FreeSurFer的recon-all处理流——学习记录

news2024/11/26 4:19:22

官方网址:ReconAllTableStableV6.0 - Free Surfer Wiki

(1)颅骨剥离skullstrip

颅骨剥离后生成文件:/mri/brainmask.mgz

(2)图像配准canorm

Freesurfer图像配准:将 mri/nu.mgz 体积与 FREESURFER_HOME/average 中的默认 GCA 图集对齐;

图像配准后生成文件:/mri/norm.mgz

(3)图像校正normalization2

Freesurfer图像校正:强度标准化(Intensity Normalization)

图像校正后生成文件:/mri/brain.mgz

(4)图像分割segmentation

Freesurfer图像分割:使用强度、邻域和平滑度约束进行白质分割(White Matter Segmentation)。输入为 mri/brain.mgz,输出为 mri/wm.mgz。

图像分割后生成文件:/mri/wm.mgz

本文来自互联网用户投稿,该文观点仅代表作者本人,不代表本站立场。本站仅提供信息存储空间服务,不拥有所有权,不承担相关法律责任。如若转载,请注明出处:http://www.coloradmin.cn/o/1803428.html

如若内容造成侵权/违法违规/事实不符,请联系多彩编程网进行投诉反馈,一经查实,立即删除!

相关文章

【旅行】关于毕业旅行与长期旅行计划(城市、攻略、预算、交通、面基等)

【旅行】关于毕业旅行与长期旅行计划(城市、攻略、预算、交通、面基等) 文章目录 一、目的地与去哪儿玩1、可能2、人民币3、国家地理4、省份与城市5、环球旅行 二、攻略之怎么玩(旅行预算、攻略)1、旅行预算之交通、住宿、门票等2…

QT Udp广播实现设备发现

测试环境 本文选用pc1作为客户端,pc2,以及一台虚拟机作为服务端。 pc1,pc2(客户端): 虚拟机(服务端): 客户端 原理:客户端通过发送广播消息信息到ip:255.255.255.255(QHostAddress::Broadcast),局域网…

Vue前端在线预览文件插件

Vue前端在线预览文件插件 一、使用场景 1.1.像文档资料等,只想让他人在线预览,但不能下载。此等场景需求可以用到此插件。 二、此文档介绍两种插件 1.view.xdocin插件 (上线后免费几天,然后收费,添加作者后,可以延…

数字孪生技术体系和核心能力整理

最近对数字孪生技术进行了跟踪调研学习,整理形成了调研成果,供大家参考。通过学习,发现数字孪生技术的构建过程其实就是数字孪生体的构建与应用过程,数字孪生体的构建是一个体系化的系统工程,数字化转型的最终形态应该就是数实融合互动互联的终极状态。数实融合是每个行业…

论文复现:Track to Detect and Segment: An Online Multi-Object Tracker

论文下载链接:链接 简单介绍:大多数在线多目标跟踪器在神经网络中独立执行目标检测,无需任何跟踪输入。在本文中提出了一种新的在线联合检测和跟踪模型TraDeS(TRAck to DEtect and Segment),利用跟踪线索…

【SpringCloud学习笔记】Docker(上篇)

Docker 1. 前置准备 在学习Docker之前我们需要具备以下环境: Linux云服务器 / 虚拟机安装并配置Docker环境(命令行中输入docker -v能够显示对应版本证明安装成功) 2. 快速入门 要求: 我们先来尝试使用Docker创建MySQL服务&am…

Linux CGroup资源限制(概念限制进程CPU使用)

Linux CGroup资源限制(详解) 最近客户认为我们程序占用cpu过高,希望我们限制,排查之后发现是因为程序频繁gc导致,为了精细化、灵活的的限制,想到了使用Linux CGroup。 0 前置知识 ①概念及作用 官网&#…

【python报错】TypeError: can only concatenate str (not “int“) to str

【Python报错】TypeError: can only concatenate str (not “int”) to str 在Python编程中,字符串连接是一种基本且频繁的操作。然而,如果你尝试将整数(int)与字符串(str)直接连接,会遇到TypeE…

