Nature 正刊丨空间蛋白质组学确定JAKi是一种致命皮肤病的治疗方法

news2024/10/21 23:09:04

01摘要

中毒性表皮坏死松解症(TEN)是一种由常见药物引发的致命药物性皮肤反应,是一个新出现的公共卫生问题1,2,3。TEN患者会因角质形成细胞死亡而发生严重和突然的表皮脱离。尽管已经提出了驱动角质形成细胞死亡的分子机制,但主要驱动因素仍然未知,TEN4,5,6没有有效的治疗方法。在这里,为了系统地绘制与TEN相关的分子变化并确定潜在的药物靶点,我们利用了深层视觉蛋白质组学,它提供了基于单细胞的细胞类型分辨率蛋白质组学7,8。我们分析了福尔马林固定、石蜡包埋的三种不同严重程度的皮肤药物反应的存档皮肤组织活检,并量化了角质形成细胞和皮肤浸润免疫细胞中的5000多种蛋白质。这揭示了TEN患者的免疫细胞和角质形成细胞室中I型和II型干扰素特征的显著富集,以及磷酸化STAT1的激活。泛JAK抑制剂托法替尼在体外的靶向抑制降低了角质形成细胞的细胞毒性。在两种不同的TEN小鼠模型中,体内口服托法替尼、baricitinib或JAK1特异性抑制剂abrocitinib或upadactinib可改善临床和组织学疾病严重程度。至关重要的是,使用JAK抑制剂(JAKi)治疗是安全的,并且与7名TEN患者的快速皮肤再上皮化和恢复有关。本研究揭示了JAK/STAT和干扰素信号通路是TEN的关键致病驱动因素,并证明了靶向JAKi作为治疗方法的潜力。

02图表简介

a、 上图为CADR中细胞类型分辨蛋白质组学的DVP工作流程示意图(n=21;DRESS、MPR和健康各5例,TEN各6例)。底部,每个步骤的代表性图像,包括从FFPE组织切片中切下的角质形成细胞(在最右侧的图像中以黄色标出)和免疫细胞(在极右侧图像中以红色标出)。部分由Biorender.com创建。AI,人工智能。mIF,多色免疫荧光;质谱;泛CK,泛细胞角蛋白。b、 不同队列角质形成细胞中鉴定的蛋白质数量。每组n=5人。c–e,主成分分析(c),PC1-PC2分离的主要驱动因素(载荷)(d)和PC1的基因集富集分析(e)(GSEA)(MSigDB Hallmark)。Adj.P,调整后的P值;EMT,上皮间质转化。f、 TEN和健康角质形成细胞中蛋白质的差异表达。彩色点表示显著的DEP,虚线垂直线表示log2转换的褶皱变化为±1。数字表示每个方向上DEP的总数。每组n=5人。g、 通过方差分析对重要蛋白质进行分层聚类。颜色表示归一化强度(z分数)。每组n=5人。h、 方差分析聚类1的过度代表性分析(反应组),按富集分数排序。颜色表示重要性程度。i、 在指定条件下,补体因子(和白蛋白以排除血液污染)的半监督热图。颜色表示归一化值(z分数)。每组n=5人。f、 未配对双侧t检验。g、 具有事后Tukey诚实显著差异(HSD)的单因素方差分析。e–h,多重比较的Benjamini-Hochberg校正(错误发现率(FDR)<0.05)。在方框图中,中心是介质,方框边缘描绘了第25至75百分位数,胡须延伸到1.5×四分位数间距内的最远点。

a、 主成分分析。每组n=5人。b、 PC1和PC3中存在的基因集富集得分散点图(MsigDB Hallmark,基因本体生物过程)。突出显示了包括“病毒”或“干扰素”在内的术语。RNS,活性氮物种;ROS,活性氧物种。c–e,健康和MPR(c)、TEN(d)或DRESS(e)免疫细胞之间的DEP。彩色点表示显著的DEP,垂直虚线表示log2转换的褶皱变化为±1。数字表示每个方向上DEP的总数。每组n=5人。f、 在不同队列中具有不同强度的选定蛋白质。g、 通过方差分析对重要蛋白质进行分层聚类。颜色表示归一化强度(z分数)。每组n=5人。h、 方差分析聚类1的过度代表性分析(反应组),按富集分数排序。MHC,主要组织相容性复合体。颜色表示重要性程度。c–e,未配对双侧t检验。g、 单因素方差分析与事后Tukey的HSD。b–e,g,h,多重比较的Benjamini-Hochberg校正(FDR<0.05)。

