CryoEM - 使用 3DMod (IMOD) 评估蛋白质三维结构的质量

news2024/12/23 6:23:52

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IMOD 官网:The IMOD Home Page

IMOD is a set of image processing, modeling and display programs used for tomographic reconstruction and for 3D reconstruction of EM serial sections and optical sections. The package contains tools for assembling and aligning data within multiple types and sizes of image stacks, viewing 3-D data from any orientation, and modeling and display of the image files.

IMOD 是一组图像处理、建模和显示程序,用于断层扫描重建和 EM 序列切片和光学切片的 3D 重建。 该软件包包含用于在多种类型和大小的图像堆栈中组装和对齐数据、从任何方向查看 3-D 数据以及建模和显示图像文件的工具。

下载路径:https://bio3d.colorado.edu/imod/download.html#Development

安装之后,在命令行中,输入 imod,即可启动。

加载 mrc 文件:
Load
或者直接输入 imod [your name].mrc,即可加载。

通过观察三维结构的截面,即可判断出重构质量的高低。

Compare

使用 Command + S,即可存储图像。
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