运行的。本文是第十篇,主要是实现B-tree中叶子节点分裂

Part 10 叶子节点分裂

我们 B-Tree 只有一个节点,这看起来不太像一棵标准的 tree。为了解决这个问题,需要一些代码来实现分裂叶子节点。在那之后,需要创建一个内部节点,使其成为两个新的叶子节点的父节点。

基本上,我们这个系列的文章的目标是从这里开始的:

one-node btree

one-node btree

到这样:

two-level btree

two-level btree

首先中的首先,先把处理节点写满错误移除掉:

void leaf_node_insert(Cursor* cursor, uint32_t key, Row* value) {
  void* node = get_page(cursor->table->pager, cursor->page_num);

  uint32_t num_cells = *leaf_node_num_cells(node);
  if (num_cells >= LEAF_NODE_MAX_CELLS) {
    // Node full
-    printf("Need to implement splitting a leaf node.\n");
-    exit(EXIT_FAILURE);
+    leaf_node_split_and_insert(cursor, key, value);
+    return;
  }
ExecuteResult execute_insert(Statement* statement, Table* table) {
   void* node = get_page(table->pager, table->root_page_num);
   uint32_t num_cells = (*leaf_node_num_cells(node));
-  if (num_cells >= LEAF_NODE_MAX_CELLS) {
-    return EXECUTE_TABLE_FULL;
-  }

   Row* row_to_insert = &(statement->row_to_insert);
   uint32_t key_to_insert = row_to_insert->id;

分裂算法(Splitting Algorithm)

简单的部分结束了。以下是我们需要做的事情的描述(出自:SQLite Database System: Design and Implementation) 原文:If there is no space on the leaf node, we would split the existing entries residing there and the new one (being inserted) into two equal halves: lower and upper halves. (Keys on the upper half are strictly greater than those on the lower half.) We allocate a new leaf node, and move the upper half into the new node. 翻译:如果在叶子节点中已经没有空间,我们需要将驻留在节点中的现有条目和新条目(正在插入)分成相等的两半:低半部分和高半部分(在高半部分中的键要严格大于低半部分中的键)。我们分配一个新的节点,将高半部分的条目移到新的节点中。

现在来处理旧节点并创建一个新的节点:

+void leaf_node_split_and_insert(Cursor* cursor, uint32_t key, Row* value) {
+  /*
+  Create a new node and move half the cells over.
+  Insert the new value in one of the two nodes.
+  Update parent or create a new parent.
+  */
+
+  void* old_node = get_page(cursor->table->pager, cursor->page_num);
+  uint32_t new_page_num = get_unused_page_num(cursor->table->pager);
+  void* new_node = get_page(cursor->table->pager, new_page_num);
+  initialize_leaf_node(new_node);

接下来,拷贝节点中每一个单元格到新的位置:

+  /*
+  All existing keys plus new key should be divided
+  evenly between old (left) and new (right) nodes.
+  Starting from the right, move each key to correct position.
+  */
+  for (int32_t i = LEAF_NODE_MAX_CELLS; i >= 0; i--) {
+    void* destination_node;
+    if (i >= LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT) {
+      destination_node = new_node;
+    } else {
+      destination_node = old_node;
+    }
+    uint32_t index_within_node = i % LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT;
+    void* destination = leaf_node_cell(destination_node, index_within_node);
+
+    if (i == cursor->cell_num) {
+      serialize_row(value, destination);
+    } else if (i > cursor->cell_num) {
+      memcpy(destination, leaf_node_cell(old_node, i - 1), LEAF_NODE_CELL_SIZE);
+    } else {
+      memcpy(destination, leaf_node_cell(old_node, i), LEAF_NODE_CELL_SIZE);
+    }
+  }

更新节点中头部标记的单元格的数量(更新node’s header)

+  /* Update cell count on both leaf nodes */
+  *(leaf_node_num_cells(old_node)) = LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT;
+  *(leaf_node_num_cells(new_node)) = LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT;

然后我们需要更新节点的父节点。如果原始节点是一个根节点(root node),那么他就没有父节点。这种情况中,创建一个新的根节点来作为它的父节点。这里做另外一个存根(先不具体实现):

+  if (is_node_root(old_node)) {
+    return create_new_root(cursor->table, new_page_num);
+  } else {
+    printf("Need to implement updating parent after split\n");
+    exit(EXIT_FAILURE);
+  }
+}

