蛋白质结构中pdb_strand_id和asym_id相互转化

news2024/12/21 19:37:08

pdb_strand_id：是历史上由 PDB 数据库定义的链标识符，用于区分同一PDB文件中不同的链（可以是多肽链或核酸链）。这是结构解析过程中最常见的链标识符。

asym_id：是 mmCIF 格式中使用的一个标识符，表示非对称单元的标识符。它通常表示结构中的一个独立的多肽或核酸链，并用于细致描述每个非对称单元的内容。

mmseqs2进行pdb蛋白质序列聚类分析结果中（mmseqs2进行pdb蛋白质序列聚类分析_mmseq2-CSDN博客），链的ID为pdb_strand_id，而 解析批量下载的mmCif复合体结构并保存为.pt格式文件（

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