生物信息广泛涵盖基因组学、蛋白组学、系统生物学、表观遗传、非编码等前沿领域以及药物设 计、基因工程等应用领域。与传统的理论和实验学科不同,生物信息是一门数据科学,这就需要从业 者具备一定数据收集、管理、处理和分析的能力。在海量的组学数据面前,使用别人开发的软件及图 形界面操作往往不能解决工作中的问题,而简单的编程就可能解决问题,因而编程即成为一个生物信 息工作者的必备技能。本课程就是为生物信息初学者设计的编程研修班。选择 Python 作为生物信息的入门编程语言,是因为 Python 语言提供了从入门到高手的良好的学习曲线。Python 语言是至今为止最接近自然语言的编程语言,学过其它一些编程语言的学员甚至不 需要太多的训练就能读写其代码;模块化和面向对象的支持使得学员能不费力地从一个只能写几行代 码的操作员变成一个管理千行代码的程序员,同时书写良好可读性代码的编程习惯也会令其受益终 生;丰富的标准库和第三方包使得 Python 语言成为当前最好的“胶水语言”,把多方资源整合到一 起来解决工作中的问题。
谢剑波(教授):主讲专家来自重点高校及科研院所一线科研人员,长期从事生物数据分析与挖掘,基因测序等领域工作研究工作,以第一作者或通讯作者发表过多篇生物学一区、二区SCI高水平论文(如:Plant Cell、Plos genetics; New Phytologist; Journal of Experimental Botany等)。精通python语言等分析工具,具有丰富的科研及高通量测序数据分析与挖掘经验。
使用linux服务器环境学习python编程,不求内容的宽而泛。通过编程实例由浅入深,集中力量学习脚本编写 | |
专题一 Python生物信息经典案例解析与编程经验分享 |
|
专题二 Python语法与案例 |
|
专题三 Python语法与经典实例操作 |
|
专题四 Python语言数据处理技巧与经典实例操作 |
|
专题五 Python语言编写循环与经典实例操作 |
|
专题六 Python语言处理文件及论文写作技巧 |
|
专题七 Python 经典生物信息学数据处理实例 | 经典生物信息学数据操作实例巩固练习 (部分基因序列从数据库中的提取、基因注释信息的添加、基因启动子序列的提取、数据的排序、数据格式的转换、批量数据的操作。。。。。) |
专题八 复习与答疑 | 1.课程复习与总结(知识点梳理) 2.实例回顾、训练、巩固。 |
原文链接https://mp.weixin.qq.com/s?__biz=MzUyNzczMTI4Mg==&mid=2247662443&idx=6&sn=624035228fe0b2cca970dccbcbb90db1&chksm=fa772456cd00ad403d55f4d3b17840ff838aa741736409077be4862ad76f1a20e62c93348cf5&token=2114381068&lang=zh_CN&scene=21#wechat_redirect