a、 左,TEN的免疫荧光图像,带有分段CD163+巨噬细胞、CD4+和CD8+T细胞。右,代表性单细胞图像和分割轮廓。Mϕ,巨噬细胞。比例尺,200μm。b、 c,所有样本中鉴定的蛋白质数量(b)及其强度(c),按细胞类型进行颜色编码。d、 按细胞类型分组的样本中干扰素途径蛋白的热图。颜色表示归一化强度(z分数)。e、 免疫细胞亚型的STAT1强度值。线路连接来自同一患者的测量值。f、 指定细胞类型之间的DEP。彩色点表示显著的DEP,虚线表示log2转换的褶皱变化为±1。数字表示每个方向上DEP的总数。g、 TEN样品的免疫荧光,其中含有来自分离(橙色;水疱顶部)和附着(蓝色;邻近水疱)区域的分段角质形成细胞。比例尺,200μm。h、 角质形成细胞中鉴定的蛋白质数量(左)和样本中的强度分布(右)。i、 通过方差分析对重要蛋白质进行半监督分层聚类,倍数变化大于1。颜色表示归一化强度(z分数)。视觉上不同的子聚类的边界用红色标出。j,k,主成分分析(j)和PC2和PC4的主要驱动因素(k)。l、 m,在分离细胞与附着细胞之间(l;k中突出显示)和不同队列之间(m)不同的感兴趣蛋白质。报警素以红色标记。b–d,n=12个巨噬细胞、10个CD4+细胞、10个CD8+细胞和来自n=12个受疾病影响和7个健康个体的9个健康样本。e、 f,n=10个个体中每种细胞类型的配对样本。h–m,n=7个附着样本,11个分离样本和9个健康样本,分别来自n=11个患病个体和7个健康个体。a、 g,对所有样本进行免疫荧光染色,显示代表性图像。f、 配对双侧t检验。i、 单因素方差分析与事后Tukey的HSD。f、 i,多重比较的Benjamini-Hochberg校正(FDR<0.05)。NS,不显著。

03 参考文献
Liu Y , Qin Z , Yang X ,et al.High-Voltage Manganese Oxide Cathode with Two-Electron Transfer Enabled by a Phosphate Proton Reservoir for Aqueous Zinc Batteries[J]. 2022.

关注公众号:工大博士科研日常分享
小编有话说:本文仅作科研人员学术交流,由于小编才疏学浅,不科学之处欢迎批评。如有其他问题请随时联系小编。欢迎关注,点赞,转发,欢迎互设白名单。投稿、荐稿:1395179267@qq.com

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/2220354.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

10.21 IO进程直接的通信

1、用消息队列实现两个进程直接的通信 先输入的代码 #include<myhead.h> //定义消息列队的结构体 struct msgbuf {long mtype; //消息类型char mtext[1024]; //消息正文 };//宏定义正文的大小 #define MSGSZ (sizeof(struct msgbuf) - sizeof(long))//定义回收僵尸信号…

Linux第一讲:Linux基本指令

Linux第一讲&#xff1a;Linux基本指令 1.Linux发展历史2.先快速了解一些指令3.指令 -- ls3.1知识点1 -- 文件属性3.1.1详细解析ls指令3.1.1.1 ls3.1.1.2 ls -l 、ls -a3.1.1.2.1 ls -l3.1.1.2.2 ls -a3.1.1.2.3 ls -la 3.1.1.3其它指令 3.2知识点2 -- 什么是.和..3.3知识点3 -…

手写模拟Spring的基本功能

文章目录 1. Spring的基本功能2. 容器启动 容器启动&#xff0c;即创建容器对象并赋予配置对象3. BeanDefinition扫描4. Bean的生命周期5. 单例Bean与多例Bean6. 依赖注入7. AOP8. Aware 回调9. 初始化10. BeanPostProcessor附录&#xff1a; 1. Spring的基本功能 2. 容器启动 …

【鸡翅Club】项目启动

一、项目背景 这是一个 C端的社区项目&#xff0c;有博客、交流&#xff0c;面试学习&#xff0c;练题等模块。 项目的背景主要是我们想要通过面试题的分类&#xff0c;难度&#xff0c;打标&#xff0c;来评估员工的技术能力。同时在我们公司招聘季的时候&#xff0c;极大的…

mingw64的Windows安装及配置教程gcc、g++等

mingw64.rar 链接&#xff1a;https://pan.baidu.com/s/18YrDRyi5NHtqnTwhJG6PuA 提取码&#xff1a;pbli &#xff08;免费永久有效&#xff0c;免安装&#xff0c;解压后配置环境变量即可使用&#xff09; 1 下载 解压后随便放到一个地方&#xff1a; 复制“bin”路径&am…

SpringCloudAlibaba[Nacos]注册配置中心注册与发现服务

Nacos的全称是Dynamic Naming and Configuration Service&#xff0c;Na为naming/nameServer即注册中心,co为configuration即注册中心&#xff0c;service是指该注册/配置中心都是以服务为核心。是阿里巴巴开源易于构建云原生应用的动态服务发现、配置管理和服务管理平台。 Nac…

安装vue发生异常:npm ERR! the command again as root/Administrator.

