MATLAB和Python零模型社会生物生成式结构化图

news2024/11/15 12:19:41
🎯要点🎯要点
🎯启发式方法无标度和前馈拓扑的网络编码🎯随机遗传模型使用布线规则
🎯随机遗传算法测试连接组模型🎯确定性地生成分支树和分层网络,同质偏好规则的联系
🎯生成随机网络节点概率计算,以及网络中的相变🎯随机遗传编码模型生成网络连接和测量
📜结构化图用例📜结构化图用例
📜Python莫兰生死抑制放大进化图📜Python成像质谱流式细胞术病理生理学
📜Python种群邻接矩阵彗星风筝进化图算法📜Python和C++骨髓细胞进化解析数学模型
📜Python竞技比赛流体动力学艺术品和药物质量图学习📜Python元胞自动机沙堆糖景堵塞模型图学习
📜Python社群纽带关系谱和图神经

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🍇Python图度分布

在图论中,一个顶点的度是与其相连的边的数量。度分布是图中顶点度的概率分布。它是分析图的各种性质(例如其鲁棒性和连通性)的重要指标。度分布可用于各种现实场景,例如分析社交网络、了解互联网的结构以及研究生物网络。

考虑一下社交网络的情况,其中用户表示为顶点,他们的连接(友谊)表示为边。度分布可以帮助我们理解网络的结构,例如作为枢纽的高度连接的个人的存在,或孤立社区的存在。

在这种背景下,我们可以创建一个与度分布相关的技术问题:找到社交网络中最有影响力的用户。

给定一个表示社交网络的图 G(V, E),其中 V 是顶点(用户)的集合,E 是边(友谊)的集合,找出前 k 个最有影响力的用户,其中 k 是正整数。用户的影响力定义为图中表示用户的顶点的度。问题陈述与我们在社交网络分析中的现实场景直接相关。通过找到最有影响力的用户,我们可以确定拥有最多连接的用户,因此,他们更有可能在网络中传播信息或影响其他人。

为了解决这个问题,我们可以按照以下步骤操作:

  • 计算图中每个顶点的度数。
  • 根据顶点的度数按降序对顶点进行排序。
  • 选择度数最高的前 k 个顶点。

示例一:

首先,我们需要计算图中每个顶点的度数。我们可以使用邻接列表来表示图,然后通过计算每个顶点的邻居数量来计算度。

def calculate_degrees(graph):
    degrees = {}
    for vertex in graph:
        degrees[vertex] = len(graph[vertex])
    return degrees

接下来,我们需要根据顶点的度数按降序对顶点进行排序。

def sort_vertices_by_degree(degrees):
    return sorted(degrees.items(), key=lambda x: x[1], reverse=True)

最后,我们可以选择度数最高的前 k 个顶点。

def find_top_k_influential_users(sorted_degrees, k):
    return [vertex for vertex, degree in sorted_degrees[:k]]

最终:

def calculate_degrees(graph):
    degrees = {}
    for vertex in graph:
        degrees[vertex] = len(graph[vertex])
    return degrees

def sort_vertices_by_degree(degrees):
    return sorted(degrees.items(), key=lambda x: x[1], reverse=True)

def find_top_k_influential_users(sorted_degrees, k):
    return [vertex for vertex, degree in sorted_degrees[:k]]

graph = {
    'A': ['B', 'C', 'D'],
    'B': ['A', 'D'],
    'C': ['A', 'D', 'E'],
    'D': ['A', 'B', 'C', 'E'],
    'E': ['C', 'D']
}

degrees = calculate_degrees(graph)
sorted_degrees = sort_vertices_by_degree(degrees)
top_users = find_top_k_influential_users(sorted_degrees, 2)
print(top_users)  

在代码解决方案中,我们首先使用 calculate_degrees 函数计算图中每个顶点的度数。然后使用 sort_vertices_by_degree 函数根据顶点的度数对顶点进行排序。最后,我们使用 find_top_k_influential_users 函数找出最具影响力的前 k 个用户。

该解直观且易于理解,因为我们只需计算每个用户的连接数,根据计数对它们进行排序,然后选择前 k 个用户。

示例二:

我们还可以使用 NetworkX 库轻松绘制和可视化度分布。这是一个基于 Python 的库,用于进行图形分析。比如,使用它来可视化某处道路网络的度分布。

import networkx as nx
import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import collections as collec

G_road = nx.read_edgelist("/data/roadNet-CA", nodetype=int, comments='#', create_using=nx.DiGraph)

out_degrees = G_road.out_degree() 
out_values = sorted([d for n, d in out_degrees])
out_set = set(out_values)

out_hist = []
for x in out_set:
    cnt = out_values.count(x)
    for i in range(cnt):
        out_hist.append(cnt)

plt.figure(figsize=(12, 8))
plt.grid(True)
plt.loglog(out_values, out_hist, 'bv-')
plt.xlabel('Out Degree')
plt.ylabel('Number of nodes')
plt.title('Out-degree distribution (Log-Log) of RoadNet graph')
plt.show()

👉参阅、更新:计算思维 | 亚图跨际

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