要搭建一个B2B2C跨境独立站后台管理的支付系统，您可以按照以下步骤进行开发：

1. 确定需求和功能：首先，您需要明确支付系统的功能和需求，包括接入第三方支付平台、实现支付功能、订单管理、退款管理、对账功能等。

2. 技术选型：根据您的需求，选择适合的支付系统开源软件。根据所选支付系统，了解其技术栈和开发文档。

 

3. 架构设计：根据支付系统的规模和预期的用户量，设计合理的架构。可以采用分布式架构，将不同的功能模块分别部署在不同的服务器上，提高系统的稳定性和扩展性。

4. 数据库设计：根据支付系统的需求，设计并创建相应的数据库表，包括订单表、支付记录表等。合理设计表结构和字段，确保数据的完整性和一致性。

5. 后台管理开发：根据需求和设计，进行后台管理系统的开发。实现支付功能、订单管理、退款管理等功能。

6. 接入第三方支付平台：根据所选支付系统，按照其开发文档进行接入。配置相应的API密钥，实现与第三方支付平台的交互。

7. 测试与优化：进行系统的测试和优化，确保支付系统的稳定性和性能。测试包括功能测试、性能测试、安全测试等。根据测试结果进行相应的优化和调整。

8. 上线与使用：将支付系统上线并投入使用。确保后台管理系统的安全性和可靠性，定期更新支付系统的版本和补丁。