一、异常 npm ERR! The operation was rejected by your operating system. npm ERR! Its possible that the file was already in use (by a text editor or antivirus), npm ERR! or that you lack permissions to access it. npm ERR! npm ERR! If you believe this might b…

【LeetCode:910. 最小差值 II + 模拟 + 思维】

&#x1f680; 算法题 &#x1f680; &#x1f332; 算法刷题专栏 | 面试必备算法 | 面试高频算法 &#x1f340; &#x1f332; 越难的东西,越要努力坚持&#xff0c;因为它具有很高的价值&#xff0c;算法就是这样✨ &#x1f332; 作者简介&#xff1a;硕风和炜&#xff0c;…

html,css,js实现Upload 上传

实现效果&#xff1a; 代码实现&#xff1a; <!DOCTYPE html> <html lang"en"> <head><meta charset"UTF-8"><meta name"viewport" content"widthdevice-width, initial-scale1.0"><title>Docum…

基于Multisim的汽车尾灯控制电路设计与仿真

假设汽车尾部左右量测各有3个指示灯&#xff08;用发光二极管模拟&#xff09;1. 汽车正常运行时指示灯全灭&#xff1b;2.右转弯时&#xff0c;右侧3个指示灯按右循环顺序点亮&#xff1b;.3. 左转弯时&#xff0c;左侧3个指示灯按左循环顺序点亮&#xff1b;4.临时刹车时所有…

【C语言刷力扣】910.最小差值 ||

题目&#xff1a; 解题思路; 由于需要对数组中的每一个进行 k 或 -k 的操作&#xff0c;这时要求最小差值&#xff0c;即对较大的数 -k 对较小的数 k。 需要先对数组进行排序&#xff0c;再枚举对元素的操作。 对 nums[0] 到 nums[i - 1] 的数进行 k对 nums[i] 到 nums[numsS…

Java笔试05

在Java中&#xff0c;final 关键字可以用于修饰类、方法和变量&#xff1a; 修饰类&#xff1a; 被 final 修饰的类不能被继承&#xff0c;即不能有子类。这通常用于工具类或者不希望被扩展的类。 修饰方法&#xff1a; 被 final 修饰的方法不能被子类覆盖。这通常用于确保类…

Yolo目标检测:实时性与准确性的完美结合

在目标检测领域&#xff0c;Yolo&#xff08;You Only Look Once&#xff09;算法无疑是一颗璀璨的明星。自2016年由Joseph Redmon等人提出以来&#xff0c;Yolo凭借其出色的实时性和准确性&#xff0c;迅速在多个应用场景中崭露头角。本文将详细介绍Yolo目标检测的基本原理、优…

Qt学习笔记第21到30讲

第21讲 new/delete关键字 new关键字 在 C 中&#xff0c; new 关键字用于动态分配内存。它是 C 中处理动态内存分配的主要工具之一&#xff0c;允许在程序运行时根据需要分配内存。 用法 ①分配单个对象&#xff1a;使用 new 可以在堆上动态分配一个对象。例如&#xf…

面向对象进阶(上)(JAVA笔记第二十二期)

p.s.这是萌新自己自学总结的笔记&#xff0c;如果想学习得更透彻的话还是请去看大佬的讲解 目录 static修饰符静态变量静态方法 工具类工具类的使用例子第一题第二题 static注意事项继承关系建立继承关系的格式继承的好处及使用场景继承的特点继承体系的设计继承中类的三大要素…

JavaWeb 22.Node.js_简介和安装

有时候&#xff0c;后退原来是向前 —— 24.10.7 一、什么是Node.js Node.js 是一个于 Chrome V8 的 JavaScript 运行时环境&#xff0c;可以使 JavaScript 运行在服务器端。使用 Node.js&#xff0c;可以方便地开发服务器端应用程序&#xff0c;如 Web 应用、API、后端服务&a…

使用Three.js和Force-Directed Graph实现3D知识图谱可视化

先看样式&#xff1a; 在当今信息爆炸的时代&#xff0c;如何有效地组织和展示复杂的知识结构成为一个重要的挑战。3D知识图谱可视化是一种直观、交互性强的方式来呈现知识之间的关系。本文将详细介绍如何使用HTML、JavaScript、Three.js和Force-Directed Graph库来实现一个交互…

基于SpringBoot+Vue+uniapp微信小程序的社区门诊管理系统的详细设计和实现(源码+lw+部署文档+讲解等)

项目运行截图 技术框架 后端采用SpringBoot框架 Spring Boot 是一个用于快速开发基于 Spring 框架的应用程序的开源框架。它采用约定大于配置的理念&#xff0c;提供了一套默认的配置&#xff0c;让开发者可以更专注于业务逻辑而不是配置文件。Spring Boot 通过自动化配置和约…

解决:YOLOv8训练数据集时P、R、mAP等值均为0的问题

文章目录 问题解决1.匹配pytorch与cuda的版本2.使用 Adam 优化器3.加大训练轮数epoch4. 删除data/labels下的train.cache和val.cache 问题 使用YOLOv8训练自己的数据集时&#xff0c;出现P、R、mAP等值均为0的问题 Model summary (fused): 186 layers, 2,685,733 parameters, …

【 Git 】git push 出现报错 fatal: Could not read from remote repository.

git push 出现报错 fatal: Could not read from remote repository. 问题描述解决方案 问题描述 Connection closed by 198.18.0.xx port xx fatal: Could not read from remote repository.Please make sure you have the correct access rights and the repository exists.解…