TSR勾画学习

news2025/1/23 9:32:20
1:勾画建议

文献:Scoring the tumor-stroma ratio in colon cancer: procedure and recommendations

主要讲述的是结肠癌(CRC)的勾画建议和流程。

1,切片选择建议:

原发肿瘤的载玻片最具侵袭性的部分(即常规病理学中用于确定 T 状态的载玻片)

同一患者的多个载玻片,对基质百分比最高的切片进行评分,并作为TSR的最终估计。

2:组织病理学评分

通过常规显微镜分析来自4μm厚度的原发肿瘤的H&E染色组织切片。使用 × 2.5 或 × 5 镜头选择基质含量最高的区域。此后,使用× 10物镜选择该视觉部位内同时存在肿瘤和基质组织的区域。肿瘤细胞将存在于所选图像场的所有边界上。(显微镜视野面积计算:实际视野=视野数/物镜倍率;例如,视野数为20,则10×物镜就观看2mm视野范围,那么4倍物镜的视野大小是20/4=5mm,40倍是0.5mm。)

文献示例:a基质低 ,b基质高;c只有2侧有肿瘤,d只有三侧有肿瘤,不符合。

3:关于目镜

大多数使用的目镜直径范围为 18 至 22 毫米,视野面积范围为 2.54 至 3.80 m㎡。对于 TSR 评分,这并没有导致评分百分比出现任何重大差异。(TSR是一个百分比数据嘛)

4:关于视野

粘液性腺癌很难正确估计TSR(这个对于消化道肿瘤较难)

文献示例:a 粘液性结肠 (对于粘液性结肠癌,粘液忽略评分) , b 炎性浸润

c 坏死组织, d 平滑肌组织,这两个不符合评分标准,不应考虑评分。

建议汇总表:

困难

建议

粘液性肿瘤

评分时应忽略粘液

炎性细胞浸润

炎症细胞浸润不是排除标准,可以包含在评分中。

坏死组织

坏死组织应排除在显微视野之外。如果无法做到这一点,则必须忽略坏死部分进行评分

平滑肌组织

平滑肌组织不应被考虑评分。如果无法选择没有平滑肌组织的合适区域(例如,在 II 期肿瘤中),则应忽略该组织室进行评分。

结蛋白染色可能会有所帮助。

腺腔

评分时忽略腺体管腔区域

血管

小血管作为基质的一部分包括在内。应避免使用具有肌肉壁的大血管(> 3 层平滑肌细胞),否则忽略评分

肿瘤出芽细胞

出芽腺癌细胞应与周围基质分离,在有问题的病例中,可通过细胞角蛋白染色(推荐使用 AE1/AE3)突出显示。

透明化

基质的一部分,因此包括在评分中

a忽略评分区域:显微镜视野减去视觉上必须忽略的组织,设置为100%。基质百分比必须仅由实体(=肿瘤+重要基质区室)组织部分确定


2:勾画实践

文献:Proposal of an automated tumor‐stromal ratio assessment algorithm and a nomogram for prognosis in early‐stage invasive breast cancer

利用Qupath软件开发了一种基于肿瘤和基质组织识别的改进TSR评估算法。

(1)在上传TMAs的数字图像(.scn文件)后,首先定义估计的染色载体,使苏木精和伊红颜色归一化;(2)使用“TMA derrayer”模块对TMA的磁芯进行适当的定向。然后,进行手动质量检查,以排除少数具有任何折叠、模糊或缺陷形态的岩心;(3)应用“简单组织检测”命令,准确检测各核心的组织。应用命令“SLIC超像素分割”、“添加强度特征”来生成“超像素”并计算相应的特征(表S1)。前面介绍了这些命令中使用的特定设置。21应用命令“添加平滑羽毛”,在半径50 μm处添加平滑物体特征,提高分类精度;(4)由经验丰富的研究者(LW Wang)使用QuPath的标注工具对具有代表性的训练区域进行相应的标注,包括肿瘤组织、基质组织和“其他”(空白、坏死、粘蛋白、炎症等);(5)对随机森林分类器进行算法训练,实现肿瘤组织及周围基质组织的最优分类;(6)然后将训练好的算法依次应用于所有TMA。使用TMA数据浏览器的数据输出提供了肿瘤组织和基质组织的面积(μm2) 分别在每个内核中。TSR 计算为 TSR = 基质面积/(肿瘤面积 + 基质面积)× 100%。每个试样的两个核心的较高基质比被认为是最终的TSR。