分配新的页面(Allocating New Pages)

让我们回过头来定义一些函数和常量。当我们创建一个新的叶子节点,我们把它放进一个由get_unused_page_num()函数决定(返回)的页中。

+/*
+Until we start recycling free pages, new pages will always
+go onto the end of the database file
+*/
+uint32_t get_unused_page_num(Pager* pager) { return pager->num_pages; }

现在,我们假定在一个数据库中有N个数据页,页编码从 0 到 N-1 的页已经被分配。因此我们总是可以为一个新页分配页 N编码。在我们最终实现删除(数据)操作后,一些页可能会变成空页,并且他们的页编号可能没有被使用。为了更有效率,我们会回收这些空闲页。

叶子节点的大小(Leaf Node Sizes)

为了保持的树的平衡,我们在两个新的节点之间平等的分发单元格。如果一个叶子节点可以hold住 N 个单元格,那么在分裂期间我们需要分发 N + 1 个单元格在两个节点之间(N 个原有的单元格和一个新插入的单元格)。如果 N+1 是奇数,我比较随意地选择了左侧节点获取多的那个单元格。

+const uint32_t LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT = (LEAF_NODE_MAX_CELLS + 1) / 2;
+const uint32_t LEAF_NODE_LEFT_SPLIT_COUNT =
+    (LEAF_NODE_MAX_CELLS + 1) - LEAF_NODE_RIGHT_SPLIT_COUNT;

创建新根节点(Creating a New Root)

这里是“SQLite Database System”描述的创建一个新根节点的过程: 原文:Let N be the root node. First allocate two nodes, say L and R. Move lower half of N into L and the upper half into R. Now N is empty. Add 〈L, K,R〉 in N, where K is the max key in L. Page N remains the root. Note that the depth of the tree has increased by one, but the new tree remains height balanced without violating any B+-tree property. 翻译:设 N 为根节点。先分配两个节点,比如 L 和 R。移动 N 中低半部分的条目到 L 中,移动高半部分条目到 R 中。现在 N 已经空了。增加 〈L, K,R〉到 N 中,这里 K 是 L 中最大 key 。页 N 仍然是根节点。注意这时树的深度已经增加了一层,但是在没有违反任何 B-Tree 属性的情况下,新的树仍然保持了高度上平衡。

此时,我们已经分配了右子节点并移动高半部分的条目到这个子节点。我们的函数把这个右子节点作为输入,并且分配一个新的页面来存放左子节点。

+void create_new_root(Table* table, uint32_t right_child_page_num) {
+  /*
+  Handle splitting the root.
+  Old root copied to new page, becomes left child.
+  Address of right child passed in.
+  Re-initialize root page to contain the new root node.
+  New root node points to two children.
+  */
+
+  void* root = get_page(table->pager, table->root_page_num);
+  void* right_child = get_page(table->pager, right_child_page_num);
+  uint32_t left_child_page_num = get_unused_page_num(table->pager);
+  void* left_child = get_page(table->pager, left_child_page_num);

旧的根节点已经被拷贝到左子节点,所以我们可以重用根节点(无需重新分配):

+  /* Left child has data copied from old root */
+  memcpy(left_child, root, PAGE_SIZE);
+  set_node_root(left_child, false);

最后我们初始化根节点作为一个新的、有两个子节点的内部节点。

+  /* Root node is a new internal node with one key and two children */
+  initialize_internal_node(root);
+  set_node_root(root, true);
+  *internal_node_num_keys(root) = 1;
+  *internal_node_child(root, 0) = left_child_page_num;
+  uint32_t left_child_max_key = get_node_max_key(left_child);
+  *internal_node_key(root, 0) = left_child_max_key;
+  *internal_node_right_child(root) = right_child_page_num;
+}

内部节点格式(Internal Node Format)

现在我们终于创建了内部节点,我们就不得不定义它的布局了。它从通用 header 开始,然后是它包含的 key 的数量,接下来是它右边子节点的页号。内部节点的子节点指针始终比它的 key 的数量多一个。这个 子节点指针存储在 header 中。

+/*
+ * Internal Node Header Layout
+ */
+const uint32_t INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET = COMMON_NODE_HEADER_SIZE;
+const uint32_t INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_OFFSET =
+    INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET + INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE;
+const uint32_t INTERNAL_NODE_HEADER_SIZE = COMMON_NODE_HEADER_SIZE +
+                                           INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_SIZE +
+                                           INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_SIZE;

