Cellpose是目前运用范围最广、效果最好的细胞分割模型,以下是安装方法。
3.1 安装cellpose
3.1.1 创建cellpose
打开Anaconda Navigator,如下图所示:
图3.1.1.1 Anaconda Navigator
依次点击 Environments、Create,在弹出的窗中,name输入cellpose, 选中python,点击Create。
图3.1.1.2 创建cellpose
3.1.2 安装cellpose
在应用中找到并打开Anaconda Prompt,如下图2.1.1所示:
图2.1.1 Anaconda Prompt
- 依次输入以下的命令行:
conda activate cellpose
python -m pip install cellpose[gui] -i Simple Index
如下图所示:
图2.1.2 输入命令行
- 运行Cellpose
输入以下的命令行
python -m cellpose
运行后,如下图所示:
图2.1.3 cellpose