知识分享 | SNP检测试剂盒开发注意事项及启衡星CDMO案例分享

news2024/11/7 1:41:31

、SNP检测方法

常规有阵列的杂交、qPCR和测序等多种方法,其中基于qPCR方法的SNP检测试剂盒因具有快速、简便的优势,已有大量检测试剂盒上市。如:人CYP2C9和VKORC1基因检测试剂盒、人类SLCO1B1和ApoE基因分型检测试剂盒、人ADRB1(1165G>C)基因多态性检测试剂盒等。

二、一款SNP检测试剂盒的诞生历程

1.需求调研;

2.设计和优化反应体系:

①筛选并初步确定目标靶点,设计引物探针;

②筛选合适的原料,如酶/mix、引物、探针等;

③持续优化引物探针;

3.试剂盒的验证:;

4.生产工艺开发;

5.临床实验和注册申请;

6.生产和上市。

三、研发/生产型企业的“痛”点:

一)研发团队构建

研发部门的运营成本高昂,往往占据公司总支出的显著比例。

(二)研发项目设计

1. 筛选并检测目标靶点,设计引物探针。

2. 在市场上筛选合适的原料供应商。

3. 持续优化引物探针。

大部分研发人员擅长产品设计和优化,但在原料配方上可能不够专业;而大部分原料供应商通常只关注原料性能,难以全面考虑试剂盒的整体设计。

(三)项目研发过程

生物学实验充满不确定性,与物理实验的可测量性不同,更像是开盲盒。研发项目可能因各种原因延期,而一旦启动,很难暂停或回头。

(四)研发项目转产

如果研发配方的兼容性不强,可能导致产品难以顺利转产,从而延误市场上市时间。

(五)产品生产环节

生产流程中的每个环节都至关重要,任何疏忽都可能导致整个生产链的失败。

四、启衡星CDMO案例

启衡星的研发团队既备上游原料的研发生产能力,同时可以根据自产原料的特性,针对性设计、优化引物探针。以启衡星受客户委托发开的一款多SNP位点检测试剂盒为例:

1.项目背景:

该试剂盒是通过对住院病人“多个位点的SNP分型进行检测”(探针法qPCR),综合评估某项疾病的风险,指导用药。甲方从成本角度出发,对产品开发进行外包。启衡星接手该项目前,由某试剂原料供应商为甲方提供解决方案,产品在客户端频繁出现质量投诉问题。

2.启衡星交付结果:

启衡星研发团队接到客户的项目委托后,重新评估技术路线,理顺研发思路并制定开发方案,经严格论证及实验优化验证,最终在技术参数上帮助客户实现了重大提升:

(1)检测灰度值由原来的10%左右降至2%以下

(2)扩增荧光增量由原来的“1-2”提升至“2.5-4.5”;

(3)杂合Ct值差值由原来的2.0降为0.5以下

(4)分型结果更加明确,判读更加准确。

基于启衡星在该款试剂盒探针设计及工艺优化上的努力,以及在ISO13485/ISO9001质量体系下工业化生产的分子诊断用酶的稳定供应,在客户方产品上市的2年多时间,产品稳定,并获得终端用户的一致认可。

部分数据分享:图1. 客户方原试剂盒体系下位点的野生型、突变型、杂合型样本的扩增曲线图

           图2.启衡星优化交付试剂盒体系下位点的野生型、突变型、杂合型样本的扩增曲线图

产品列表

启衡星项目开发需求登记表

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