内部节点的 body 是一个单元格的数组,每个单元格包含一个子指针和一个 key 。每个 key 都必须是它的左边子节点中包含的最大 key 。

+/*
+ * Internal Node Body Layout
+ */
+const uint32_t INTERNAL_NODE_KEY_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE = sizeof(uint32_t);
+const uint32_t INTERNAL_NODE_CELL_SIZE =
+    INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE + INTERNAL_NODE_KEY_SIZE;

基于这些常量,下边是内部节点布局看上去的样子:

Our internal node format

Our internal node format

注意我们巨大的分支因子(也就是扇出)。因为每个子节点指针/键对儿(child pointer / key pair)太小了,我们可以在每个内部节点中容纳 510 个键和 511 个子指针(也就是每个内部节点可以有510个子节点)。这意味着我们从来不用在查找 key 时遍历树的很多层。

# internal node layersmax # leaf nodesSize of all leaf nodes
0511^0 = 14 KB
1511^1 = 512~2 MB
2511^2 = 261,121~1 GB
3511^3 = 133,432,831~550 GB

实际上,我们不能在每个叶子节点中存储满 4KB 的数据,这是因为存储 header 、 keys 的开销和空间的浪费。 但是我们可以通过从磁盘上加载 4 个 pages (树高四层,每层只需检索一页)来检索大约 500G 的数据。这就是为什么 B-Tree 对数据库来说是很有用的数据结构。

下边是读取和写入一个内部节点的方法:

+uint32_t* internal_node_num_keys(void* node) {
+  return node + INTERNAL_NODE_NUM_KEYS_OFFSET;
+}
+
+uint32_t* internal_node_right_child(void* node) {
+  return node + INTERNAL_NODE_RIGHT_CHILD_OFFSET;
+}
+
+uint32_t* internal_node_cell(void* node, uint32_t cell_num) {
+  return node + INTERNAL_NODE_HEADER_SIZE + cell_num * INTERNAL_NODE_CELL_SIZE;
+}
+
+uint32_t* internal_node_child(void* node, uint32_t child_num) {
+  uint32_t num_keys = *internal_node_num_keys(node);
+  if (child_num > num_keys) {
+    printf("Tried to access child_num %d > num_keys %d\n", child_num, num_keys);
+    exit(EXIT_FAILURE);
+  } else if (child_num == num_keys) {
+    return internal_node_right_child(node);
+  } else {
+    return internal_node_cell(node, child_num);
+  }
+}
+
+uint32_t* internal_node_key(void* node, uint32_t key_num) {
+  return internal_node_cell(node, key_num) + INTERNAL_NODE_CHILD_SIZE;
+}

对于一个内部节点,最大 key 始终是其右键。对于一个叶子节点,最大 key 就是最大索引键。

+uint32_t get_node_max_key(void* node) {
+  switch (get_node_type(node)) {
+    case NODE_INTERNAL:
+      return *internal_node_key(node, *internal_node_num_keys(node) - 1);
+    case NODE_LEAF:
+      return *leaf_node_key(node, *leaf_node_num_cells(node) - 1);
+  }
+}

追踪根节点(Keeping Track of the Root)

我们终于在通用的节点 header 中使用了 is_root 字段。回调它是我们用它来决定怎样来分裂一个叶子节点:

    if (is_node_root(old_node)) {
        return create_new_root(cursor->table, new_page_num);
    } else {
        printf("Need to implement updating parent after split\n");
        exit(EXIT_FAILURE);
    }
}

下面是 getter & setter:

+bool is_node_root(void* node) {
+  uint8_t value = *((uint8_t*)(node + IS_ROOT_OFFSET));
+  return (bool)value;
+}
+
+void set_node_root(void* node, bool is_root) {
+  uint8_t value = is_root;
+  *((uint8_t*)(node + IS_ROOT_OFFSET)) = value;
+}

初始化这两种类型的节点(内部节点&叶子节点)应默认设置 is_root 为 false。

void initialize_leaf_node(void* node) {
  set_node_type(node, NODE_LEAF);
+  set_node_root(node, false);
  *leaf_node_num_cells(node) = 0;
}

