Ubuntu中编译使用ANTs(医学图像配准)含github无法访问问题解决

news2024/11/23 13:51:50

目录

第一步、修改hosts文件

1.打开https://github.com.ipaddress.com/ 

2.打开https://fastly.net.ipaddress.com/github.global.ssl.fastly.net#ipinfo

3.打开hosts文件,并在文件末尾添加如下内容

 第二步、编译ANTs

1)首先安装git、cmake以及c++编译器

2)编译

3)配置bin目录,如果没有bin目录,就创建一个bin目录

4)配置环境变量

第三步、使用ANTs


第一步、修改hosts文件

1.打开https://github.com.ipaddress.com/ 

向下拉动,找到如下页面,记住IP地址

2.打开https://fastly.net.ipaddress.com/github.global.ssl.fastly.net#ipinfo

向下拉动,找到如下页面,记住IP地址

3.打开hosts文件,并在文件末尾添加如下内容

使用命令sudo nano /etc/hosts,如没有nano可用命令sudo apt install nano安装

140.82.112.3 github.com
151.101.1.6 github.global.ssl.fastly.net
151.101.65.6 github.global.ssl.fastly.net
151.101.129.6 github.global.ssl.fastly.net
151.101.193.6 github.global.ssl.fastly.net

ctrl + o 写入保存,enter 确认,ctrl + x 退出

网址最好用https打头,不要改为git打头

 第二步、编译ANTs

1)首先安装git、cmake以及c++编译器

sudo apt install git
sudo apt install cmake-curses-gui
sudo apt install build-essential

// 安装完之后进行更新
sudo apt update

2)编译

//这里文件保存在ANTs
git clone https://github.com/ANTsX/ANTs.git  //如果已经下载了ANTs文件,这一步可以忽略
mkdir antsbin        //跟ANTs在同一级目录
cd antsbin
ccmake ../ANTs       //配置ANTs,进入cmake界面,按下C键,等待加载完成再按下C键,G键
make -j 4          //编译,4是指定线程,如果Ubuntu编译过程出现卡退就降低并行线程数,2或1都行

3)配置bin目录,如果没有bin目录,就创建一个bin目录

mkdir bin     //在antsbin目录下创建bin
cp ./ANTS-build/Examples/* ./bin     //将ANTS-build/Examples下的文件复制到bin目录中
cp ./staging/bin/* ./bin          //将staging/bin下的文件复制到bin目录中
cp ../ANTs/Scripts/* ./bin       //将ANTs/Scripts下的文件复制到bin目录中

4)配置环境变量

cd ~       //回到主目录
nano ~/.bashrc      //使用nano编译,插入如下内容
export ANTSPATH=/home/.../antsbin/bin/      //注意这里添加你的antsbin/bin的根目录
export PATH="$ANTSPATH:$PATH"
source ~/.bashrc       //激活环境

第三步、使用ANTs

nano ~/.bashrc    //打开文件,在末尾添加如下内容
export PATH=$PATH:/home/.../ANTs/Scripts       //这里添加你的ANTs源文件文件下Scripts的根目录
// ctrl + o 写入保存,enter 确认,ctrl + x 退出
source ~/.bashrc

 配置好之后即可进行配准,输入如下命令

//这里我用常用的SyN进行示范
antsRegistrationSyN.sh -d 2 -f fixed.jpg -m moving.jpg -o output
//注意这里图片的路径要使用你的图片的具体路径

也可直接输入antsRegistrationSyN.sh查看具体使用说明

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/2044093.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

基于DVWA-Brute Force(LowMedium)的渗透测试

Brute force主要是通过爆破达到渗透目的&#xff1a; Low 查看源代码&#xff1a; <?phpif( isset( $_GET[ Login ] ) ) {// Get username$user $_GET[ username ];// Get password$pass $_GET[ password ];$pass md5( $pass );// Check the database$query "SE…

流量分析0.o

[陇剑杯 2021]签到 此时正在进行的可能是__________协议的网络攻击。&#xff08;如有字母请全部使用小写&#xff0c;填写样例&#xff1a;http、dns、ftp&#xff09;。得到的flag请使用NSSCTF{}格式提交。 过滤协议 例子:tcp&#xff0c;udp&#xff0c;arp&#xff0c;i…

基于SpringBoot和Leaflet的全国省会城市风景区分布分析实践

目录 前言 一、空间数据表的设计与实现 1、城市信息数据表 2、风景区信息表设计与实现 3、数据库查询应用 二、WebGIS程序设计与实现 1、使用select中转义字符的使用 2、Leaflet空间信息展示 三、省会城市风景区可视化成果展示 1、哈尔滨市风景区分析 2、南京市风景区…

【6大设计原则】依赖倒置原则:构建灵活软件架构的基石 - 通过代码实例深入解析

1.引言 1.1为什么要学习依赖倒置原则 在软件开发过程中&#xff0c;我们经常需要对代码进行修改和扩展。如果代码之间的耦合度过高&#xff0c;那么在进行修改或扩展时&#xff0c;可能会对其他部分的代码产生影响&#xff0c;甚至引发错误。这就要求我们在编写代码时&#xf…

TransFormer学习的一些重要链接

以下是自己在学习和掌握TransFormer中的一些重要链接: 1. 这篇讲解的我看的最明白和清楚&#xff0c;但是仍要结合代码来加深理解。Transformer模型详解&#xff08;图解最完整版&#xff09;https://zhuanlan.zhihu.com/p/338817680 2. 七月在线-TransFormer的文本分类http…

LabVIEW多协议智能流水线控制与监控系统

在自动化流水线系统&#xff0c;实现对流水线传送带、机械臂、报警系统、扫码机、喷码机等设备的高效控制和实时监控。该系统需要支持多种通信协议&#xff0c;包括UDP、串口、ModbusTCP、HTTP、以及MQTT协议&#xff0c;以确保各个设备间的无缝连接和数据交换。 系统架构与模…

