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YOLOv5与骨龄识别 YOLOv5(You Only Look Once version 5)是一种基于深度学习的实时目标检测模型,以其高效性和准确性著称。在骨龄识别场景下,YOLOv5可以被训练用来自动定位X光片中的手部或手腕骨骼结构,作为预处理步骤,以便后续进行骨龄分析。。
- YOLOv5训练阶段基于yolov5 release 7.0版本,Python 3.11.0和PyTorch
2.1.0.dev20230703, - 由于训练过程中需要float64,但Metal不支持float64,所以采用了CPU训练。我们使用了yolov5s的官方预训练权重。
骨龄识别 骨龄识别是一种利用医学影像评估个体生长发育阶段的技术,它通过对儿童或青少年的手腕或膝关节等部位的X射线图像进行分析,对比标准骨龄图谱来预测个体生理年龄。结合YOLOv5,首先对X光图像进行目标检测,准确标出手部关键骨骼结构,随后这部分区域会被送入专门设计的骨龄分类模型进行详细的骨龄分期判断。
yolov5阶段项目结构:
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图像数据:handbone/data/orignal_data/Image
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数据标签:handbone/data/orignal_data/Annotations
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标签类别:handbone/data/ImageSets/label_list.txt
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代码文件:
handbone/data/orignal_data/ImageSets/get_list.py:
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将数据集分为train、trainval以及val,并将对应文件名字存储于handbone/data/orignal_data/ImageSets中:train.txt,trainval.txt,val.txt
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handbone/data/create_label.py:将handbone/data/original_data中的数据集转换为适用于目标检测模型训练的标签文件和图像文件,并将文件保存在handbone/data/images和handbone/data/labels,
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并将三组数据集对应的文件路径保存在handbone/data/train.txt handbone/data/trainval.txt
handbone/data/val.txt -
使用yolo官方训练脚本进行模型的训练,训练好的权重保存在runs/train/exp/weights/best.pt。
使用resnet18进行骨龄预测: (handbone/data/arthrosis中有关于骨龄计算相关内容)
PyQt框架 PyQt是一个Python绑定的图形用户界面应用程序开发框架,基于Qt库构建。在骨龄识别系统中,PyQt可用于构建直观易用的桌面应用程序界面,实现如图像上传、显示、预处理、结果展示等功能。开发者可以通过PyQt编写前后端交互逻辑,使得医生或者其他用户能够方便地导入X光片,运行YOLOv5进行骨龄相关部位的检测,并在界面上实时显示检测结果和最终的骨龄分析报告。
数据集
- 中有九种关节类别分别为「DIP, DIPFirst, MCP, MCPFirst, MIP, PIP, PIPFirst, Radius,
Ulna」,每种类别有11个等级,根据性别来打分,根据分数推断骨龄
。
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handbone/arthrosis_data_util.py:使用自适应直方图均衡化(CLAHE)与随机旋转对图像进行增强处理。
handbone/arthrosis_datalist.py:将图像进行数据划分(9:1),同时将对应文件路径保存在每种类别的文件夹中 -
handbone/arthrosis_dataset.py:主要训练过程的dataloader,其中统一的输入数据的格式,并进行一定的数据增强
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handbone/arthrosis_trainer.py:模型训练的主程序,主要框架网络是resnet18,但将第一层的输入改为(1,244,244),输出改为对应类别数,并将每类最优模型保存在./params中
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handbone/common.py:提供了一些计算和处理手骨骨龄相关的功能,包括筛选手骨骨节、计算骨龄、生成报告等功能
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由于pytorch在训练过程中的loss函数出现了总线错误,我们将部分代码重新基于keras编写:keras_datasets.py,
keras_trainer.py, keras_common.py -
其他部分也是基于keras实现:
handbone/hand_bone_detect.py handbone/hand_view.py handbone/main.py
分类算法
骨龄分类算法是整个流程的关键部分,它用于对手部骨骼特征进行量化并映射到相应的骨龄阶段。在YOLOv5完成骨骼定位后,提取出的骨骼特征将输入至分类模型,可能是传统的统计学方法或者是深度学习模型,如卷积神经网络(CNN),来进行精细化的骨龄分期预测。
代码
#全部代码----》: qq1309399183
class MainWindow(QMainWindow, Ui_MainWindow):
def __init__(self):
super().__init__()
self.setupUi(self)
self.bind_slots()
# 加载yolov5模型(本地训练好的)
self.mode = torch.hub.load('./','custom',path='./runs/train/exp/weights/best.pt',source='local')
self.mode.eval()
self.mode.conf = 0.5 # 置信度
print("yolov5模型加载完成")
# Load other keras models
self.parm = {}
for key, value in keras_common.arthrosis.items():
if value[0] in self.parm:
continue
ResNet18, preprocess_input = Classifiers.get('resnet18')
base_model = ResNet18((224, 224, 1), weights=None, include_top=False)
model = Sequential()
model.add(base_model)
model.add(Flatten())
model.add(Dense(value[1]))
# Load weights
model.load_weights(f"params/{value[0]}")
self.parm[value[0]] = model
print("九个模型加载完成")
# 信号 槽(函数)
def btn_open_img(self):
print("点击按钮")
file_path = QFileDialog.getOpenFileNames(self, dir="handbone/data/images", filter="*.png;*.jpeg;*.jpg")
if file_path[0]:
# 选择图片
print(file_path[0][0])
# 回显手骨x光片
self.label_2.setPixmap(QPixmap(file_path[0][0]))
# 获取性别
sex = 'boy' if self.radioButton.isChecked() else 'girl'
print(sex)
# 侦测
result = hand_bone_detect.detect(self.mode, sex , file_path[0][0], self.parm)
# 显示检测结果
self.label_3.setText(result)
# 绑定槽
def bind_slots(self):
self.pushButton.clicked.connect(self.btn_open_img)
if __name__ == '__main__':
app = QApplication(sys.argv)
window = MainWindow()
window.show()
app.exec()
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