+void initialize_internal_node(void* node) {
+  set_node_type(node, NODE_INTERNAL);
+  set_node_root(node, false);
+  *internal_node_num_keys(node) = 0;
+}

当创建表的第一个节点时我们需要设置 is_root 为 true 。

// New database file. Initialize page 0 as leaf node.
void* root_node = get_page(pager, 0);
initialize_leaf_node(root_node);
+    set_node_root(root_node, true);
}

return table;

打印树(Printing the Tree)

为了帮助我们可视化数据库的状态,我们应该更新我们的 .btree 元命令以打印多级树。

我要替换当前的 print_leaf_node() 函数:

-void print_leaf_node(void* node) {
-  uint32_t num_cells = *leaf_node_num_cells(node);
-  printf("leaf (size %d)\n", num_cells);
-  for (uint32_t i = 0; i < num_cells; i++) {
-    uint32_t key = *leaf_node_key(node, i);
-    printf("  - %d : %d\n", i, key);
-  }
-}

实现一个递归函数,可以接受任何节点,然后打印它和它的子节点。它接受一个缩进级别作为参数,缩进级别每次在每次递归时会递增。我还在缩进中添加了一个很小的辅助函数。

+void indent(uint32_t level) {
+  for (uint32_t i = 0; i < level; i++) {
+    printf("  ");
+  }
+}
+
+void print_tree(Pager* pager, uint32_t page_num, uint32_t indentation_level) {
+  void* node = get_page(pager, page_num);
+  uint32_t num_keys, child;
+
+  switch (get_node_type(node)) {
+    case (NODE_LEAF):
+      num_keys = *leaf_node_num_cells(node);
+      indent(indentation_level);
+      printf("- leaf (size %d)\n", num_keys);
+      for (uint32_t i = 0; i < num_keys; i++) {
+        indent(indentation_level + 1);
+        printf("- %d\n", *leaf_node_key(node, i));
+      }
+      break;
+    case (NODE_INTERNAL):
+      num_keys = *internal_node_num_keys(node);
+      indent(indentation_level);
+      printf("- internal (size %d)\n", num_keys);
+      for (uint32_t i = 0; i < num_keys; i++) {
+        child = *internal_node_child(node, i);
+        print_tree(pager, child, indentation_level + 1);
+
+        indent(indentation_level + 1);
+        printf("- key %d\n", *internal_node_key(node, i));
+      }
+      child = *internal_node_right_child(node);
+      print_tree(pager, child, indentation_level + 1);
+      break;
+  }
+}

并更新对 print 函数的调用,传递缩进级别为零。

} else if (strcmp(input_buffer->buffer, ".btree") == 0) {
  printf("Tree:\n");
-    print_leaf_node(get_page(table->pager, 0));
+    print_tree(table->pager, 0, 0);
  return META_COMMAND_SUCCESS;

下面是一个对新的打印函数的测例

+  it 'allows printing out the structure of a 3-leaf-node btree' do
+    script = (1..14).map do |i|
+      "insert #{i} user#{i} person#{i}@example.com"
+    end
+    script << ".btree"
+    script << "insert 15 user15 person15@example.com"
+    script << ".exit"
+    result = run_script(script)
+
+    expect(result[14...(result.length)]).to match_array([
+      "db > Tree:",
+      "- internal (size 1)",
+      "  - leaf (size 7)",
+      "    - 1",
+      "    - 2",
+      "    - 3",
+      "    - 4",
+      "    - 5",
+      "    - 6",
+      "    - 7",
+      "  - key 7",
+      "  - leaf (size 7)",
+      "    - 8",
+      "    - 9",
+      "    - 10",
+      "    - 11",
+      "    - 12",
+      "    - 13",
+      "    - 14",
+      "db > Need to implement searching an internal node",
+    ])
+  end

新格式有点简化,所以我们需要更新现有的 .btree 测试:

"db > Executed.",
"db > Executed.",
"db > Tree:",
-      "leaf (size 3)",
-      "  - 0 : 1",
-      "  - 1 : 2",
-      "  - 2 : 3",
+      "- leaf (size 3)",
+      "  - 1",
+      "  - 2",
+      "  - 3",
"db > "
])
end

这是新测试本身的 .btree 输出:

