文章目录
-
- 介绍
- 加载R包
- 导入数据
- 画图函数
- 火山图
- 输出结果
- 总结
介绍
火山图(Volcano Plot)是一种用于展示基因差异表达分析结果的二维散点图。它通过同时展示统计显著性和变化幅度,帮助研究者识别出在不同条件下显著差异表达的基因。火山图的横轴通常表示基因表达变化的倍数对数(log2 fold change),纵轴表示统计显著性的负对数值(-log10 p-value)。这种图表因其形状类似火山而得名。
火山图的构成和解读:
-
横轴(X轴):通常表示基因表达的变化倍数对数(log2 fold change)。数值越大,表示基因表达差异越大。正值表示上调表达,负值表示下调表达。例如,log2 fold change = 1 表示基因表达增加了两倍,而 log2 fold change = -1 表示基因表达减少了一半。
-
纵轴(Y轴):表示统计显著性的负对数值(-log10 p-value)。数值越大,表示基因表达变化的显著性越高。例如,如果 p-value = 0.01