喜讯！Cancer Res（IF:11.2）发表胃癌PICH的转录调控机制

news2024/12/23 13:17:10

2023年8月30日，兰州大学第二医院焦作义教授团队在肿瘤学Top期刊Cancer Research（IF:11.2）发表“PICH activates Cyclin A1 transcription to drive S-phase progression and chemoresistance in gastric cancer”的研究论文。该研究鉴定了SNF2蛋白PICH作为5-FU化学敏感性的预测因子，并且评估了PICH的转录功能。PICH以ATP酶依赖的方式与Pol II和ATF4结合，形成一个转录复合物，促进Cyclin A1的表达，加速s期进展，并损害胃癌中5-FU的化学敏感性。爱基百客为其提供ChIP-seq的技术支持。

图：一个描述PICH介导的Cyclin A1转录潜在机制的模型

为了确定PICH的转录功能，作者在AGS细胞中对PICH进行了ChIP测序（ChIP-seq），鉴定出34021个启动子的高可信度峰（p<0.05）。PICH峰在TSS附近有480个高度富集，其中4.27%的峰富集在基因启动子区域。GO分析显示PICH结合的启动子主要富集在Pol II调控转录、有丝分裂姐妹染色单体粘合和细胞周期调控。这些结果表明，PICH可能在Pol II介导的细胞周期调节因子转录中发挥作用。基于HOMER分析和IGV可视化结果都表明了PICH在调控Cyclin A1转录中的潜在作用。