随着人工智能技术的飞速发展,大语言模型 (LLMs) 凭借其强大的自然语言处理能力,在生命科学、海洋学、材料化学等科学研究中被广泛应用。虽然,LLMs 在分子特性预测、分子生成和实验方案设计等化学相关任务上表现良好,但在处理各种化学下游任务时表现欠佳。
究其原因,直接将化学知识集成到语言模型中,主要面临三大挑战: 首先,大多数化学信息和知识存储在结构化数据库中,直接使用这些数据训练 LLMs 可能会损害模型处理自然语言的能力,使得模型的对话和逻辑推理能力发生退化;其次,在化学信息学中,分子用特殊符号表示,如 SMILES。然而这类数据往往不符合自然语言的规范,因此常规的语言模型难以正确理解和生成这种符号;最后,化学数据和任务种类繁多,设计一个灵活并能泛化到多种化学任务上的训练流程十分困难。
针对于此,上海人工智能实验室发布了化学大语言模型 ChemLLM。ChemLLM 擅长通过流畅的对话交互执行化学学科的各种任务,在核心任务上的性能与 GPT-4 相当,并在一般场景中表现出了与类似规模的 LLM 相媲美的性能。 ChemLLM 为化学研究的探索开辟了新的道路,并且研究团队将结构化化学知识融入对话系统的方法,为开发各科学领域的 LLM 树立了新的标准。
相关研究以「ChemLLM: A Chemical Large Language Model」为题,已发表于 arXiv,成果已开源,并提供免费商用。目前 HyperAI超神经官网 (hyper.ai) 已上线「一键部署化学大模型 ChemLLM-7B-chat」,分步教程详见文末~
研究亮点:
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创建并开源大规模化学数据集 ChemData 以及 ChemPref-10K 的中英文版本数据集、C- MHChem 数据集、 ChemBench4K 化学能力评测基准数据集
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创建并开源包含 4,100 道选择题、9 项特定任务的大规模化学基准测试 ChemBench
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通过定量、定性的评估测试,ChemLLM 表现出良好的化学专业性和多功能性
论文地址:
https://arxiv.org/abs/2402.06852
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ChemData 化学任务数据集下载地址:
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ChemData 数据集: 涵盖 700 万条问答数据的大规模化学数据集
研究人员从众多在线资源库中收集了包括 PubChem、ChEMBL、ChEBI、ZINC 等在内的化学数据,并在此基础上创建了一个用于微调 ChemLLM 的大规模数据集 ChemData。
ChemData 数据集利用基于模板的指令构建方法,将结构化的化学数据转换为适合训练 LLM 的自然对话形式。该数据集包含 700 万条用于指令微调的问答数据,涵盖了广泛的化学领域知识,并且该问答数据类别与分子、反应和其他与化学相关的任务类别一致。
其中,与分子相关的任务包括名称转换 (Name Conversion)、Caption2Mol、Mol2Caption 和分子性质预测 (Molecular Property Prediction), 主要目的是调整语言模型对化学分子的感知。
与反应相关的任务涉及化学反应的各个方面, 包括逆合成 (Retrosynthesis)、产物预测 (Product Prediction)、产量预测 (Yield Prediction)、温度预测 (Temperature Prediction) 和溶剂预测 (Solvent Prediction)。除可明确分类的数据外,所有其他数据都归入特定类型的任务,从而增强 ChemLLM 对整个化学空间的理解。下图展示了这三类任务所包含数据分别占的比重。
ChemData 数据集构成占比
ChemLLM 模型架构:以 InternLM2-Base-7B 为基底,进行两个阶段的指令微调
化学大语言模型 ChemLLM 是在 InternLM2-Base-7B 模型训练基础上,通过两个阶段的指令微调方法训练得到的,不仅实现了多种化学能力,还保留了完整的自然语言能力。
如下图所示,在第一阶段,研究团队使用 Multi-Corpus(一个从 Hugging Face 收集的包含 170 万个问答对的综合语料库),提升了模型的通用语言能力,并将第一阶段获得的模型命名为 InternLM2-Chat-7B 。
ChemLLM 两个阶段的指令微调流程示意图