从记忆到想象:探索AI的智能未来

引言 人工智能(AI)在信息处理、数据分析和任务自动化等方面展现了强大的能力。然而,在人类独有的记忆和想象力领域,AI仍然有很长的路要走。加利福尼亚大学戴维斯分校的心理学和神经科学教授查兰兰加纳特(Charan Ranga…

内存管理--4.用幻灯片讲解内存分配器Allocator

用幻灯片讲解内存分配器Allocators Allocators 内存分配器 提供内存分配策略的通用接口委托给 C 运行时:new / delete使用块内存池管理内存使用不同大小的块内存池管理内存 为什么用分配器? 将容器逻辑与内存分配策略解耦速度:内存分配速度慢确保…

【玩转C语言】第三讲---> scanf 和 printf 函数详解(非常重要)!

🔥博客主页🔥:【 坊钰_CSDN博客 】 欢迎各位点赞👍评论✍收藏⭐ 引言: 大家好,我是坊钰,为了让大家深入了解C语言,我开创了【玩转C语言系列】,将为大家介绍C语言相关知识…

【AI】你要的U-KAN来了

every blog every motto: You can do more than you think. https://blog.csdn.net/weixin_39190382?typeblog 0. 前言 U-KAN来了,快是真的快的,上个月才出的KAN,不得不说快。 先占个坑,有时间细看。 下面放上摘要 1. 正文 …

Bio-Info 每日一题:Rosalind-04-Rabbits and Recurrence Relations

🎉 进入生物信息学的世界,与Rosalind一起探索吧!🧬 Rosalind是一个在线平台,专为学习和实践生物信息学而设计。该平台提供了一系列循序渐进的编程挑战,帮助用户从基础到高级掌握生物信息学知识。无论你是初…

八、C语言:操作符详解

一、移位操作符 1.1左移操作 左边丢弃,右边补0 1.2右移操作 算数右移:右边丢弃,左边补原符号位 逻辑右移:右边丢弃,左边补0 int main() {int a -1;int b a >> 1;printf("b%d\n",b);return 0; } 原码…

Science刊发!乌普萨拉大学最新神经形态触觉人造皮肤可快速精准识别物体

当前,人形机器人使用的传统电子皮肤在处理触觉感知信息方面的能力并不强,尤其是在时间信息编码和快速特征提取方面存在一定的局限性。简单来说就是机器人无法完成在接触到物品的瞬间,判断用怎样的力度去对该物品做出反应。尽管多模态大模型和…

解决Android Studio Iguana版本不显示原创的GradleTask问题

问题描述: 下面是我的AndroidStudio版本号,升级后我发现项目里面自定义的gradletask找不到了??? 解决方案: 1、去setting里面把下面红框里面的选项勾选一下,缺点就是sync的时候会慢一些。 2、…

电子电气架构——车载诊断DTC一文通

我是穿拖鞋的汉子,魔都中坚持长期主义的汽车电子工程师。 老规矩,分享一段喜欢的文字,避免自己成为高知识低文化的工程师: 没有人关注你。也无需有人关注你。你必须承认自己的价值,你不能站在他人的角度来反对自己。人生在世,最怕的就是把别人的眼光当成自己生活的唯一标…

【python】OpenCV GUI——Mouse(14.1)

参考学习来自 文章目录 背景知识cv2.setMouseCallback 介绍小试牛刀 背景知识 GUI(Graphical User Interface,图形用户界面) 是一种允许用户通过图形元素(如窗口、图标、菜单和按钮)与电子设备进行交互的界面。与传统…

算法—字符串操作

394. 字符串解码 - 力扣&#xff08;LeetCode&#xff09; class Solution { public:string longestCommonPrefix(vector<string>& strs) { string retstrs[0];//***1***记得先要初始化ret&#xff0c;作为第一个比较值for(int i0;i<strs.size();i){retfoundcom…

03-07Java自动化之JAVA基础之循环

JAVA基础之循环 一、for循环 1.1for循环的含义 for&#xff08;初始化语句;条件判断;条件控制或–&#xff09;{ ​ //代码语句 } 1、首先执行初始话语句&#xff0c;给变量一个起始的值 2、条件判断进行判断&#xff0c;为true&#xff0c;执行循环体中的代码语句 ​ …