在软件开发团队中，确保团队成员的利益与项目进度保持一致，可以采取以下措施：

1. 建立基础流程：建立几个最主要的流程，如任务跟踪、开发效率提升、任务完成等，可以帮助小团队从无序逐步进入有序。

2. 关注员工反馈：培养成员的“闭环思维”，鼓励员工积极反馈、主动沟通，在充分锻炼自己、证明自己、成长的同时，拿到一个好的结果。

3. 建立透明信息系统：引入统一研发看板系统，使得每一个员工的任务都在看板上可见，增加沟通的带宽，透明呈现所有人信息。

4. 挑选技术能力强、工作年限长且有意愿担当中坚力量的组员，让其带领五至六人的小团队负责某一方面的具体工作。

总结来说，确保团队成员的利益与项目进度保持一致的关键在于明确职责、关注进度、关注员工反馈并提供支持和建议、培养闭环思维等方面。同时，根据团队实际情况进行调整和优化也是非常重要的。