在第二阶段,研究团队使用 ChemData 和 Multi-Corpus 的混合数据集对模型进行微调,其中 ChemData 用于增强模型的化学知识,而 Multi-Corpus 用于保留模型的通用能力。经过两个阶段的指令微调训练,提高了 ChemLLM 在化学领域的通用性。
ChemBench 基准测试:减少语言模型输出风格对评估结果的影响
现有的化学大模型基准测试多以问答形式呈现,并使用 BLEU 和 ROUGE 作为评估标准。然而,这类评估容易受到语言模型输出风格的影响,不适合强调科学事实正确性的场景。
基于此,研究团队构建了与当前主流评估集 MMLU、C-Eval 相类似的化学基准测试 ChemBench。ChemBench 包括 9 项关于化学分子和反应的任务,并且与 ChemData 数据集中的任务相同。 除此之外,ChemBench 还包含 4,100 道选择题,每道题对应一个正确答案,旨在最大程度地减少语言模型输出风格对评估结果的影响。
值得一提的是,该基准测试已经在 OpenCompass 开源项目上线。下图展示了 ChemBench 基准测试 9 项任务的分布情况。
ChemBench 基准测试 9 项任务分布情况
研究结果:ChemLLM 模型化学专业能力与 GPT-4 相当,明显优于类似规模的一般 LLMs
研究团队从定量与定性两个维度,对化学大语言模型 ChemLLM 的性能进行评估。 定量评估包括化学能力和通用能力评估,定性评估主要通过与化学相关 NLP(自然语言处理)任务中的表现进行评估。
在化学能力评估中, ChemBench 作为评估核心化学能力的基准,通过 9 项不同任务测试该模型的专业性。如下图所示,ChemLLM 明显优于类似规模的一般大语言模型 (LLMs),全面超越了 GPT-3.5。与 InternLM2-Chat-7B 相比,ChemLLM 在化学方面的能力有了显著提高,说明第二阶段的化学能力训练具有显著效果。与 GPT-4 相比,ChemLLM 在 9 项任务中有 6 项得分比 GPT-4 高。
ChemLLM 化学性能评估得分
在通用能力评估中, 研究团队使用 MMLU、C-Eval、GSM8K、C-MHChem 4 个数据集对 ChemLLM 进行评估。其中,MMLU 是一个涵盖 STEM(科学、技术、工程和数学)、人文和社会科学等跨学科科目的基准测试,对跨学科知识进行广泛评估;C-Eval 是一个全面的中文基准测试,涵盖多个学科并分为 4 个难度等级;GSM8K 是一个用于测试语言模型数学能力的基准测试,要求通过 2-8 步的基本数学运算来解决问题;C-MHChem 是一个用于评估模型基本化学概念的数据集,主要涉及初高中化学测试。
如下图所示,在英文的 MMLU 和中文的 C-Eval 基准测试中,ChemLLM 的准确率分别为 65.6 和 64.1,说明它在更广泛的学科和多语言场景中表现出色。
在 GSM8K 数据集测试中,ChemLLM 的准确率达到 67.2,结果表明在化学数据上进行微调,在一定程度上增强了模型的推理能力。
在 C-MHChem 数据集测试中,ChemLLM 准确率为 76.4,超过了 GPT-4,展示了 ChemLLM 在中国初高中考试中的能力。
ChemLLM 通用性能评估得分
在定性评估中, 研究团队通过化学诗歌创作、文本提取、化学文献翻译、伦理回答等与化学相关的 NLP(自然语言处理) 任务对 ChemLLM 进行评估。结果显示,ChemLLM 在各种 NLP 任务中都能够对化学知识进行更深入地理解和创造性运用。下图列举了 ChemLLM 在部分 NLP 任务上的表现:
ChemLLM 化学诗歌创作
ChemLLM 化学信息提取
以上研究结果显示,ChemLLM 能够通过实时对话处理各种化学任务,其化学能力与 GPT-4 相当,并在其他领域表现出色。
目前,ChemLLM 已经完成新一轮升级,ChemLLM-1.5 接入 RAG 功能,不仅支持对化学文献进行深度挖掘和理解以及联网搜索,而且支持与 ChemLLM 直接对话探讨文章内容。 ChemLLM 的发展为科学领域的 LLMs 树立了先例,进一步加速了 AI 时代化学研究的进程。
HyperAI超神经官网 (hyper.ai) 已经上线了「一键部署化学大模型 ChemLLM-7B-chat」, 以下是分步教程与效果展示,快跟着小编一起探索吧~
一键部署化学大模型 ChemLLM-7B-chat
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效果预览
以药物研发中的伦理困境问题进行测试
参考资料:
1. https://mp.weixin.qq.com/s/C_aFYbzLlQySmTDarWWRkA
2. https://mp.weixin.qq.com/s/b9T9LxAkv4gnJMfBs2AW5Q