参考:

1:Scoring the tumor-stroma ratio in colon cancer: procedure and recommendations

2:Proposal of an automated tumor‐stromal ratio assessment algorithm and a nomogram for prognosis in early‐stage invasive breast cancer

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/1344084.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

golang 图片加水印,字体文件从哪里找

鼠标左键双击此电脑图标在此电脑文本框输入电脑默认字体地址:C:\Windows\Fonts找到需要用到的字体文件,复制到指定文件夹

jQuery-Validate验证插件的使用步骤【详解】

jQuery-Validate验证插件的使用步骤详解 1. 写在前面2. 效果展示3. Validate环境的搭建4. Validate基本方法的使用5. 实现错误消息的本地化6. 实现远程验证7. 自定义验证方法8. 验证表单完整版8.1 Html表单8.2 表单验证js逻辑8.3 表单验证css样式 1. 写在前面 我们知道&#x…

如何编译代码,把RustDesk主页面背景白色改成自己想要的图片

环境: RustDesk1.1.9自建服务器 问题描述: 如何编译代码,把RustDesk主页面背景白色改成自己想要的图片 解决方案: 详细方案,有需要私聊

鸿蒙OS应用开发之气泡提示

前面学习了弹窗提示,其实有时候只是想在旁边做一些说明,那么采用弹窗的方式就比较麻烦一些,这时可以采用系统里面的气泡提示方式。 系统也提供了几种方式弹出气泡提示,最简单的一种是采用bindPopup属性。它的定义如下: 在后面的参数设置里,也是比较复杂的形式。我们先来演…

Live800:客户体验策略是什么?企业如何制定客户体验策略?

客户体验策略是企业为了提升顾客对产品或服务的感知和满意度而采取的一系列措施和方法。它关注的是如何创造一个积极、愉悦和有价值的购买过程,从而建立长期的客户关系和忠诚度。客户体验策略是企业成功的关键之一,因为它能够帮助企业在竞争激烈的市场中…

【yolofastest上手】

一、前言 yolofastest网上资料比较少,也没有视频教学,所以想要使用参考了很多资料,只能说各资料都不尽全,让刚接触的小白无从下手。 参考资料: github地址 yolo-fastest 快速上手 修改参数遇到的问题 能在ARM-CPU上实时识别图像的…

Halcon颜色通道的处理decompose3/image_to_channels/channels _to _image

Halcon颜色通道的处理 文章目录 Halcon颜色通道的处理一. 图像的通道二. 访问通道1.访问通道2.获取通道的数量 三. 通道分离与合并1. decompose3算子2. image_to_channels 算子3. compose3算子4. channels_to_image算子 四. 处理RGB信息 由于彩色图像通常包含不止一个通道&…

广播信道的局域网

目录 一. 局域网的数据链路层二. 广播信道局域网三. 以太网标准四. CSMA/CD协议五. 以太网最短的帧六. 冲突解决方法-―退避算法 \quad 一. 局域网的数据链路层 \quad 局域网的特点 \quad 局域网的拓扑结构 \quad 局域网传输媒体 \quad \quad 媒体共享技术 \quad 二. 广播信道…

【前端面经】即时设计

目录 前言一面git 常见命令跨窗口通信vue 响应式原理发布订阅模式翻转二叉树Promise.all()扁平化数组面试官建议 二面Event Loop 原理Promise 相关css 描边方式requestAnimationReact 18 新特性JSX 相关react 输出两次函数式编程React 批处理机制http请求头有哪些本地存储性能优…

