1.打开Amira安装目录下的数据Foam.am图片,打开之后选择“um”选项。
2. 添加一个2D和3D显示组件,即Ortho Slice和Volume Rendering,分别为2D显示和3D显示(模块左侧绿点控制是否显示):
颜色反转之后,可以显示内部颗粒物
3. 添加滤波器去噪模块Filter Sandbox:
右侧视图,选择Non-Local means类型,拖动蓝色框可控制滤波范围,这里明显看出框内可以更好地平滑掉噪声:
添加阈值分割模块:
由于分割对象出现粘连,需添加分离模块:
加入分析模块Label analysis:
设置相关参数,通过三维可视模块显示:
4.保存项目,打开文件选项进行保存,然后选择auto save。记住必须是英文路径,不能有中文。
一个最简单的Amira项目完成了,下一章会介绍如何建立Recipe,相当于封装成一个模块。