全流程R语言Meta分析核心技术教程

news2024/11/24 10:58:47

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一,Meta分析的选题与检索

1、Meta分析的选题与文献检索
1)什么是Meta分析?
2)Meta分析的选题策略
3)精确检索策略,如何检索全、检索准
4)文献的管理与清洗,如何制定文献纳入排除标准
5)文献数据获取技巧,研究课题探索及科学问题的提出
6)文献计量分析CiteSpace、VOSViewer、R bibliometrix及研究热点分析

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二,Meta分析与R语言数据清洗与统计方法

2Meta分析的常用软件/R语言基础及统计学基础
1)R语言做Meta分析的优势及其《Nature》、《Science》经典案例应用
2)R语言基本操作与数据清洗方法
3)统计学基础和常用统计量计算(sd\se\CI)、三大检验(T检验、卡方检验和F检验)
4)传统统计学与Meta分析的异同
5)R语言Meta分析常用包及相关插件讲解从自编程计算到调用Meta包meta、metafor、dmetar、esc、metasens、metamisc、meta4diaggemtcrobvisnetmetabrms等),全程分析如何进行meta计算、meta诊断、贝叶斯meta、网状meta、亚组分析、meta回归及作图

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三,R语言Meta分析与作图

3R语言Meta效应值计算
1)R语言Meta分析的流程
2)各类meta效应值计算、自编程序和调用函数的对比
连续资料的lnRR、MD与SMD
分类资料的RR和OR
3)R语言meta包和metafor包的使用
4)如何用R基础包和ggplot2绘制漂亮的森林图

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四,R语言Meta回归分析

4R语言Meta分析与混合效应模型(分层模型)构建
1)Meta分析的权重计算
2)Meta分析中的固定效应、随机效应
3)如何对Meta模型进行统计检验和构建嵌套模型、分层模型、(混合效应)
4)Meta回归和普通回归、混合效应模型的对比及结果分析
5)使用Rbase和ggplot2绘制Meta回归图

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五,R语言Meta诊断分析

5R语言Meta诊断进阶
1)Meta诊断分析(t2、I2、H2、R2、Q、QE、QM等统计量)
2)异质性检验及发表偏移、漏斗图、雷达图、发表偏移统计检验
3)敏感性分析、留一法、增一法、Gosh图
4)风险分析、失安全系数计算
5)Meta模型比较和模型的可靠性评价
6)Bootstrap重采样方法评估模型的不确定性
7)如何使用多种方法文献中的SD、样本量等缺失值的处理

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六,R语言Meta分析的不确定性

6R语言Meta分析的不确定性
1)网状Meta分析
2)贝叶斯理论和蒙特拉罗马尔可夫链MCMC
3)如何使用MCMC优化普通回归模型和Meta模型参数
4)R语言贝叶斯工具Stan、JAGS和brms
5)贝叶斯Meta分析及不确定性分析

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七,机器学习在Meta分析中的应用

7机器学习在Meta分析中的应用
1)机器学习基础以及Meta机器学习的优势
2)Meta加权随机森林(MetaForest)的使用
3)使用Meta机器学习和传统机器学习对文献中的大数据训练与测试
4)如何判断Meta机器学习使用随机效应还是固定效应以及超参数的优化
5)使用Meta机器学习进行驱动因子分析、偏独立分析PDP

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