科研绘图系列:R语言扩展物种堆积图(Extended Stacked Barplot)

news2024/11/14 13:33:15

在这里插入图片描述

介绍

R语言的扩展物种堆积图是一种数据可视化工具,它不仅展示了物种的堆积结果,还整合了不同样本分组之间的差异性分析结果。这种图形表示方法能够直观地比较不同物种在各个分组中的显著性差异,为研究者提供了一种有效的数据解读方式。

加载R包

knitr::opts_chunk$set(warning = F, message = F)

library(tidyverse)
library(phyloseq)
library(ggtext)
library(reshape2)
library(RColorBrewer)
library(DESeq2)

导入数据

数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):

  • 百度网盘下载链接: https://pan.baidu.com/s/1BhLdOKxFVPVQdpXwchCKlw

  • 提取码: j7pp

load(

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