这部分主要是数据获取,以及软件配置方法。

一、配套数据和代码

数据和代码目前在不断的更新,最新的教程可以私信,我通过后手动发送最新版的pdf和数据代码。发送的压缩包,有电子版的pdf和数据下载链接,里面是最新的百度网盘的地址,下载到本地即可。然后根据pdf教程,结合配套的数据和代码,跑通代码,修改代码,理解代码,进而理解流程,掌握流程。

二、安装软件

我们需要三个软件,分别是:

R语言4.3

plink1.9

git软件(windows系统需要,其它系统不需要)

1、R语言

下载地址: https://cran.r-project.org/bin/windows/base/

​2、plink软件

下载地址:plink: https://www.cog-genomics.org/plink/

3、git软件

下载地址: https://git-scm.com/downloads

4、Rstudio

下载链接: https://posit.co/download/rstudio-desktop/

获得配套数据和代码之后，按照以上安装软件。下一期介绍9套GWAS配套数据。