生信名词|MOA|基因敲低与基因敲除|DMSO|MODZ|生信基础
MOA(Mechanisms Of Action,作用机理)
过去,在药物投入到临床使用之前,它的生物学机理往往未被研究透彻。如今,随着技术的发展,一种新药物的研制更多的是基于对疾病的生物学机理的理解。在这种情况下,科学家们希望能够鉴定与疾病相关的靶蛋白,并开发出能够调节该靶蛋白的药物,一种给定分子(药物)的生物学活性,就被称为Mechansim of Action,简称MoA。
药物MoA的测定方法:其中的一种方法是对人体细胞加以药物作用,然后从细胞的反馈与已知MoA的药物可以带来的反馈做相似性比较进行推断。比赛要求建立以细胞反馈(基因表达与细胞活性数据)为特征,MoA为标签的模型,从而对未知药物的MoA进行预测。
基因敲低(gene knockdown)/敲除(gene knockout)
基因敲低
是指在细胞或生物体中通过RNA干扰(RNAi)等方法降低目标基因表达水平,使其功能受到抑制。
基因敲除
则是通过基因组编辑技术等手段,将目标基因的DNA序列从细胞或生物体中彻底删除或失活,阻断其转录和翻译过程,使目标基因完全失去功能,同时还可获得与基因敲低不同的表型。
DMSO
一种溶剂,用于和药物处理的细胞做对照用,相当于对照组。
MODZ,中度Z加权平均算法,moderated-Z weighted averages algorithm
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