差异分析的结果各种热图,火山图,箱式图可视化作图教程

news2024/11/15 15:30:46

1. 基因表达的热图绘制

1.1 根据所有差异基因绘制基因表达的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV13m421g7wv/

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1.2 绘制top差异基因表达的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV1jZ42147KP/

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1.3 绘制感兴趣基因的聚类热图

视频教程: https://www.bilibili.com/video/BV1jZ42147KP/

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2. 差异分析结果的火山图绘制

2.1 高中低差异表达分类着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化,func_color_type参数值为categorical可绘制高中低差异表达分类着色的火山图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

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2.2 高中低差异表达渐变着色的火山图绘制

差异分析火山图可视化,func_color_type参数值为continuous可绘制高中低差异表达渐变着色的火山图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

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2.3 在火山图中标记出一组感兴趣的基因

差异分析火山图可视化,func_mark_target_genes参数的值为:hsa-miR-155-5p;hsa-miR-34a-5p;hsa-miR-122b-3p,可以在火山图把这三个miRNA的名字单独标记展示出来

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1DJ4m177oB/

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2.4 对多个差异分析结果文件批量绘制火山图

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV13E421P7zx/

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要批量绘制火山图的三个转录组差异分析结果文件列表

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批量绘制出的三个火山图:

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3. 一组感兴趣的基因的表达量展示和差异比较的可视化

3.1 一张图中绘制一组基因表达水平的箱式图

该节教程: https://www.bilibili.com/video/BV1tb421n7oX/

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3.2 对一组基因每个基因单独绘制一张箱式图

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3.3 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,手动输入一组基因

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV1tb421n7oX/

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3.4 一张图中绘制多个基因的试验vs对照的差异箱式图,提供一个基因列表文件

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV1oZ421M7sL/

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3.5单个基因的多类别的试验vs对照差异箱式图

该节教程:https://www.bilibili.com/video/BV15S411w7E8/

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