参考：
基于RNAfold预测RNA的二级结构（命令行版）-CSDN博客
https://blog.csdn.net/qq_36608036/article/details/124251189
TBI - ViennaRNA Package 2
https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/
编译vim8提示if_perl.xs:57:20: fatal error: EXTERN.h: No such file or directory-CSDN博客
https://blog.csdn.net/github_34777264/article/details/103781068
目录
- 安装
- 报错
- 没有g++
- 执行make时：EXTERN.h: No such file or directory
- 一些环境变量失效
安装
RNAfold是封装在ViennaRNA包中的，实际是安装ViennaRNA包。
首先去官网下载安装包，如果需要最新版本，直接在这里（https://www.tbi.univie.ac.at/RNA/）下载即可。
我需要老一些的版本（2.4.13），所以去github上选择对应版本：
https://github.com/ViennaRNA/ViennaRNA
如果无法访问github可以私信我要这个安装包（2.4.13，tar.gz格式）
将下载好的安装包放到服务器对应位置，按照官网的方式编译：
tar -zxvf ViennaRNA-x.x.x.tar.gz
cd ViennaRNA-x.x.0
./configure
make
sudo make install
需要注意的是，只有当出现下面的信息时才表示./configure正常结束了：
Install Directories
-------------------
* Executables : /usr/local/bin
....
(scripts) : /usr/local/lib/python3.8/site-packages
You can run 'make', 'make check' and 'make install' now!
安装成功后，检查一下：
(base) [root@localhost software]# RNAfold --version
RNAfold 2.4.13
(base) [root@localhost software]# whereis RNAfold
RNAfold: /usr/local/bin/RNAfold
报错
没有g++
configure的时候可能有这样的报错信息：
configure:5127: checking for g++
configure:5157: result: no
此时需要安装g++：
yum install -y gcc-c++
测试是否成功安装：
g++ -v
执行make时：EXTERN.h: No such file or directory
yum install perl-ExtUtils-Embed
一些环境变量失效
make install之后好像会重新设置环境变量，建议source ~/.bashrc。
