【数据集】细胞数据集:肿瘤-胎儿重编程的内皮细胞驱动肝细胞癌中的免疫抑制性巨噬细胞(Sharma等人)

news2024/12/5 3:31:18

引用此数据集:

Sharma, Ankur (2020), “Onco-fetal reprogramming of endothelial cells drives  immunosuppressive macrophages in Hepatocellular Carcinoma (Sharma et al)”, Mendeley Data, V1, doi: 10.17632/6wmzcskt6k.1

下载地址:Onco-fetal reprogramming of endothelial cells drives immunosuppressive macrophages in Hepatocellular Carcinoma (Sharma et al) - Mendeley Data

数据集描述:

翻译:

描述
肝功能障碍与多种疾病相关,从代谢性疾病到肝细胞癌(HCC)。在这项研究中,我们利用单细胞RNA测序技术对人类肝脏的细胞景观进行了广泛的表征,涵盖了从发育到疾病的各个阶段。我们分析了约212,000个细胞,代表了人类胎儿肝脏、肝细胞癌和小鼠肝脏。我们的分析揭示了肿瘤微环境(TME)中的一种显著的胎儿样重编程。具体来说,肝细胞癌生态系统展现了类似胎儿发育的特征,包括胎儿相关内皮细胞(PLVAP+/VEGFR2+)和胎儿样肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)(FOLR2+)的重新出现。在跨物种的比较分析中,我们发现小鼠胚胎种子肝脏和FOLR2+肿瘤巨噬细胞之间基因表达和调控网络具有显著相似性。空间转录组学进一步证实了胎儿肝脏与肝细胞癌之间共享的肿瘤-胎儿生态系统。此外,基因调控分析、空间转录组学和体外功能检测揭示了VEGF和NOTCH信号通路在维持肿瘤-胎儿生态系统中的作用。综上所述,我们报告了人类胎儿肝脏和肝细胞癌之间共享的免疫抑制肿瘤-胎儿生态系统。我们的研究揭示了肿瘤生态系统中的一种前所未有的肿瘤-胎儿重编程,为肝细胞癌的治疗干预提供了新的靶点,也为识别其他癌症和疾病状态中类似的范式开辟了新的道路。

包含的数据文件如下:

每个文件中可以下载对应的h5格式的数据集。例如:


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