1-安装Elasticsearch

支持一览表 | Elastic 未完待续

postgres.new:在浏览器中构建与AI协作的开源Postgres沙盒

每周跟踪AI热点新闻动向和震撼发展 想要探索生成式人工智能的前沿进展吗&#xff1f;订阅我们的简报&#xff0c;深入解析最新的技术突破、实际应用案例和未来的趋势。与全球数同行一同&#xff0c;从行业内部的深度分析和实用指南中受益。不要错过这个机会&#xff0c;成为AI领…

海量数据处理商用短链接生成器平台 - 16

第五十四章 DWM层数据处理-Flink异步IO提升性能 第1集 IP解析地理位置问题点和Flink异步IO介绍 简介&#xff1a; IP解析地理位置问题点和Flink异步IO介绍 Flink实时计算处理存在的问题 IP解析地理位置信息&#xff0c;查询是同步查询&#xff0c;存在阻塞&#xff0c;性能不…

Unity(2022.3.38LTS) - 旋转和方向

目录 一. 旋转 二. 方向 三. 总结 四. 扩展-万向锁 一. 旋转 在 Unity 中&#xff0c;物体的旋转可以通过欧拉角和四元数来表示和操作。 欧拉角&#xff1a; 由三个角度值&#xff08;通常表示为 x、y、z &#xff09;来定义旋转。直观易懂&#xff0c;但可能会出现万向…

楼宇控制与智能家居实训室解决方案

一、前言 随着物联网技术、大数据分析以及人工智能技术的不断进步&#xff0c;楼宇自动化和智能家居系统正逐渐改变我们的生活方式和工作方式。这些系统不仅可以提高建筑物的安全性和舒适度&#xff0c;还可以有效降低能耗并提升运营效率。例如&#xff0c;通过智能温控系统可…

无人机视角下的EasyCVR视频汇聚管理:构建全方位、智能化的AI视频监控网络

随着5G、AI、物联网&#xff08;IoT&#xff09;等技术的快速发展&#xff0c;万物互联的时代已经到来&#xff0c;视频技术作为信息传输和交互的重要手段&#xff0c;在多个领域展现出了巨大的应用潜力和价值。其中&#xff0c;EasyCVR视频汇聚平台与无人机结合的AI应用更是为…

快速开发知识付费软件的秘诀:敏捷开发与持续迭代

在竞争激烈的市场环境中&#xff0c;快速推出高质量的知识付费软件是抢占市场先机的关键。敏捷开发与持续迭代作为两种核心的软件开发方法&#xff0c;可以帮助开发团队在短时间内交付功能完善的产品&#xff0c;并通过不断优化来提升用户体验。本文将探讨如何利用敏捷开发与持…

OpenCV的编译(MinGW)

OpenCV的编译&#xff08;MinGW&#xff09; 一、下载opencv 在opencv的官网&#xff08;Releases - OpenCV&#xff09;下载我们需要的opencv的版本&#xff0c;以4.5.4版本为例&#xff1a; 之所以&#xff0c;使用这个4.5.4版本的编译&#xff0c;是因为我使用4.6.0版本的…

2024年8月15日(python管理MySQL数据库 mysql5.7读写分离 配置mycat)

一、pymysql管理数据库 1、搭建主mysql5.7 [rootmysql57 ~]# ls anaconda-ks.cfg mysql-5.7.44-linux-glibc2.12-x86_64.tar.gz [rootmysql57 ~]# tar -xf mysql-5.7.44-linux-glibc2.12-x86_64.tar.gz [rootmysql57 ~]# ls anaconda-ks.cfg mysql-5.7.44-linux-glibc2.12-x…

消息驱动Stream---基于SpringCloud

概要&#xff1a;实际开发中&#xff0c;服务与服务之间的通信经常会使用到消息中间件&#xff0c;而以往使用的一些消息中间件&#xff0c;比如RabbitMQ&#xff0c;该中间件和系统的耦合性非常高&#xff0c;如果我们要将RabbitMQ替换为Kafka&#xff0c;那么系统将会有较大的…

垃圾收集器G1ZGC详解

G1收集器(-XX:UseG1GC) G1 (Garbage-First)是一款面向服务器的垃圾收集器,主要针对配备多颗处理器及大容量内存的机器. 以极高概率满足GC停顿时间要求的同时,还具备高吞吐量性能特征. G1将Java堆划分为多个大小相等的独立区域&#xff08;Region&#xff09;&#xff0c;JVM目…

Python教程(十五):IO 编程

目录 专栏列表引言基础概念什么是IO&#xff1f; 同步IO vs 异步IO同步IO&#xff08;Synchronous IO&#xff09;异步IO&#xff08;Asynchronous IO&#xff09; Python中的IO标准IO标准输入和输出 文件IO文件操作的上下文管理器打开文件读取文件 高级文件操作读写二进制文件…

go注册到eureka微服务

// 注册到 Eureka&#xff0c;goeureka会自动30秒发送一次心跳 package mainimport ("fmt""github.com/SimonWang00/goeureka""github.com/gin-gonic/gin""github.com/robfig/cron/v3""time""wbGo/configs" )typ…

【C++小白到大牛】红黑树那些事儿

目录 前言&#xff1a; 一、红黑树的概念 二、红黑树的性质 三、红黑树结点的定义 四、红黑树的插入 情况一&#xff1a;u存在且为红 情况二&#xff1a;u不存在/u存在且为黑 小总结&#xff1a; 原码&#xff1a; 五、红黑树的检验 六、性能比较 前言&#xff1a; …