ChimeraX - 修改 Multimer 中单链的显示颜色

news2025/2/23 23:06:26

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ChimeraX 软件是一款用于分子可视化和分析的先进工具,可以处理大型数据集,支持多种格式,提供丰富的功能和插件。ChimeraX 软件可以帮助科学家探索复杂的生物结构,如蛋白质、核酸、脂质和糖类,并进行交互式建模和仿真。ChimeraX 软件还可以制作高质量的图像和动画,以展示研究成果和发现。

软件版本:ChimeraX-1.5

1. 删除已加载的 PDB 文件

删除已加载的PDB文件,参考 ChimeraX - Command: delete

delete #[PDB No.]
# 参考
delete #1

2. 修改 Multimer 中单链的显示颜色

修改Multimer中单链的颜色,参考 ChimeraX - Command: color, rainbow

color #[PDB No.]/[Chain Name] [Color]
# 参考
color #1/A hot pink

点击 View 居中显示 PDB 的结构,修改链颜色的效果如下:

Color

颜色值参考:Coloring by Model, Chain, Residue, Element

ChimeraX 默认颜色顺序:

1. tan
2. sky blue 
3. plum
4. light green
5. salmon
6. light gray
7. deep pink
8. gold
9. dodger blue
10. purple

Color List

3. 存储透明图像

存储文件,顶栏 Home -> Save 按钮,勾选 Transparent background 选项,即可。

Transparent

修改背景颜色,顶栏 Home -> Background 模块 -> White or Black

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