步骤
- 步骤一：在自己目录下创建R包安装路径
- 步骤二：配置用户本地的R库路径
- 步骤三：安装缺失的包（在终端）
- 步骤四：验证安装
步骤一：在自己目录下创建R包安装路径
mkdir -p ~/R_libs
步骤二：配置用户本地的R库路径
在家目录下，编辑（或新建）.Renviron文件：
vim ~/.Renviron
在文件内写入如下内容： R_LIBS_USER=~/R_libs，保存后退出。
步骤三：安装缺失的包（在终端）
在终端运行：
module add apps/R/4.3.2
module add compiler/gnu/8.3.0_fortran
R
进入R后，执行：
install.packages('mice', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lme4', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('lmerTest', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('piecewiseSEM', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('openxlsx', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('dplyr', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('ggplot2', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('DiagrammeR', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
install.packages('sjPlot', repos='http://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/CRAN')
步骤四：验证安装
退出R：
quit()
