安装lammps及相关库的步骤网上很多，这里介绍在前期步骤准备好的情况下，如果in文件中包含反应力 场以及需要通过voronoi库计算应力，如何通过基于gpu架构的kokkos+openmp实现计算加速

基于GPU的kokkos加速安装

1. 安装lammps

下载lammps稳定版本安装包，在同目录下键入命令行：tar -xvzf lammpsxxx.tar.gz

2. 安装cmake

具体方法参照 ubuntu安装cmake_yuanzhoulvpi的博客-CSDN博客_ubuntu安装cmake
安装完成后cmake --version查看安装版本，which cmake 查看安装路径

3. cmake相关文件修改

在解压好的lammps目录下执行如下命令行：

mkdir build_kokkos_cuda 
cd build_kokkos_cuda 

修改 $/\mathrm{c}\mathrm{m}\mathrm{a}\mathrm{k}\mathrm{e}/\mathrm{p}\mathrm{r}\mathrm{e}\mathrm{s}\mathrm{e}\mathrm{t}\mathrm{s}$ 文件夹中的$\mathrm{b}\mathrm{a}\mathrm{s}\mathrm{i}\mathrm{c}.\mathrm{m}\mathrm{a}\mathrm{k}\mathrm{e}$文件，根据自己需要安装的 $\mathrm{p}\mathrm{a}\mathrm{c}\mathrm{k}\mathrm{a}\mathrm{g}\mathrm{e}$ 在文件中 进行修改，也可以不修改，后面在命令行中添加即可。将$\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{k}\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{s}-\mathrm{c}\mathrm{u}\mathrm{d}\mathrm{a}.\mathrm{c}\mathrm{m}\mathrm{a}\mathrm{k}\mathrm{e}$文件中带有 $\mathrm{A}\mathrm{R}\mathrm{C}\mathrm{H}\_\mathrm{G}\mathrm{P}\mathrm{U}\mathrm{A}\mathrm{R}\mathrm{C}\mathrm{H}$那一行删

4. cmake编译

在build_kokkos_cuda目录下进行编译，对于多核+gpu，
参考官方网址
3.7. Packages with extra build options — LAMMPS documentation，
编译需要设置如下变量：


其中HOSTARCH以及GPUARCH需要根据自己机器型号参考官网给出的表进行修改， 机器具体型号可参考官网：https://ark.intel.com/content/www/us/en/ark.html#@Processors

使用如下命令行设置上述相关变量：

cmake -C ../cmake/presets/basic.cmake -C ../cmake/presets/kokkos-cuda.cmake DKokkos_ENABLE_OPENMP=on -DKokkos_ARCH_SKX=on -DBUILD_OMP=on ../cmake

cmake -C ../cmake/presets/basic.cmake -C ../cmake/presets/kokkos-cuda.cmake DKokkos_ARCH_AMPERE86=on -DKokkos_ENABLE_CUDA=on -DCMAKE_CXX_COMPILER= ${HOME}/lammps/lib/kokkos/bin/nvcc_wrapper ../cmake 

注意这里的 $nvcc\_wrapper$ 需要写绝对路径，一般在安装好的$\mathrm{l}\mathrm{a}\mathrm{m}\mathrm{m}\mathrm{p}\mathrm{s}/\mathrm{l}\mathrm{i}\mathrm{b}/\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{k}\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{s}/\mathrm{b}\mathrm{i}\mathrm{n}$ 目录下变量设置完成后使用如下命令行进行编译，后面的20为编译时使用的核数：

cmake --build . -- -j20 

编译完成后会在 $\mathrm{b}\mathrm{u}\mathrm{i}\mathrm{l}\mathrm{d}\_\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{k}\mathrm{k}\mathrm{o}\mathrm{s}\_\mathrm{c}\mathrm{u}\mathrm{d}\mathrm{a}$ 目录下生成可执行文件 $\mathrm{l}\mathrm{m}\mathrm{p}$

5. 测试

使用 $lammps$ 自带的 $example$ 进行测试，找到 $/\mathrm{e}\mathrm{x}\mathrm{a}\mathrm{m}\mathrm{p}\mathrm{l}\mathrm{e}\mathrm{s}/\mathrm{r}\mathrm{e}\mathrm{a}\mathrm{x}\mathrm{f}\mathrm{f}$ 目录，将 $\mathrm{i}\mathrm{n}.\mathrm{r}\mathrm{e}\mathrm{a}\mathrm{x}\mathrm{f}\mathrm{f}.\mathrm{r}\mathrm{d}\mathrm{x}$ 文件 中的$\mathrm{p}\mathrm{a}\mathrm{i}\mathrm{r}\_\mathrm{s}\mathrm{t}\mathrm{y}\mathrm{l}\mathrm{e}$ 改成 $\mathrm{r}\mathrm{e}\mathrm{a}\mathrm{x}\mathrm{f}\mathrm{f}/\mathrm{k}\mathrm{k}$，在此目录下键入如下命令

mpirun -np 2 /home/groupc/lammps-new/lammps-3Nov2022/build_kokkos_cuda/lmp -k on g 1 sf kk -pk kokkos newton on neigh half -in in.reaxff.rdx