交叉编译aarch64架构支持openssl的curl、libcurl

本文档旨在指导读者在x86_64平台上交叉编译curl和openssl库以支持aarch64架构。在开始之前,请确保您的系统环境已正确配置。 1. 系统环境准备 系统是基于Ubuntu 20.04 LTS,高版本可能会有问题。首页,安装必要的开发工具和库文件。打开终端并…

[足式机器人]Part4 南科大高等机器人控制课 CH12 Robotic Motion Control

本文仅供学习使用 本文参考: B站:CLEAR_LAB 笔者带更新-运动学 课程主讲教师: Prof. Wei Zhang 课程链接 : https://www.wzhanglab.site/teaching/mee-5114-advanced-control-for-robotics/ 南科大高等机器人控制课 Ch12 Robotic …

C++:第十一讲DFS深搜

Everyday English Your optimal career is simply this: Share the real you with physical world through th e process of creative self-expression. 你的最佳职业很简单,就是这样:通过创造性自我表达的途径和世界分享真实的你。 前言 今天带着大家…

【音视频 ffmpeg 学习】 跑示例程序 持续更新中

环境准备 在上一篇文章 把mux.c 拷贝到main.c 中 使用 attribute(unused) 消除警告 __attribute__(unused)/** Copyright (c) 2003 Fabrice Bellard** Permission is hereby granted, free of charge, to any person obtaining a copy* of this software and associated docu…

scanf函数返回值被忽略

心怀希望的前进 前言 最近在复习c语言,发现了许多之前不了解的知识,今天想来与大家分享一下scanf返回值值被忽略的问题。 很多人应该都在vs中见到过,我们先说原因,再说改进方法 原因: scanf函数在读取数据时不会检…

kafka实现延迟消息

背景 我们知道消息中间件mq是支持延迟消息的发送功能的,但是kafka不支持这种直接的用法,所以我们需要独立实现这个功能,以下是在kafka中实现消息延时投递功能的一种方案 kafka实现延时消息 主要的思路是增加一个检测服务,这个检…

Python武器库开发-武器库篇之上传本地仓库到Git(三十八)

武器库篇之上传本地仓库到Git(三十八) 当我们在Git中创建远程仓库和进行了SSH key免密登陆之后,我们点击 Your respositories 可以查看我们所创建的远程仓库,如图所示: 如果我们需要将本地的仓库上传到Git,首先我们需要建立一个本…

数据结构与算法 - 查找

文章目录 第1关:实现折半查找第2关:实现散列查找 第1关:实现折半查找 代码如下: /*************************************************************date: April 2009copyright: Zhu EnDO NOT distribute this code. ***********…

Python实现的面部健康特征识别系统

Python实现的面部健康特征识别系统 引言1. 数据集获取与准备2. 模型训练3. Flask框架的应用4. 前台识别测试界面 结论与展望 引言 本文将介绍一个基于Python的面部健康特征判别系统,该系统利用互联网获取的公开数据集,分为健康、亚健康和不健康三个类别…

蓝牙曝底层安全漏洞,数十亿设备受影响

内容概括: Eurecom的研究人员近期分享了六种新型攻击方式,统称为"BLUFFS",这些攻击方式能够破坏蓝牙会话的保密性,使设备容易受到冒充和中间人攻击(MitM)。攻击发现者Daniele Antonioli解释道,"BLUFFS…

Sentinel-3如何处理并下载LST数据-陆地表面温度”(Land Surface Temperature)

LST 通常指的是“陆地表面温度”(Land Surface Temperature)。陆地表面温度是指地球表面上陆地部分的温度,而不包括水体表面。LST 是遥感技术中一个重要的参数,可以通过卫星遥感等手段进行测量和监测。 陆地表面温度对于许多领域…