Tree:
- internal (size 1)
  - leaf (size 7)
    - 1
    - 2
    - 3
    - 4
    - 5
    - 6
    - 7
  - key 7
  - leaf (size 7)
    - 8
    - 9
    - 10
    - 11
    - 12
    - 13
    - 14

在缩进最小的级别,我们看到根节点(一个内部节点)。它输出的 size 为 1 因为它有一个 key 。缩进一个级别,我们看到叶子节点,一个 key ,和一个叶子节点。根节点中的 key (7)是第一个左子节点中最大的 key 。每个大于7的 key 存放在第二个子节点中。

一个主要问题(A Major Problem)

如果你一直密切关注,你可能会注意到我们错过了一些大事。看看如果我们尝试插入额外一行会发生什么:

db > insert 15 user15 person15@example.com
Need to implement searching an internal node

哦吼!是谁写的TODO信息?(作者在故弄玄虚!明明是他自己在 table_find() 函数中把内部节点搜索的功能存根的!)

下次我们将通过在多级树上实现搜索来继续史诗般的 B 树传奇。

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向量与矩阵 导数和偏导数 特征值与特征向量 概率分布 期望方差 相关系数

文章目录向量与矩阵标量、向量、矩阵、张量向量范数和矩阵的范数导数和偏导数特征值和特征向量概率分布伯努利分布正态分布&#xff08;高斯分布&#xff09;指数分布期望、⽅差、协⽅差、相关系数期望方差协⽅差相关系数向量与矩阵 标量、向量、矩阵、张量 标量&#xff08;…

源码系列 之 ThreadLocal

简介 ThreadLocal的作用是做数据隔离&#xff0c;存储的变量只属于当前线程&#xff0c;相当于当前线程的局部变量&#xff0c;多线程环境下&#xff0c;不会被别的线程访问与修改。常用于存储线程私有成员变量、上下文&#xff0c;和用于同一线程&#xff0c;不同层级方法间传…

Jenkins 笔记

Jenkins brew install jenkins-lts brew services restart jenkins-lts brew services stop jenkins-lts b999ff5683464346b6d083f894968121 l 软件构建自动化 &#xff1a;配置完成后&#xff0c;CI系统会依照预先制定的时间表&#xff0c;或者针对某一特定事件&#xff0c;…

进阶C语言第三章-------《字符函数和内存函数》 完整思维导图+基本练习题+深入细节+通俗易懂+知识点+建议收藏

绪论 书接上回&#xff0c;通过进阶指针你已经了解到了更多种指针类型&#xff0c;他们的用法及使用之处相当的关阔需要不断的积累经验来使用&#xff0c;这里我毛遂自荐一下我的指针练习希望对你有帮助&#xff0c;本章是一些关于字符串的函数介绍和自己实现&#xff0c;总体来…

数据结构与算法基础-学习-11-线性表之链栈的初始化、判断非空、压栈、获取栈长度、弹栈、获取栈顶元素

一、个人理解链栈相较于顺序栈不存在上溢&#xff08;数据满&#xff09;的情况&#xff0c;除非内存不足&#xff0c;但存储密度会低于顺序栈&#xff0c;因为会多存一个指针域&#xff0c;其他逻辑和顺序表一致。总结如下&#xff1a;头指针指向栈顶。链栈没有头节点直接就是…

智慧校园应用系统建设方案

系统简介 建设“智慧校园”的核心是创新新形势下高校发展理念、推进高校建设转型、变革高校管理行为方式&#xff1b;建设“智慧校园”的目的是推进信息化进入高校、服务管理、惠及师生&#xff1b;建设“智慧”的目标是实现 “信息采集、数据整合、信息促管、信息育人、信息联…

linux之echo使用技巧

参考文章&#xff1a;linux基本功系列-echo命令实战一、echo 命令是什么&#xff1f;作用&#xff1a; echo命令能将指定文本显示在Linux命令行上&#xff0c;或者通过重定向符写入到指定的文件中。语 法&#xff1a;echo [-ne][字符串] / echo [–help][–version]补充说明&am…

VMware安装CentOS7

个人简介&#xff1a;云计算网络运维专业人员&#xff0c;了解运维知识&#xff0c;掌握TCP/IP协议&#xff0c;每天分享网络运维知识与技能。个人爱好: 编程&#xff0c;打篮球&#xff0c;计算机知识个人名言&#xff1a;海不辞水&#xff0c;故能成其大&#xff1b;山不辞石…