介绍
富集通路散点图(Enrichment Pathway Scatter Plot)是一种数据可视化工具,用于展示基因集富集分析(Gene Set Enrichment Analysis, GSEA)的结果。
横坐标是对应基因名称,纵坐标是通路名称,图中的点表示该基因在某个通路下的qvalue,可以简单理解为不同环境下的贡献大小。
加载R包
导入所需要的R包,在导入前需要用户自己安装。
library(readxl)
library(tidyverse)
library(reshape2)
# rm(list = ls())
options(stringsAsFactors = F)
options(future.globals.maxSize = 1000 * 1024^2)
导入数据
数据可从以下链接下载(画图所需要的所有数据):
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百度云盘链接: https://pan.baidu.com/