比较(四)利用python绘制平行坐标图

news2024/10/7 6:50:59

比较(四)利用python绘制平行坐标图

平行坐标图(Parallel coordinate plot)简介

1

平行坐标图可以显示多变量的数值数据,最适合用来同一时间比较许多变量,并表示它们之间的关系。缺点也很明显,

不同的轴线排列顺序可能会影响读者对数据的理解。

快速绘制

  1. 基于pandas

    import pandas
    import matplotlib.pyplot as plt
    import seaborn as sns
    from pandas.plotting import parallel_coordinates
     
    # 导入数据
    data = sns.load_dataset('iris')
     
    # 利用parallel_coordinates快速绘制
    parallel_coordinates(data, 'species', colormap=plt.get_cmap("Set2"))
    plt.show()
    

    2

  2. 基于plotly

    import plotly.express as px
    
    # 导入数据
    df = px.data.iris()
    
    # 利用parallel_coordinates快速绘制
    fig = px.parallel_coordinates(
        df, 
        color="species_id", 
        labels={"species_id": "Species","sepal_width": "Sepal Width", "sepal_length": "Sepal Length", "petal_width": "Petal Width", "petal_length": "Petal Length", },
        color_continuous_scale=px.colors.diverging.Tealrose,
        color_continuous_midpoint=2)
    
    # 隐藏色阶bar
    fig.update_layout(coloraxis_showscale=False)
    
    fig.show()
    

    3

绘制类平行坐标图

  1. 利用searbon绘制(点线图)

    import matplotlib.pyplot as plt
    import seaborn as sns
    import pandas as pd
    
    # 导入数据
    url = "https://raw.githubusercontent.com/jennybc/gapminder/master/data-raw/08_gap-every-five-years.tsv"
    df = pd.read_csv(url, sep='\t')
    
    # 计算各变量均值
    average_data = df.groupby('continent')[['gdpPercap', 'lifeExp', 'pop']].mean()
    
    # 各变量标准化处理
    normalized_data = (average_data - average_data.mean()) / average_data.std()
    
    # 绘制平行坐标图
    plt.figure(figsize=(8, 6))
    parallel_plot = sns.lineplot(data=normalized_data.transpose(),
                                 dashes=False,
                                 markers=True,
                                 markersize=8)
    
    # 标题
    plt.title('Parallel Plot \nAverage GDP, Life Expectancy, and Population by Continent')
    
    # 删除y轴刻度与标签
    plt.yticks([])
    
    # 图例
    plt.legend(title='Continent',
               bbox_to_anchor=(1, 1),
              )
    
    plt.show()
    

    4

  2. 利用matplotlib绘制(斜率图)

    import matplotlib.pyplot as plt
    import pandas as pd
    
    # 导入数据
    url = "https://raw.githubusercontent.com/jennybc/gapminder/master/data-raw/08_gap-every-five-years.tsv"
    df = pd.read_csv(url, sep='\t')
    
    def add_label(continent_name, year):
        '''
        添加文本标签
        '''
        # 计算y位置
        y_position = round(df[year][continent_name])
        
        # 计算x位置
        if year==1952:
            x_position = year - 1.2
        else:
            x_position = year + 0.12
        
        # 添加标签
        plt.text(x_position,
                 y_position,
                 f'{continent_name}, {y_position}',
                 fontsize=8,
                 color='black',
                )
        
        
    
    # 筛选1952~1957的数据
    years = [1952, 1957]
    df = df[df['year'].isin(years)]
    
    # 计算每个大陆每年的平均 GDP
    df = df.groupby(['continent', 'year'])['gdpPercap'].mean().unstack()
    
    # 人为改变一个值,使至少一个大陆在两个日期之间减少(方便对比下降数据)
    df.loc['Oceania',1957] = 8503
    
    # 初始化布局
    plt.figure(figsize=(6, 8))
    
    # 年份的y轴(1952、1957)
    plt.axvline(x=years[0], color='black', linestyle='--', linewidth=1) # 1952
    plt.axvline(x=years[1], color='black', linestyle='--', linewidth=1) # 1957
    
    # 添加y标签(BEFORE、AFTER)
    plt.text(1951, 11000, 'BEFORE', fontsize=12, color='black', fontweight='bold')
    plt.text(1957.1, 11000, 'AFTER', fontsize=12, color='black', fontweight='bold')
    
    # 绘制每个大陆的线
    for continent in df.index:
        
        # 计算1952、1957的gdp
        value_before = df[df.index==continent][years[0]][0]
        value_after = df[df.index==continent][years[1]][0]
        
        # 上升为绿色、下降为红色
        if value_before > value_after:
            color='red'
        else:
            color='green'
        
        # 添加线
        plt.plot(years, df.loc[continent], marker='o', label=continent, color=color)
    
    # 每年添加各大洲的标签
    for continent_name in df.index:
        for year in df.columns:
            add_label(continent_name, year)
    
    # 标题
    plt.title(f'Slope Chart: \nComparing GDP Per Capita between {years[0]} vs {years[1]}  \n\n\n') 
    
    # 删除y轴
    plt.yticks([])
    
    # 删除边框
    plt.box(False) 
    
    plt.show()
    

    5

总结

以上通过pandas的parallel_coordinates和plotly的parallel_coordinates快速绘制平行坐标图,并利用seaborn和matplotlib绘制类平行坐标图。

共勉~

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