plot画我可以设置坐标轴之类的，方便论文使用；scatter没设置成功。

一、plot画散点图

参考：matlab中二维散点图,MATLAB实例：二维散点图

自用代码
粉色色实心方块点

h3=figure('NumberTitle', 'off', 'Name', '验证');
set(h3,'Position',[600,100,400,250]);
x11=-390.307;
y11=406.395;
plot(x11, y11, 'rs',  'MarkerFaceColor','m','MarkerSize',100);
axis([-400 -380 400 415]);
set(gca,'xtick',(-400:2:-380),'ytick',(400:2:415));
set(gca,'FontName','Times New Roman','FontSize',10,'LineWidth',0.5); %设置坐标轴
xlabel('\fontsize{10}\fontname{Times new roman}x\fontname{宋体}轴\fontname{Times new roman}(mm) ');
ylabel('\fontsize{10}\fontname{Times new roman}y\fontname{宋体}轴\fontname{Times new roman}(mm)');

其中
plot(x11, y11, 'rs', 'MarkerFaceColor','m','MarkerSize',100);
'b.' 实心 蓝 圆（点）
'r^' 空心 红 上三角形
'ko' 空心 黑 圆
'rp' 空心 红 五角星
'rs'空心 红 正方形
 'MarkerFaceColor','m', 填充 粉红

二、scatter画散点图

Matlab中散点图绘制详细教程scatter函数（附matlab代码）
其实就是matlab按f1出来的 官方示例。而且还没有复制完整完整。
小记一下自己需要用到的部分，方便以后再次使用。
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自用代码
黑色实心方块点

a1=[-390.307,406.395];
x=-390.307;
y=406.395;
sz = 64;
c = linspace(1,10,length(x));
scatter(x,y,sz,'k','filled','s')

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其中，

scatter(x,y,sz,c)

scatter(x,y,sz,c) 指定圆颜色。要以相同的颜色绘制所有圆圈，请将 c 指定为颜色名称或 RGB 三元组。要使用不同的颜色，请将 c 指定为向量或由 RGB 三元组组成的三列矩阵。

sz:
以平方磅为单位的标记面积，指定为下列形式之一：

数值标量
 - 以相同的大小绘制所有标记。
行或列向量 - 使每个标记具有不同的大小。x、y 和 sz 中的相应元素确定每个标记的位置和面积。sz 的长度必须等于 x 和 y 的	长度。
- 使用 36 平方磅的默认面积。
标记面积的单位为平方磅。

1磅=0.3527 毫米
那1平方磅≈0.1244平方毫米

c:
标记颜色，指定为下列形式之一：

RGB 三元组或颜色名称 - 使用相同的颜色绘制所有标记。
由 RGB 三元组组成的三列矩阵 - 对每个标记使用不同的颜色。矩阵的每行为对应标记指定一种 RGB 三元组颜色。行数必须等于 x 和 y 的长度。
向量 - 对每个标记使用不同的颜色，并以线性方式将 c 中的值映射到当前颜色图中的颜色。c 的长度必须等于 x 和 y 的长度。要更改坐标区的颜色图，请使用 colormap 函数。
如果散点图中有三个点，并且您希望这些颜色成为颜色图的索引，请以三元素列向量的形式指定 c。
RGB 三元组是包含三个元素的行向量，其元素分别指定颜色中红、绿、蓝分量的强度。强度值必须位于 [0,1] 范围内，例如 [0.4 0.6 0.7]。此外，还可以按名称指定一些常见的颜色。下表列出长和短颜色名称选项以及对应的 RGB 三元组值。

c 颜色指令：

scatter(___,'filled')

填充圆形。可以将 'filled' 选项与前面语法中的任何输入参数组合一起使用。	

其实就是默认圆形的 填充的圆形点
任何形状（标记类型）加‘filled’就是实心，不加就是空心。

scatter(___,mkr)

指定标记类型。

三、matlab工具画散点图

参考：matlab散点图注释,MATLAB中散点图的绘制方法
时间问题我没有去尝试这个方法。