文章目录

• 一、组织切片配准
• • 1.1、研究现状
  • 1.2、网络模型（DeepSlice）
  • 1.3、（数据）前处理
  • • 1.3.1、（下载）Allen 数据集 —— 用于阶段一的模型训练
    • 1.3.2、（开发）基准数据集（GT） —— 用于模型验证
    • 1.3.3、（生成）合成数据集 + 随机数据集 —— 用于阶段二的增强训练
  • 1.3、（图像）后处理
  • • 1.3.1、角度集成 + 切割索引（论文核心）
    • 1.3.2、模型集成（预测更准确）
  • 1.4、配准效果
  • 1.5、适用范围
  • 1.6、QuickNII配准工具
  • 1.7、Allen 官方提供的训练集（下载教程）
• 二、Web应用程序（无需安装）
• 三、源码安装
• • 3.1、创建虚拟环境
  • 3.2、环境配置
  • 3.3、模型预测（输出三个角坐标，并保存为 QuickNII 兼容的 .json 或 .xml 文件）
  • 3.4、可视化配准结果
  • • 3.4.1、基于 QuickNII 工具可视化结果
    • 3.4.2、基于 Fiji - Merge 工具可视化结果
    • 3.4.3、基于 coordinate2image.py 可视化结果（自定义脚本文件）